BCAN (brevican)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
BCAN
locus group:
protein-coding gene
location:
1q23.1
gene_family:
Hyalectan proteoglycans|V-set domain containing
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BEHAB|MGC13038|CSPG7
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chondroitin sulfate proteoglycan 7…
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63827
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uc001fpp.4
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NM_021948
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HGNC:23059
approved reserved:
2004-03-01

基因染色体位置

基因染色体位置

1q23.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

BCAN（Brevican）是一种细胞外基质蛋白，属于凝集素聚糖家族（lectican family），也称为软骨素硫酸蛋白聚糖家族（CSPG）。该家族成员包括聚集蛋白聚糖（Aggrecan）、神经聚糖（Neurocan）、多功能聚糖（Versican）和BCAN，它们共同的特点是含有N端的透明质酸结合结构域、中央的硫酸软骨素链结合区以及C端的凝集素样结构域，这些结构使它们能够参与细胞间相互作用和信号传导。BCAN主要在中枢神经系统（CNS）中表达，特别是在大脑的神经元和胶质细胞中，尤其在发育和成年阶段的海马区、小脑和大脑皮层中富集。BCAN通过与细胞表面受体（如CD44）和其他细胞外基质分子（如透明质酸和tenascin-R）相互作用，调节神经元的迁移、突触可塑性以及轴突生长，对神经回路的形成和维持至关重要。BCAN的突变或异常表达可能导致其功能受损，影响神经发育和突触稳定性。研究发现，BCAN的缺失或功能缺陷与精神分裂症、自闭症谱系障碍（ASD）和阿尔茨海默病等神经精神疾病相关，可能通过破坏细胞外基质的完整性或干扰神经元信号传导通路。当BCAN过表达时，可能增强细胞外基质的稳定性，但过度积累可能抑制轴突再生，阻碍神经损伤后的修复；而降低BCAN表达则可能导致突触功能异常、神经元网络连接紊乱，甚至引发认知功能障碍。此外，BCAN在胶质瘤等脑肿瘤中常出现过表达，可能通过促进肿瘤细胞迁移和侵袭参与疾病进展。凝集素聚糖家族的成员均参与组织结构的维持和细胞信号调控，但BCAN因其在中枢神经系统的特异性分布和功能，成为神经发育与疾病研究的重要靶点。

This gene encodes a member of the lectican family of chondroitin sulfate proteoglycans that is specifically expressed in the central nervous system. This protein is developmentally regulated and may function in the formation of the brain extracellular matrix. This protein is highly expressed in gliomas and may promote the growth and cell motility of brain tumor cells. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Sep 2011]

这个基因编码的硫酸软骨素蛋白多糖的lectican家族是在中枢神经系统中特异性表达的一员。这种蛋白质是发育调节和在大脑细胞外基质的形成可能起作用。这种蛋白是在神经胶质瘤中高度表达，并且可以促进脑肿瘤细胞的生长和细胞运动性。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的，2011年9月提供]

OMIM数据库中对BCAN基因的介绍     Wikipedia数据库中对BCAN基因的介绍

基因序列

基因序列

BCAN基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

BCAN基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs11360       rs951963       rs951964       rs1016423       rs1056695       rs1105300       rs1361744       rs1361745       rs2005506       rs2185784       rs2236601       rs2236602       rs2277873       rs2298133       rs2298134       rs2298135       rs2365713      

基因表达

基因表达

BCAN基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AAGGAGACAGCTCAGAGGA
60
CAGGAAAGTCCACTTGACC
58
GTTACGGAGACATGGATGG
58
GGAACAGTTCTCCATTTAGGT
58
GAGTACCAGTGGATCGGAC
59
CCAGTTCTCATAGAGCAGGG
60
GTACCAGTGGATCGGACTC
59
TCCAGTTCTCATAGAGCAGG
59
AAGGAGACAGCTCAGAGGA
60
AGGAAAGTCCACTTGACCC
59
TTACGGAGACATGGATGGC
60
AGGAACAGTTCTCCATTTAGGT
59
GTACCAGTGGATCGGACTC
59
CCAGTTCTCATAGAGCAGGG
60
TTACGGAGACATGGATGGC
60
GGAACAGTTCTCCATTTAGGTC
59
AAGGAGACAGCTCAGAGGA
60
AGGAAAGTCCACTTGACCC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

BCAN基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

BCAN基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005540
Q5T3I6 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
Q5T3I6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005540
Q5T3I7 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
Q5T3I7 (UniProtKB)
IEA
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IBA
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IBA
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IBA
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TAS
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TAS
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Q96GW7 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
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GO:0005578
Q96GW7 (UniProtKB)
IBA
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IEA
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TAS
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TAS
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TAS
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TAS
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TAS
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Q96GW7 (UniProtKB)
IBA
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TAS
GO:0030198
Q96GW7 (UniProtKB)
TAS
GO:0030203
Q96GW7 (UniProtKB)
TAS
GO:0030206
Q96GW7 (UniProtKB)
TAS
GO:0030207
Q96GW7 (UniProtKB)
TAS
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Q96GW7 (UniProtKB)
TAS
GO:0030246
Q96GW7 (UniProtKB)
IEA
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Q96GW7 (UniProtKB)
IEA
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Q96GW7 (UniProtKB)
IEA
GO:0043202
Q96GW7 (UniProtKB)
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GO:0043202
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TAS
GO:0043202
Q96GW7 (UniProtKB)
TAS
GO:0045202
Q96GW7 (UniProtKB)
IEA
GO:0048168
Q96GW7 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 BCAN基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Glioma 0.007891677 9 0 BeFree_LHGDN
Glioblastoma 0.003267234 2 0 BeFree_LHGDN
Cerebrovascular accident 0.002367032 1 0 GAD
Brain Ischemia 0.002367032 1 0 GAD
Carcinoma of bladder 0.000271442 1 0 BeFree
oligodendroglioma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant Glioma 0.000271442 1 0 BeFree
Well Differentiated Oligodendroglioma 0.000271442 1 0 BeFree
Brain Tumor, Primary 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of urinary bladder 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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