ATOH7 (atonal bHLH transcription factor 7)

symbol:
ATOH7
locus group:
protein-coding gene
location:
10q21.3
gene_family:
Basic helix-loop-helix proteins
alias symbol:
Math5|bHLHa13
alias name:
None
entrez id:
220202
ensembl gene id:
ENSG00000179774
ucsc gene id:
uc001jnq.4
refseq accession:
NM_145178
hgnc_id:
HGNC:13907
approved reserved:
2002-07-05
10q21.3
基因染色体位置图

ATOH7(也称为Math5)是一种编码碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)转录因子的基因,属于ATOH基因家族(原称Math家族),该家族成员在神经发育中起关键作用,尤其在细胞命运决定和分化过程中。ATOH7主要在视网膜发育中表达,调控视网膜神经节细胞(RGCs)的形成,这些细胞负责将视觉信号从眼睛传递到大脑。ATOH7通过激活下游基因(如Brn3b和Isl1)促进RGCs的分化,若其功能丧失(如突变或敲除),会导致RGCs数量显著减少甚至缺失,引发先天性视力障碍或小眼畸形(microphthalmia)。相反,ATOH7过表达可能干扰视网膜细胞类型的平衡,导致异常分化或肿瘤(如成视网膜细胞瘤风险增加)。ATOH7突变与人类疾病如先天性视网膜发育不良相关,其单核苷酸多态性(SNPs)也被关联于青光眼易感性。ATOH基因家族的共性包括依赖bHLH结构域结合DNA(E-box序列)以调控靶基因表达,并参与神经上皮细胞的定向分化。专业术语解释:bHLH(碱性螺旋-环-螺旋)是一种蛋白质结构域,允许蛋白质结合DNA并调控基因表达;E-box是DNA上被bHLH蛋白识别的特定序列;神经节细胞是视网膜中传递视觉信息的神经元。目前"ATOH7"的中文译名存在差异,部分文献沿用英文名或称为"Math5"。

This intronless gene encodes a member of the basic helix-loop-helix family of transcription factors, with similarity to Drosophila atonal gene that controls photoreceptor development. Studies in mice suggest that this gene plays a central role in retinal ganglion cell and optic nerve formation. Mutations in this gene are associated with nonsyndromic congenital retinal nonattachment. [provided by RefSeq, Dec 2011]

此内含子基因编码的碱性螺旋 - 环 - 螺旋转录因子家族的成员,具有相似性到控制感光体显影果蝇无调的基因。在小鼠中的研究表明,这种基因在视网膜神经节细胞和视神经形成了中心作用。在这种基因突变与非综合征先天性视网膜nonattachment相关联。 [由RefSeq的,2011年12月提供]

ATOH7基因的碱基序列:[NCBI]
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ATOH7基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2289804       rs6480319       rs6480320       rs7916697       rs61854782       rs72795459       rs73269166       rs73269167       rs73269175       rs73269177       rs78295529       rs111699024       rs114692316       rs114972955       rs138274069       rs138780374       rs139387078      

ATOH7基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGCTACATCATGGCTCTGAC
60
AAGTGCTCACAGTGGAGAC
60
GCTACATCATGGCTCTGAC
58
AAGTGCTCACAGTGGAGAC
60
TACATCATGGCTCTGACCC
59
AAGTGCTCACAGTGGAGAC
60
      尚未收录相关数据

ATOH7基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ATOH7基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003407
Q8N100 (UniProtKB)
IMP
GO:0003677
Q8N100 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
Q8N100 (UniProtKB)
IEA
GO:0006351
Q8N100 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
Q8N100 (UniProtKB)
IEA
GO:0007623
Q8N100 (UniProtKB)
IEA
GO:0009649
Q8N100 (UniProtKB)
IEA
GO:0021554
Q8N100 (UniProtKB)
IMP
GO:0030154
Q8N100 (UniProtKB)
IEA
GO:0046983
Q8N100 (UniProtKB)
IEA

可能调控 ATOH7基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
RETINAL NONATTACHMENT, NONSYNDROMIC CONGENITAL 0.120271442 1 3 BeFree_CLINVAR
Persistent Hyperplastic Primary Vitreous 0.120271442 1 1 BeFree_ORPHANET
CORNEAL OPACIFICATION WITH OTHER OCULAR ANOMALIES 0.12 0 0 ORPHANET
Persistent Hyperplastic Primary Vitreous, Autosomal Recessive 0.12 2 0 UNIPROT
Disorder of eye 0.002367032 1 1 GAD
Carcinoma in situ of eye 0.002367032 1 1 GAD
Blind Vision 0.002367032 1 0 GAD
Synovial Cyst 0.000814326 3 0 BeFree
Myxoid cyst 0.000814326 3 0 BeFree
Low Tension Glaucoma 0.000814326 3 5 BeFree

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