BHLHE22 (basic helix-loop-helix family member e22)

symbol:
BHLHE22
locus group:
protein-coding gene
location:
8q12.3
gene_family:
Basic helix-loop-helix proteins|Trinucleotide repeat containing
alias symbol:
CAGL85|Beta3
alias name:
None
entrez id:
27319
ensembl gene id:
ENSG00000180828
ucsc gene id:
uc003xvi.4
refseq accession:
NM_152414
hgnc_id:
HGNC:11963
approved reserved:
2000-01-27
8q12.3
基因染色体位置图

BHLHE22(也称为DEC1或SHARP2)属于碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)转录因子家族,该家族成员通常通过结合DNA调控基因表达,参与细胞分化、生物钟调节和应激反应等过程。BHLHE22在多种组织中表达,包括神经系统、骨骼肌和脂肪组织,其表达产物是一种转录因子,可通过结合特定DNA序列(如E-box元件)抑制或激活下游基因的转录。在神经系统中,BHLHE22对神经元分化和迁移至关重要,尤其在视网膜发育中调控光感受器细胞的形成。该基因的突变可能导致功能丧失或异常,与神经发育障碍(如智力障碍或癫痫)相关,也可能影响昼夜节律调节。BHLHE22过表达可能抑制细胞增殖(如在某些癌症中抑制肿瘤生长),而低表达可能破坏神经发育或代谢平衡(如与肥胖相关的脂肪代谢异常)。BHLHE22与BHLHE23(DEC2/SHARP1)等同家族成员共享保守的bHLH结构域,均参与应激和分化调控,但各自具有组织特异性功能。此外,BHLHE22在缺氧条件下被HIF-1α(低氧诱导因子)上调,可能与癌症的缺氧适应有关。专业术语解释:bHLH(碱性螺旋-环-螺旋)指蛋白质中结合DNA的结构域;E-box是DNA上被bHLH蛋白识别的调控序列;HIF-1α是细胞响应低氧的关键转录因子。若术语"光感受器细胞"(photoreceptor cells)或"昼夜节律"(circadian rhythm)存在翻译争议,可标注英文。

BHLHE22 belongs to the basic helix-loop-helix (bHLH) family of transcription factors that regulate cell fate determination, proliferation, and differentiation. These proteins function as dimers and bind to an E-box DNA sequence (CANNTG). BHLHE22 is expressed exclusively in the central nervous system and retina (Xu et al., 2002 [PubMed 12213201]).[supplied by OMIM, Jul 2010]

BHLHE22属于碱性螺旋 - 环 - 螺旋(bHLH结构)家族的调节细胞命运决定,增殖和分化的转录因子。这些蛋白作为二聚体和绑定到E-盒DNA序列(CANNTG)。 BHLHE22在中枢神经系统和视网膜只表示(Xu等人,2002 [搜索PubMed 12213201])。[由OMIM,2010年7月供给]

BHLHE22基因的碱基序列:[NCBI]
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BHLHE22基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs4737675       rs7016250       rs9650210       rs13279074       rs16931326       rs34144912       rs34155586       rs34738985       rs35800845       rs59724810       rs62519835       rs62519836       rs62519837       rs62519838       rs71260888       rs71561231       rs74575630      

BHLHE22基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGAACTACATCCTCATGCAGG
60
GTTGAGGTAGGCGACTAGG
59
GAACTACATCCTCATGCAGG
58
GTTGAGGTAGGCGACTAGG
59
ACTACATCCTCATGCAGGC
60
GTTGAGGTAGGCGACTAGG
59
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
HOXA10
BHLHE22
Activation

BHLHE22基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

BHLHE22基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000981
Q8NFJ8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
Q8NFJ8 (UniProtKB)
IEA
GO:0006351
Q8NFJ8 (UniProtKB)
IEA
GO:0006357
Q8NFJ8 (UniProtKB)
IEA
GO:0022008
Q8NFJ8 (UniProtKB)
IEA
GO:0046983
Q8NFJ8 (UniProtKB)
IEA

可能调控 BHLHE22基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Thrombasthenia 0.007600372 28 0 BeFree
melanoma 0.004614512 17 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.003800186 14 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.003800186 14 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.003528744 13 0 BeFree
Duane Retraction Syndrome 0.00272435 1 0 LHGDN
Ovarian Carcinoma 0.002714419 10 1 BeFree
Malignant neoplasm of ovary 0.002714419 10 1 BeFree
Glioma 0.002442977 9 0 BeFree
Junctional Epidermolysis Bullosa 0.002171535 8 0 BeFree

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