APCS (amyloid P component, serum)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
APCS
locus group:
protein-coding gene
location:
1q23.2
gene_family:
alias symbol:
SAP|PTX2|MGC88159
alias name:
pentraxin-related|9.5S alpha-1-gly…
entrez id:
325
ensembl gene id:
ENSG00000132703
ucsc gene id:
uc001ftv.4
refseq accession:
NM_001639
hgnc_id:
HGNC:584
approved reserved:
2001-06-22

基因染色体位置

基因染色体位置

1q23.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

APCS基因编码血清淀粉样蛋白P成分（Serum Amyloid P Component，SAP），属于五聚体蛋白家族（pentraxin family），该家族还包括C反应蛋白（CRP）等。五聚体蛋白的共同特点是能够形成五聚体结构，参与先天免疫反应，通过与病原体或凋亡细胞表面的配体结合来调节炎症和免疫应答。APCS主要在肝脏中表达，其产物SAP是一种稳定的血浆蛋白，能够结合多种配体，如淀粉样纤维、DNA、染色质和某些细菌多糖，从而参与清除凋亡细胞、调节炎症反应以及抑制纤维化过程。SAP在淀粉样变性病中尤为重要，因为它与淀粉样纤维结合并稳定这些异常沉积的蛋白，可能促进疾病进展。APCS基因突变较为罕见，但某些突变可能影响SAP的稳定性或功能，导致其对淀粉样沉积的调节异常，进而增加淀粉样变性的风险。此外，SAP在系统性红斑狼疮（SLE）等自身免疫疾病中也可能发挥作用，因为它能与核抗原结合，可能影响自身免疫反应。APCS过表达可能导致SAP水平升高，增强对淀粉样纤维的保护作用，但也可能加剧淀粉样沉积相关疾病；而APCS表达降低可能减少SAP的免疫调节功能，增加炎症或自身免疫疾病的风险。在淀粉样变性治疗中，针对SAP的药物（如miridesap）被开发用于清除SAP以促进淀粉样沉积的降解。APCS作为五聚体蛋白家族成员，与其他家族蛋白如CRP共享某些功能，但SAP更侧重于稳定淀粉样沉积和调节自身免疫反应，而CRP则更多参与急性炎症反应。

The protein encoded by this gene is a glycoprotein, belonging to the pentraxin family of proteins, which has a characteristic pentameric organization. These family members have considerable sequence homology which is thought to be the result of gene duplication. The binding of the encoded protein to proteins in the pathological amyloid cross-beta fold suggests its possible role as a chaperone. This protein is also thought to control the degradation of chromatin. It has been demonstrated that this protein binds to apoptotic cells at an early stage, which raises the possibility that it is involved in dealing with apoptotic cells in vivo. [provided by RefSeq, Sep 2008]

由该基因编码的蛋白质是一种糖蛋白，属于正五聚蛋白的蛋白质家族，其具有的特性的五聚体的组织。这些家族成员有被认为是基因复制的结果相当的序列同源性。所编码的蛋白质的蛋白质中的病理淀粉样蛋白交叉-β倍的结合暗示其作为分子伴侣可能发挥的作用。这种蛋白也被认为控制染色质的降解。已经证实，该蛋白结合凋亡细胞在早期阶段，这引起了它参与处理凋亡细胞在体内的可能性。 [由RefSeq的，2008年9月提供]

OMIM数据库中对APCS基因的介绍     Wikipedia数据库中对APCS基因的介绍

基因序列

基因序列

APCS基因的碱基序列：[NCBI]
Loading Gene Browser...

基因突变

基因突变

APCS基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2592882       rs2808646       rs2808655       rs2808661       rs2808662       rs3753867       rs3753868       rs3753869       rs3753870       rs3753871       rs6664910       rs6688409       rs6689429       rs10494327       rs10908736       rs10908737       rs11545897      

基因表达

基因表达

APCS基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGCTTTGGATCTCTGTCCT
58
CTTCCCACTGAGGTCTGTG
60
TTTGGATCTCTGTCCTCACC
59
CTTCCCACTGAGGTCTGTG
60
TTGGATCTCTGTCCTCACC
58
CTTCCCACTGAGGTCTGTG
60

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
TP53
APCS
Activation
15378026

基因本体信息

APCS基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

APCS基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0001849
P02743 (UniProtKB)
IDA
GO:0002674
P02743 (UniProtKB)
IC
GO:0005509
P02743 (UniProtKB)
IDA
GO:0005576
P02743 (UniProtKB)
NAS
GO:0005576
P02743 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
P02743 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
P02743 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
P02743 (UniProtKB)
TAS
GO:0005615
P02743 (UniProtKB)
IDA
GO:0005615
P02743 (UniProtKB)
IDA
GO:0005615
P02743 (UniProtKB)
IDA
GO:0005634
P02743 (UniProtKB)
IDA
GO:0006457
P02743 (UniProtKB)
TAS
GO:0006953
P02743 (UniProtKB)
TAS
GO:0030246
P02743 (UniProtKB)
IEA
GO:0044267
P02743 (UniProtKB)
TAS
GO:0044869
P02743 (UniProtKB)
IDA
GO:0044871
P02743 (UniProtKB)
IDA
GO:0045087
P02743 (UniProtKB)
IDA
GO:0045656
P02743 (UniProtKB)
IDA
GO:0046597
P02743 (UniProtKB)
IDA
GO:0046790
P02743 (UniProtKB)
IDA
GO:0048525
P02743 (UniProtKB)
IDA
GO:0051082
P02743 (UniProtKB)
TAS
GO:0051131
P02743 (UniProtKB)
TAS
GO:0061045
P02743 (UniProtKB)
IC
GO:0070062
P02743 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P02743 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P02743 (UniProtKB)
IDA
GO:0072562
P02743 (UniProtKB)
IDA
GO:1903016
P02743 (UniProtKB)
IDA
GO:1903019
P02743 (UniProtKB)
IDA
GO:0031012
P02743 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 APCS基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Coronary Artery Disease 0.121085767 5 0 BeFree_CTD_human
Liver carcinoma 0.120271442 2 0 BeFree_CTD_human
Heart failure 0.12 1 0 CTD_human
Liver neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
X-Linked Lymphoproliferative Disorder 0.012486326 46 0 BeFree
Atherosclerosis 0.007815732 3 0 GAD_LHGDN
Plaque, Amyloid 0.005428837 20 0 BeFree
Influenza 0.003267234 2 0 BeFree_LHGDN
Autoimmune Diseases 0.002995792 2 0 BeFree_LHGDN
Epstein-Barr Virus Infections 0.002985861 11 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号，实时查看信息，关注医学生物学动态。

版权所有 © 2025.Genelibs 济南弘晖生物技术有限公司 鲁ICP备13024435号-2