ARID5A (AT-rich interaction domain 5A)

symbol:
ARID5A
locus group:
protein-coding gene
location:
2q11.2
gene_family:
AT rich interactive domain containing
alias symbol:
MRF-1|RP11-363D14
alias name:
modulator recognition factor 1
entrez id:
10865
ensembl gene id:
ENSG00000196843
ucsc gene id:
uc002swe.4
refseq accession:
NM_212481
hgnc_id:
HGNC:17361
approved reserved:
2004-01-28
2q11.2
基因染色体位置图

ARID5A(AT-rich interaction domain 5A)属于ARID(AT-rich interaction domain)基因家族,该家族成员均含有一个保守的ARID结构域,能够特异性识别并结合富含AT(腺嘌呤-胸腺嘧啶)的DNA序列,参与染色质重塑和基因转录调控。ARID家族蛋白在细胞增殖、分化和发育中发挥重要作用。ARID5A主要作为转录调控因子,通过结合靶基因启动子或增强子区域的AT-rich序列,激活或抑制下游基因表达,其作用位点集中在细胞核内。该基因广泛表达于多种组织,尤其在心脏、骨骼肌和大脑中表达较高。ARID5A的生物学功能涉及胚胎发育、细胞周期调控和免疫反应,例如通过调控TGF-β(转化生长因子-β)信号通路影响细胞分化。突变可能导致ARID5A的DNA结合能力丧失或转录调控异常,与先天性心脏病、神经发育障碍及某些癌症(如乳腺癌和白血病)相关。ARID5A过表达可能扰乱正常细胞周期,促进肿瘤发生,例如通过上调 cyclin D1(细胞周期蛋白D1)加速细胞增殖;而表达降低则可能损害心脏发育或免疫功能,导致炎症反应失调。在基因家族中,ARID成员如ARID1A/B(编码BAF250A/B蛋白)是SWI/SNF染色质重塑复合物的核心组分,而ARID5A更偏向独立行使转录调控功能。研究还发现ARID5A与自身免疫疾病(如类风湿关节炎)相关,其单核苷酸多态性(SNP,即DNA序列单个碱基的变异)可能影响疾病易感性。专业术语中,"染色质重塑"指通过改变染色质结构来调节基因表达的过程,"增强子"是能远程激活基因转录的DNA序列,"单核苷酸多态性"则是群体中常见的遗传变异类型。目前中文术语"AT-rich interaction domain"有时被直译为"富含AT相互作用域",但更常用英文缩写ARID。

Members of the ARID protein family, including ARID5A, have diverse functions but all appear to play important roles in development, tissue-specific gene expression, and regulation of cell growth (Patsialou et al., 2005 [PubMed 15640446]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

干旱的蛋白质家族,包括ARID5A,成员有不同的功能,但都出现在发展,组织特异性基因表达中发挥重要作用,调节细胞生长(Patsialou等,2005 [考研15640446])。 [由OMIM,2008年3月供应]

ARID5A基因的碱基序列:[NCBI]
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ARID5A基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs749027       rs1011040       rs1866445       rs1866446       rs2278563       rs2438711       rs2464915       rs2579500       rs2579506       rs2579507       rs2708978       rs6576973       rs6718340       rs6723188       rs7599131       rs12620370       rs13026942      

ARID5A基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGATGGCTAAGGAGAACAGG
59
TTCCTGGCATCATCTGGTC
60
CTACAAGTTCATGAAGGAGCG
59
ATCTTCCACAGGTTAATCTGCT
60
TACAAGTTCATGAAGGAGCGA
60
GATCTTCCACAGGTTAATCTGC
59
ATGGCTAAGGAGAACAGGG
59
TTTCCTGGCATCATCTGGT
59
TCTACAAGTTCATGAAGGAGC
58
TCTTCCACAGGTTAATCTGC
58
ATGGCTAAGGAGAACAGGG
59
TTCCTGGCATCATCTGGTC
60
      尚未收录相关数据

ARID5A基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ARID5A基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003677
C9J1Q0 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
C9J1Q0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
C9J1Q0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
C9J1Q0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
C9J1Q0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
C9J1Q0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
C9J1Q0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
C9J1Q0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
C9J1Q0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
C9J1Q0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
C9J1Q0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
C9J1Q0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
C9J1Q0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
C9J1Q0 (UniProtKB)
IDA
GO:0005654
C9J1Q0 (UniProtKB)
IDA
GO:0005730
C9J1Q0 (UniProtKB)
IDA
GO:0003677
Q03989 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
Q03989 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q03989 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q03989 (UniProtKB)
IBA
GO:0005634
Q03989 (UniProtKB)
IDA
GO:0005654
Q03989 (UniProtKB)
IDA
GO:0005730
Q03989 (UniProtKB)
IDA
GO:0006351
Q03989 (UniProtKB)
IEA
GO:0006357
Q03989 (UniProtKB)
IBA
GO:0044212
Q03989 (UniProtKB)
IBA
GO:0045892
Q03989 (UniProtKB)
TAS

可能调控 ARID5A基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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