CACNA1S (calcium voltage-gated channel subunit alpha1 S)

symbol:
CACNA1S
locus group:
protein-coding gene
location:
1q32.1
gene_family:
Calcium channels, voltage-dependent
alias symbol:
Cav1.1|hypoPP
alias name:
None
entrez id:
779
ensembl gene id:
ENSG00000081248
ucsc gene id:
uc001gvv.4
refseq accession:
NM_000069
hgnc_id:
HGNC:1397
approved reserved:
1992-03-27
1q32.1
基因染色体位置图

CACNA1S(钙电压门控通道亚基α1 S)是编码电压门控钙通道(VGCC)中关键α1亚基的基因,属于Cav1.1亚型,主要表达于骨骼肌的横管系统(T-tubule)。它属于CACNA基因家族(电压门控钙通道α1亚基家族),该家族成员均形成钙离子通道的核心孔道结构,通过膜电位变化调控钙内流,触发肌肉收缩、神经递质释放等生理过程。CACNA1S的功能特点在于其与骨骼肌兴奋-收缩耦联直接相关:当动作电位到达横管时,该通道构象改变,通过机械耦联激活肌浆网上的兰尼碱受体(RyR1),引发钙释放,驱动肌纤维收缩。其突变可导致多种疾病,如低钾性周期性麻痹(HypoPP,因错义突变如R528H导致通道"漏电"引发血钾下降)、恶性高热易感性(MH,与RyR1协同缺陷时使肌肉钙超载)和先天性肌强直(某些突变导致通道关闭延迟)。过表达CACNA1S可能加剧钙超载相关的肌损伤,而表达降低则导致肌无力或收缩障碍。该基因与CACNA1C/D/F等同属Cav1亚家族(L型钙通道),共性为长时程激活、高压激活特性,但CACNA1S独特地采用机械耦联而非钙诱导钙释放(CICR)机制。药物如二氢吡啶类(如硝苯地平)可靶向该家族通道,但CACNA1S对骨骼肌特异性使其成为肌病治疗的潜在靶点。

This gene encodes one of the five subunits of the slowly inactivating L-type voltage-dependent calcium channel in skeletal muscle cells. Mutations in this gene have been associated with hypokalemic periodic paralysis, thyrotoxic periodic paralysis and malignant hyperthermia susceptibility. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基??因编码在骨骼肌细胞中慢慢灭活L-型电压依赖性钙通道的五个子单元之一。该基因突变与低钾性周期性麻痹,甲亢性周期性麻痹和恶性高热易感性相关。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CACNA1S基因的碱基序列:[NCBI]
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CACNA1S基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs3738262       rs3738263       rs59544606       rs71138320       rs71779577       rs111332210       rs113606337       rs115077718       rs116343418       rs148224006       rs187154951       rs533071842       rs535738239       rs535751095       rs538274968       rs542894824       rs544714223      

CACNA1S基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTGGAATGTGTTTGACTTCCTG
60
CACTCTCATCTGGGTCGTC
60
TCATCCTCAGTGAGATCGAC
59
CTCTCATCTGGGTCAACGT
59
GACTTTGAAGACACAGAAGTACG
59
TGTCAGTACCTGGAAGACG
58
CTCAGTGAGATCGACGACC
60
TGATCAGCCTCATGACACG
60
ATGTCATCCTCAGTGAGATCG
60
TCATCTGGGTCAACGTTCC
60
CTGCAGCTGAAAGAGAAGG
58
GACACGGATCTTATTGGTGG
58
TGGAATGTGTTTGACTTCCTG
59
CACTCTCATCTGGGTCGTC
60
TCATCAAGAAGATCTGGAAGAG
57
CTGTCACCTCATCATCTCC
57
TGTCATCCTCAGTGAGATCG
59
TCATCTGGGTCAACGTTCC
60
      尚未收录相关数据

CACNA1S基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CACNA1S基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005245
B1ALM3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005891
B1ALM3 (UniProtKB)
IEA
GO:0034765
B1ALM3 (UniProtKB)
IEA
GO:0070588
B1ALM3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005245
Q13698 (UniProtKB)
IDA
GO:0005515
Q13698 (UniProtKB)
IPI
GO:0005737
Q13698 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q13698 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q13698 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q13698 (UniProtKB)
TAS
GO:0005891
Q13698 (UniProtKB)
IDA
GO:0006816
Q13698 (UniProtKB)
IDA
GO:0006936
Q13698 (UniProtKB)
IMP
GO:0008331
Q13698 (UniProtKB)
IDA
GO:0030315
Q13698 (UniProtKB)
IDA
GO:0031674
Q13698 (UniProtKB)
IDA
GO:0034765
Q13698 (UniProtKB)
IEA
GO:0046872
Q13698 (UniProtKB)
IEA
GO:0061337
Q13698 (UniProtKB)
TAS
GO:0061337
Q13698 (UniProtKB)
TAS
GO:0061337
Q13698 (UniProtKB)
TAS
GO:0070588
Q13698 (UniProtKB)
IEA
GO:0086010
Q13698 (UniProtKB)
IBA

可能调控 CACNA1S基因的相关microRNA:     

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Hypokalemic periodic paralysis type 1 0.445428837 22 7 BeFree_CLINVAR_CTD_human_MGD_UNIPROT
Hypokalemic periodic paralysis 0.259302167 41 5 BeFree_CTD_human_LHGDN_ORPHANET
Thyrotoxic periodic paralysis 0.242909916 3 2 BeFree_CLINVAR_GAD_ORPHANET
Malignant hyperthermia susceptibility type 5 0.24 0 1 CLINVAR_CTD_human
Malignant hyperpyrexia due to anesthesia 0.13261581 20 1 BeFree_GAD_LHGDN_ORPHANET
MALIGNANT HYPERTHERMIA, SUSCEPTIBILITY TO, 5 0.12 1 1 UNIPROT
Respiratory Insufficiency 0.12 1 0 CTD_human
THYROTOXIC PERIODIC PARALYSIS, SUSCEPTIBILITY TO, 1 0.12 0 0 CTD_human
Familial Periodic Paralysis 0.003181358 3 1 BeFree_GAD
Amyotrophic Lateral Sclerosis 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN

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