ARID3C (AT-rich interaction domain 3C)

symbol:
ARID3C
locus group:
protein-coding gene
location:
9p13.3
gene_family:
AT rich interactive domain containing
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
138715
ensembl gene id:
ENSG00000205143
ucsc gene id:
uc011lon.3
refseq accession:
NM_001017363
hgnc_id:
HGNC:21209
approved reserved:
2004-01-28
9p13.3
基因染色体位置图

ARID3C(AT-rich interaction domain 3C)属于ARID(AT-rich interaction domain)基因家族,该家族成员均含有一个保守的ARID结构域,能够特异性识别并结合富含AT碱基的DNA序列,参与染色质重塑和基因转录调控。ARID家族蛋白在胚胎发育、细胞周期调控和分化中发挥重要作用。ARID3C作为该家族成员之一,主要表达于生殖系统和部分免疫细胞中,其编码蛋白通过与DNA结合调控下游靶基因的表达,影响细胞增殖和分化。研究表明,ARID3C在精子发生过程中可能参与减数分裂的调控,其表达异常可能导致男性不育。此外,ARID3C在B淋巴细胞发育中也起一定作用,其功能异常可能与某些免疫缺陷疾病相关。ARID3C基因突变可能导致其DNA结合能力下降或丧失,进而影响其调控靶基因的功能,但目前关于其突变与具体疾病的直接关联研究较少。当ARID3C过表达时,可能过度激活某些增殖相关基因,导致细胞生长失控;而表达降低则可能影响正常生殖细胞发育或免疫功能。值得注意的是,ARID3C与家族其他成员如ARID3A和ARID3B具有相似的结构域但可能存在功能冗余或互补,这些基因共同参与维持基因组稳定性和细胞命运决定。由于ARID3C研究相对较少,其具体分子机制和病理学意义仍需进一步探索。

This gene is a member of the ARID (AT-rich interaction domain) family of proteins. The ARID domain is a helix-turn-helix motif-based DNA-binding domain. ARID family members have roles in embryonic patterning, cell lineage gene regulation, cell cycle control, transcriptional regulation and possibly in chromatin structure modification. [provided by RefSeq, Jul 2008]

这个基因蛋白的干旱(AT-丰富的互动域)家族的一员。在干旱域是螺旋 - 转角 - 螺旋基于基序的DNA结合结构域。干旱家族成员在胚胎图案形成,细胞谱系基因调控,细胞周期控制,转录调节作用,并可能在染色质结构修饰。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

ARID3C基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
ARID3C基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs3808869       rs3808870       rs7864478       rs10972172       rs12335475       rs12337871       rs73497065       rs76093916       rs111454615       rs111707496       rs138550382       rs138685160       rs138916991       rs140417025       rs140797141       rs142710890       rs143551370      

ARID3C基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTCTTAATCTGGCAGGCAG
58
AAGAGGACACCAGTGTAGAC
58
CTCTTAATCTGGCAGGCAG
58
AGAGGACACCAGTGTAGAC
58
CTTAATCTGGCAGGCAGTG
58
AAAGAGGACACCAGTGTAGAC
59
      尚未收录相关数据

ARID3C基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ARID3C基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003677
A6NKF2 (UniProtKB)
IEA
GO:0003682
A6NKF2 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
A6NKF2 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
A6NKF2 (UniProtKB)
IEA
GO:0006351
A6NKF2 (UniProtKB)
IEA
GO:0045121
A6NKF2 (UniProtKB)
IDA
GO:0045944
A6NKF2 (UniProtKB)
IEA

可能调控 ARID3C基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。