BCL7C (BAF chromatin remodeling complex subunit BCL7C)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
BCL7C
locus group:
protein-coding gene
location:
16p11.2
gene_family:
alias symbol:
SMARCJ3
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None
entrez id:
9274
ensembl gene id:
ENSG00000099385
ucsc gene id:
uc002dzv.5
refseq accession:
NM_004765
hgnc_id:
HGNC:1006
approved reserved:
1999-03-19

基因染色体位置

基因染色体位置

16p11.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

BCL7C（B-cell CLL/lymphoma 7C）属于BCL7基因家族，该家族包括BCL7A、BCL7B和BCL7C三个成员，均与染色质重塑复合物SWI/SNF（SWItch/Sucrose Non-Fermentable）相关，参与调控基因表达和染色质结构动态变化。BCL7C编码的蛋白在细胞核中发挥作用，主要通过与SWI/SNF复合物结合，协助其识别和重塑核小体（染色质的基本单位），从而影响转录激活或抑制。其生物学功能涉及细胞周期调控、DNA损伤修复和分化过程，尤其在B细胞发育和免疫系统中起重要作用。突变或表达异常可能导致SWI/SNF复合物功能失调，与多种癌症相关，如非霍奇金淋巴瘤（NHL）和急性淋巴细胞白血病（ALL）。BCL7C低表达可能削弱染色质重塑效率，导致基因表达紊乱，而过表达可能干扰SWI/SNF复合物的正常组装，引发增殖异常。该基因家族共性为均含保守的BCL7结构域，能结合染色质并参与表观遗传调控。目前研究提示BCL7C可能作为抑癌基因发挥作用，但其具体机制仍需进一步探索。专业术语解释：染色质重塑（chromatin remodeling）指通过改变染色质结构来调控DNA可及性的过程；SWI/SNF复合物是一类依赖ATP的染色质重塑复合体，通过滑动或驱逐核小体调控转录。若存在中文术语不准确，建议参考英文原词。

This gene is identified by the similarity of its product to the N-terminal region of BCL7A protein. The BCL7A protein is encoded by the gene known to be directly involved in a three-way gene translocation in a Burkitt lymphoma cell line. The function of this gene has not yet been determined. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2013]

此基因是通过其产物BCL7A蛋白的N末端区域的相似性鉴定。所述BCL7A蛋白通过公知的直接参与在伯基特淋巴瘤细胞系的三通基因易位的基因编码。该基因的功能还没有被确定。已发现该基因编码不同亚型的两个转录变异体。 [由RefSeq的，2013年11月提供]

OMIM数据库中对BCL7C基因的介绍     Wikipedia数据库中对BCL7C基因的介绍

基因序列

基因序列

BCL7C基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

BCL7C基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs897984       rs2125293       rs2168834       rs2335013       rs2878304       rs3751871       rs3794707       rs4046092       rs4290486       rs4360955       rs4889524       rs4889527       rs4889528       rs4889534       rs4889536       rs4889611       rs4889612      

基因表达

基因表达

BCL7C基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTATCTTCAAGTGGGTGCC
58
CTCACTCCCGAATCCTCAG
59
TTCGTATCTTCAAGTGGGTG
58
GCTGTTCTCATCATTAAGATCC
57
CCATGACTGTAAGTTTCCTGG
59
ATTCTCACTCCCGAATCGG
59
GTAAGTTTCCTGGGACCTC
57
TCCTCGTCATTCTCACTCC
59
CTGGAAGCTGAGACTATGG
57
CTCCACTGCTTTATGACCC
58
TTCGTATCTTCAAGTGGGTG
58
GCTGTTCTCATCATTAAGATCC
57
CTGGAAGCTGAGACTATGGA
59
TCCACTGCTTTATGACCCA
59
TATCTTCAAGTGGGTGCCAG
60
GCTGTTCTCATCATTAAGATCCAG
60
ATGACTGTAAGTTTCCTGGGA
59
TCATTCTCACTCCCGAATCG
60
TATCTTCAAGTGGGTGCCAG
60
GCTGTTCTCATCATTAAGATCCAG
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

BCL7C基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

BCL7C基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0006915
Q8WUZ0 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 BCL7C基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Ependymoma 0.12 1 0 CTD_human
B-Cell Lymphomas 0.002367032 1 0 GAD
Lymphoma, Follicular 0.002367032 1 0 GAD
Diffuse Large B-Cell Lymphoma 0.002367032 1 0 GAD

基因相关服务

基因相关服务

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山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话： 0531-88819269

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