ANKRD1 (ankyrin repeat domain 1)

symbol:
ANKRD1
locus group:
protein-coding gene
location:
10q23.31
gene_family:
Ankyrin repeat domain containing
alias symbol:
C-193|ALRP|CARP|CVARP|MCARP
alias name:
None
entrez id:
27063
ensembl gene id:
ENSG00000148677
ucsc gene id:
uc001khe.2
refseq accession:
NM_014391
hgnc_id:
HGNC:15819
approved reserved:
2003-11-10
10q23.31
基因染色体位置图

ANKRD1(Ankyrin Repeat Domain 1)是一种编码含有锚蛋白重复序列的蛋白质的基因,属于肌节蛋白相关蛋白家族。ANKRD1主要在心脏和骨骼肌中表达,其蛋白产物通过与肌节蛋白(如肌联蛋白Titin)和其他结构蛋白相互作用,参与维持肌节的稳定性和力学信号传导。ANKRD1在心脏发育和功能中起关键作用,尤其在应对机械应力或病理刺激时调节心肌细胞的适应性反应。ANKRD1的突变或表达异常与多种心脏疾病相关,如扩张型心肌病(DCM)和肥厚型心肌病(HCM)。突变可能导致其与肌节蛋白的结合能力下降,破坏肌节结构,进而影响心脏收缩功能。ANKRD1还参与调控凋亡和炎症反应,其过表达可能抑制心肌细胞凋亡,但长期过表达可能引发病理性心肌肥厚;而表达降低可能导致肌节稳定性受损,加速心力衰竭进程。ANKRD1属于锚蛋白重复序列(ANKRD)基因家族,该家族成员均含有保守的锚蛋白重复序列(约33个氨基酸的重复单元),介导蛋白质间相互作用,广泛参与细胞信号转导、骨架组装和转录调控。ANKRD1与家族成员ANKRD2和CARP(心脏锚蛋白重复蛋白)功能相似,均在肌肉组织中调控应激反应和基因表达。目前ANKRD1的中文译名“锚蛋白重复域1”较为通用,但需注意其别名如“心脏锚蛋白重复蛋白”(CARP)在早期文献中可能混用。

The protein encoded by this gene is localized to the nucleus of endothelial cells and is induced by IL-1 and TNF-alpha stimulation. Studies in rat cardiomyocytes suggest that this gene functions as a transcription factor. Interactions between this protein and the sarcomeric proteins myopalladin and titin suggest that it may also be involved in the myofibrillar stretch-sensor system. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白质被定位到血管内皮细胞的细胞核,并且由IL-1和TNF-α刺激诱导的。在大鼠心肌细胞的研究表明,该基因的功能作为转录因子。此蛋白和肌节蛋白myopalladin和肌联蛋白之间的相互作用表明,它也可在肌原纤维拉伸传感器系统有关。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

ANKRD1基因的碱基序列:[NCBI]
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ANKRD1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs3939       rs1130407       rs3824739       rs3839929       rs4933200       rs5786929       rs7477890       rs10047267       rs10509614       rs10599853       rs10748555       rs10881851       rs10881852       rs10881853       rs10881854       rs10881855       rs11186362      

ANKRD1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGTGATGAGTATAAACGGACAG
58
AGCTTCCATTAACTTCTCCAC
58
AACATCAAGAACTGTGCTGG
59
GCTGTCGAATATTGCTTTGGT
60
AACATCAAGAACTGTGCTGG
59
GCTGTCGAATATTGCTTTGG
58
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
ANKRD1
NPPA
Repression
DDIT3
ANKRD1
Repression
TP53
ANKRD1
Unknown

ANKRD1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ANKRD1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000122
Q15327 (UniProtKB)
IEA
GO:0001085
Q15327 (UniProtKB)
IPI
GO:0001085
Q15327 (UniProtKB)
IPI
GO:0001085
Q15327 (UniProtKB)
IPI
GO:0001085
Q15327 (UniProtKB)
IPI
GO:0001085
Q15327 (UniProtKB)
IPI
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Q15327 (UniProtKB)
IPI
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Q15327 (UniProtKB)
IPI
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Q15327 (UniProtKB)
IPI
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Q15327 (UniProtKB)
IPI
GO:0001085
Q15327 (UniProtKB)
IPI
GO:0001085
Q15327 (UniProtKB)
IPI
GO:0001085
Q15327 (UniProtKB)
IPI
GO:0001085
Q15327 (UniProtKB)
IPI
GO:0001085
Q15327 (UniProtKB)
IPI
GO:0001105
Q15327 (UniProtKB)
IDA
GO:0002039
Q15327 (UniProtKB)
IPI
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Q15327 (UniProtKB)
IDA
GO:0003714
Q15327 (UniProtKB)
TAS
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Q15327 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q15327 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q15327 (UniProtKB)
IPI
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Q15327 (UniProtKB)
IDA
GO:0005634
Q15327 (UniProtKB)
IDA
GO:0005634
Q15327 (UniProtKB)
IDA
GO:0005634
Q15327 (UniProtKB)
IDA
GO:0005654
Q15327 (UniProtKB)
TAS
GO:0005667
Q15327 (UniProtKB)
IEA
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Q15327 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q15327 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q15327 (UniProtKB)
IDA
GO:0005829
Q15327 (UniProtKB)
IDA
GO:0010976
Q15327 (UniProtKB)
IEA
GO:0030017
Q15327 (UniProtKB)
IBA
GO:0031432
Q15327 (UniProtKB)
IPI
GO:0031674
Q15327 (UniProtKB)
ISS
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Q15327 (UniProtKB)
IEA
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Q15327 (UniProtKB)
IEA
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Q15327 (UniProtKB)
IMP
GO:0042692
Q15327 (UniProtKB)
IBA
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Q15327 (UniProtKB)
IPI
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Q15327 (UniProtKB)
IMP
GO:0043517
Q15327 (UniProtKB)
IDA
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Q15327 (UniProtKB)
NAS
GO:0045944
Q15327 (UniProtKB)
IEA
GO:0050714
Q15327 (UniProtKB)
IMP
GO:0055008
Q15327 (UniProtKB)
IMP
GO:0055008
Q15327 (UniProtKB)
IMP
GO:0070412
Q15327 (UniProtKB)
IPI
GO:0071222
Q15327 (UniProtKB)
IDA
GO:0071260
Q15327 (UniProtKB)
IDA
GO:0071347
Q15327 (UniProtKB)
IDA
GO:0071356
Q15327 (UniProtKB)
IDA
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Q15327 (UniProtKB)
IEA
GO:0071456
Q15327 (UniProtKB)
IEA
GO:0071560
Q15327 (UniProtKB)
IDA
GO:2000279
Q15327 (UniProtKB)
IMP

可能调控 ANKRD1基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Cardiomyopathies 0.120542884 2 2 BeFree_CLINVAR
Scimitar Syndrome 0.120271442 1 1 BeFree_UNIPROT
Endometriosis 0.12 1 0 CTD_human
Cardiomyopathy, Hypertrophic, Familial 0.12 0 1 CLINVAR
Cardiomegaly 0.08 1 0 RGD
Myocardial Reperfusion Injury 0.08 1 0 RGD
Cardiomyopathy, Dilated 0.00554839 3 0 BeFree_GAD
Hypertrophic Cardiomyopathy 0.005276948 3 0 BeFree_GAD
Heart failure 0.003181358 3 0 BeFree_GAD
Amyotrophic Lateral Sclerosis 0.00272435 1 0 LHGDN

联系方式

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山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

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