ARID3A (AT-rich interaction domain 3A)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
ARID3A
locus group:
protein-coding gene
location:
19p13.3
gene_family:
AT rich interactive domain containing
alias symbol:
BRIGHT
alias name:
None
entrez id:
1820
ensembl gene id:
ENSG00000116017
ucsc gene id:
uc002lql.4
refseq accession:
NM_005224
hgnc_id:
HGNC:3031
approved reserved:
1997-08-22

基因染色体位置

基因染色体位置

19p13.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

ARID3A（AT-rich interaction domain 3A）是一种属于ARID（AT-rich interaction domain）基因家族的转录因子，该家族成员均含有保守的ARID结构域，能够特异性识别并结合富含AT碱基的DNA序列，从而调控基因表达。ARID3A在胚胎发育、免疫系统功能及细胞增殖分化中发挥关键作用，尤其在B淋巴细胞发育过程中至关重要，它通过调控靶基因表达促进B细胞成熟。ARID3A的表达产物具有典型的转录因子特性，既能激活也能抑制下游基因，其功能受磷酸化等翻译后修饰调控。突变可能导致其DNA结合能力丧失或转录调控异常，与多种疾病相关，如系统性红斑狼疮（SLE）等自身免疫性疾病中常见ARID3A过表达，可能通过打破免疫耐受引发自身抗体产生。在B细胞淋巴瘤中，ARID3A的异常高表达可能促进细胞恶性增殖。降低ARID3A表达会损害B细胞发育，导致免疫缺陷，而过表达则可能扰乱正常细胞周期，诱发肿瘤发生。ARID3A还能与p53等抑癌蛋白相互作用，其表达失衡可能影响DNA损伤修复途径。ARID家族共包含15个成员，均通过ARID结构域参与染色质重塑和转录调控，但各成员在组织分布和功能上存在差异。例如ARID1A/B是SWI/SNF染色质重塑复合物的核心组分，而ARID3亚家族（ARID3A/B/C）更侧重发育调控。研究显示ARID3A与表观遗传修饰酶协同调控基因表达网络，其表达水平变化可能广泛影响细胞命运决定和免疫稳态。

This gene encodes a member of the ARID (AT-rich interaction domain) family of DNA binding proteins. It was found by homology to the Drosophila dead ringer gene, which is important for normal embryogenesis. Other ARID family members have roles in embryonic patterning, cell lineage gene regulation, cell cycle control, transcriptional regulation, and possibly in chromatin structure modification. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码的干旱中的一员（AT-丰富的互动域）家族DNA结合蛋白。它由同源性的果蝇酷似基因，这是正常的胚胎发育重要发现。其他干旱家族成员在胚胎图案形成，细胞谱系基因调控，细胞周期控制，转录调节作用，并有可能在染色质结构修饰。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对ARID3A基因的介绍     Wikipedia数据库中对ARID3A基因的介绍

基因序列

基因序列

ARID3A基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

ARID3A基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs168404       rs187048       rs349304       rs349305       rs349306       rs349307       rs349308       rs349309       rs349310       rs349311       rs349312       rs349313       rs349314       rs350136       rs350137       rs350138       rs350139      

基因表达

基因表达

ARID3A基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ACTCCAGCAGAACTTCCTG
59
TCAGGTTCACAGCAGAGTC
59
GCAGTTTAAGCAGCTCTACG
59
GTCATCCAGGAATTCCTTCCT
59
CACAGCGTGTTTCTCTGTG
60
ACGCATTTGCAGAAACCTG
60
TCATCAACAAGAAGCTGTGG
58
TTCATGTATTGGGTCCGCA
59
CACAGCGTGTTTCTCTGTG
60
GCATTTGCAGAAACCTGGA
59
CATGAGCATTCGGATCAACAG
59
TCAGGTTCACAGCAGAGTC
59
CAGTTTAAGCAGCTCTACGA
57
AGTCATCCAGGAATTCCTTCC
59
ATCAACAAGAAGCTGTGGC
58
CTTCATGTATTGGGTCCGC
58
GCAGTTTAAGCAGCTCTACG
59
GTCATCCAGGAATTCCTTCC
58
CACAGCGTGTTTCTCTGTG
60
CATTTGCAGAAACCTGGAGG
60

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
ARID3A
CDC6
Unknown
23659165
ARID3A
CDK1
Unknown
23659165
ARID3A
CR2
Unknown
19487031
ARID3A
E2F1
Unknown
23659165
ARID3A
PML
Activation
22010578
ARID3A
RBL1
Unknown
23659165

基因本体信息

ARID3A基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ARID3A基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003677
H0YFY1 (UniProtKB)
IEA
GO:0003677
K7EJ04 (UniProtKB)
IEA
GO:0000977
Q99856 (UniProtKB)
IEA
GO:0001228
Q99856 (UniProtKB)
IEA
GO:0003682
Q99856 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q99856 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q99856 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q99856 (UniProtKB)
IPI
GO:0005654
Q99856 (UniProtKB)
IDA
GO:0005654
Q99856 (UniProtKB)
TAS
GO:0005730
Q99856 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q99856 (UniProtKB)
IDA
GO:0005794
Q99856 (UniProtKB)
IDA
GO:0006366
Q99856 (UniProtKB)
IEA
GO:0006977
Q99856 (UniProtKB)
TAS
GO:0042803
Q99856 (UniProtKB)
IEA
GO:0045121
Q99856 (UniProtKB)
IDA
GO:0045944
Q99856 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 ARID3A基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
leukemia 0.00272435 1 0 LHGDN
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Hypertensive disease 0.000542884 2 0 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Diffuse Large B-Cell Lymphoma 0.000271442 1 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant tumor of colon 0.000271442 1 0 BeFree
Diabetes Mellitus, Insulin-Dependent 0.000271442 1 0 BeFree
Lupus Erythematosus 0.000271442 1 0 BeFree
Lupus Erythematosus, Systemic 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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