BNIP2 (BCL2 interacting protein 2)

symbol:
BNIP2
locus group:
protein-coding gene
location:
15q22.2
gene_family:
alias symbol:
Nip2|BNIP-2
alias name:
None
entrez id:
663
ensembl gene id:
ENSG00000140299
ucsc gene id:
uc059jvv.1
refseq accession:
NM_004330
hgnc_id:
HGNC:1083
approved reserved:
1997-03-19
15q22.2
基因染色体位置图

BNIP2(BCL2/腺病毒E1B 19 kDa相互作用蛋白2)属于BCL2蛋白家族中的一员,该家族主要调控细胞凋亡(程序性细胞死亡)和自噬(细胞自我降解过程)。BNIP2通过其BH3结构域(一种促进凋亡的蛋白模块)与BCL2家族其他成员相互作用,参与线粒体途径的凋亡调控。其表达产物可抑制抗凋亡蛋白BCL2的功能,从而促进细胞死亡。BNIP2的作用位点集中在线粒体外膜,通过影响线粒体膜通透性来触发凋亡信号。突变可能导致其促凋亡功能丧失,与肿瘤发生相关,例如在某些乳腺癌中BNIP2表达下调会增强细胞存活。该基因过表达会加速凋亡,可能用于癌症治疗;而低表达则可能抑制凋亡,促进肿瘤发展。BNIP2还参与细胞迁移和侵袭,与转移性癌症相关。其所属的BCL2家族共性为均含BH结构域(Bcl-2 homology domains),通过蛋白互作调控凋亡。部分文献中BNIP2也被称作NIP2(adenovirus E1B 19 kDa-interacting protein 2),需注意命名差异。目前研究显示BNIP2可能通过影响自噬体形成参与神经退行性疾病,但机制尚不明确。

This gene is a member of the BCL2/adenovirus E1B 19 kd-interacting protein (BNIP) family. It interacts with the E1B 19 kDa protein, which protects cells from virally-induced cell death. The encoded protein also interacts with E1B 19 kDa-like sequences of BCL2, another apoptotic protector. [provided by RefSeq, Mar 2011]

这个基因是BCL2 /腺病毒E1B 19 KD相互作用蛋白(BNIP)家族中的一员。它与E1B 19 kDa的蛋白,它保护细胞免受病毒诱导的细胞死亡相互作用。所编码的蛋白质也与BCL2的E1B 19 kDa的样序列,另一个凋亡保护相互作用。 [由RefSeq的,2011年3月提供]

BNIP2基因的碱基序列:[NCBI]
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BNIP2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1749       rs7882       rs722162       rs722163       rs722164       rs728037       rs728038       rs754641       rs754642       rs754643       rs755605       rs1002181       rs1007014       rs1046053       rs1057058       rs1057059       rs1057061      

BNIP2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATTGAATCCAGGCTGAGGA
58
ATCTTCTGGTAAAGGTATCGGA
59
CGTTGGCATACCAGAATGC
60
TGATCAACTACCTATGATCCCAG
59
AGATGATTTGGATGAAAGTGGG
59
TGGAAGATCATCTTCCCACTC
59
AGATGATTTGGATGAAAGTGGG
59
TGGAAGATCATCTTCCCACTC
59
GCAAATTGATAGAAGGTTACGG
58
TCTTGTAACAGCCAGAAGTG
58
GATGATTTGGATGAAAGTGGG
57
CCAGGAAATGACTTCCCAC
58
GATGATTTGGATGAAAGTGGG
57
CCAGGAAATGACTTCCCAC
58
GTGGAACTTAAAGAAGAATGGC
58
CCATTAACTTCTAGTGAGCCAG
59
GATGATTTGGATGAAAGTGGG
57
CCAGGAAATGACTTCCCAC
58
ATTAGCTCGAAATTCAGCCA
58
AGTTCTGCTAGTTCTGCCA
59
      尚未收录相关数据

BNIP2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

BNIP2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
H7C096 (UniProtKB)
IEA
GO:0001824
J3KN59 (UniProtKB)
IEA
GO:0005814
J3KN59 (UniProtKB)
IEA
GO:0031616
J3KN59 (UniProtKB)
IEA
GO:0043410
J3KN59 (UniProtKB)
IEA
GO:0045666
J3KN59 (UniProtKB)
IEA
GO:0051057
J3KN59 (UniProtKB)
IEA
GO:0051146
J3KN59 (UniProtKB)
IEA
GO:0051297
J3KN59 (UniProtKB)
IEA
GO:0005096
Q12982 (UniProtKB)
TAS
GO:0005509
Q12982 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
Q12982 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q12982 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q12982 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q12982 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q12982 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q12982 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q12982 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q12982 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q12982 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q12982 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q12982 (UniProtKB)
IPI
GO:0005635
Q12982 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q12982 (UniProtKB)
IDA
GO:0005829
Q12982 (UniProtKB)
IBA
GO:0005829
Q12982 (UniProtKB)
TAS
GO:0006915
Q12982 (UniProtKB)
IPI
GO:0006915
Q12982 (UniProtKB)
IPI
GO:0042802
Q12982 (UniProtKB)
IBA
GO:0043066
Q12982 (UniProtKB)
TAS
GO:0043231
Q12982 (UniProtKB)
IDA
GO:0043547
Q12982 (UniProtKB)
IEA
GO:0048471
Q12982 (UniProtKB)
IEA
GO:0051149
Q12982 (UniProtKB)
TAS

可能调控 BNIP2基因的相关microRNA:     

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Lymphoma, Non-Hodgkin 0.002367032 1 0 GAD
Narcolepsy 0.002367032 1 0 GAD
Neuroblastoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.000271442 1 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

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