CADM2 (cell adhesion molecule 2)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CADM2
locus group:
protein-coding gene
location:
3p12.1
gene_family:
V-set domain containing|C2-set domain containing|I-set domain containing
alias symbol:
NECL3|Necl-3|SynCAM2
alias name:
nectin-like 3
entrez id:
253559
ensembl gene id:
ENSG00000175161
ucsc gene id:
uc003dql.4
refseq accession:
NM_153184
hgnc_id:
HGNC:29849
approved reserved:
2004-02-24

基因染色体位置

基因染色体位置

3p12.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CADM2（细胞粘附分子2）是一种属于免疫球蛋白超家族的跨膜蛋白，也被称为SynCAM2或IGSF4D。它主要在大脑中表达，尤其在神经元中发挥重要作用，参与突触的形成、维持和功能调节。CADM2通过同源或异源相互作用介导细胞间粘附，促进神经元之间的连接和信息传递。其胞外段含有免疫球蛋白样结构域，负责与其他蛋白结合，而胞内段则与细胞骨架和信号分子相互作用。CADM2的突变或表达异常与多种神经系统疾病相关，包括自闭症谱系障碍、精神分裂症和阿尔茨海默病。研究表明，CADM2的缺失或功能缺陷可能导致突触可塑性受损，影响学习和记忆能力。此外，CADM2还参与肿瘤抑制，在某些癌症中表达下调。CADM2属于CADM基因家族，该家族包括CADM1、CADM3和CADM4，这些成员均具有类似的免疫球蛋白样结构域和细胞粘附功能，但在组织分布和具体功能上存在差异。CADM家族蛋白普遍参与细胞间识别、信号传导和组织发育。CADM2的过表达可能增强神经元连接并改善认知功能，但也可能与某些神经系统过度兴奋性疾病相关；而降低表达则可能导致突触功能障碍和神经发育异常。全基因组关联研究还发现CADM2基因多态性与人格特质、肥胖和吸烟行为等复杂性状相关，提示其在神经行为调控中的广泛作用。

This gene encodes a member of the synaptic cell adhesion molecule 1 (SynCAM) family which belongs to the immunoglobulin (Ig) superfamily. The encoded protein has three Ig-like domains and a cytosolic protein 4.1 binding site near the C-terminus. Proteins belonging to the protein 4.1 family crosslink spectrin and interact with other cytoskeletal proteins. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Feb 2012]

该基因编码突触细胞粘附分子1（SynCAM）家族属于免疫球蛋白（Ig）超家族的成员。所编码的蛋白质具有三个Ig样结构域和接近C末端胞质蛋白4.1结合位点。属于蛋白4.1家族交联血影，并与其它细胞骨架蛋白相互作用的蛋白质。已发现该基因编码不同亚型的多个抄本变形。 [由RefSeq的，2012年2月提供]

OMIM数据库中对CADM2基因的介绍     Wikipedia数据库中对CADM2基因的介绍

基因序列

基因序列

CADM2基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CADM2基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2324975       rs2325005       rs3042362       rs4053703       rs6549064       rs6549065       rs6549066       rs6762151       rs6762937       rs6771277       rs6776825       rs6782241       rs6782553       rs6785190       rs6804056       rs6804410       rs6805498      

基因表达

基因表达

CADM2基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGACGACAAGAAAGCTTTAAGG
59
GACACATCACTGACACTAATACTC
59
CATTGTGCATGATCCTAATGCT
60
ACAACTACAGCCACTATTCCT
59
TCTCCGCTTCTACAGTGTC
59
GATGATGGTGGGAAGAGGG
60
GTACATATCGATGTGAAGCCA
58
TGTTGGGAACATCATGCAC
59
AAGAAACTATTTCGCGATACCC
59
CCCTTCTCTAAAGGGCGTC
60
GTACATATCGATGTGAAGCCA
58
TGTTGGGAACATCATGCAC
59
ATGTTCTCATTGTGCATGATCC
60
CAGCCACTATTCCTCCTATGAG
60
AAGAAACTATTTCGCGATACCC
59
CCTTCTCTAAAGGGCGTCC
60
CAGCAGCATCAGAGATCCT
59
ACTACAGCCACTATTCCTCC
59
CAGCAGCATCAGAGATCCT
59
ACTACAGCCACTATTCCTCC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CADM2基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CADM2基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004872
Q8N3J6 (UniProtKB)
IBA
GO:0005102
Q8N3J6 (UniProtKB)
IBA
GO:0005886
Q8N3J6 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
Q8N3J6 (UniProtKB)
IBA
GO:0005913
Q8N3J6 (UniProtKB)
IBA
GO:0007156
Q8N3J6 (UniProtKB)
IBA
GO:0007157
Q8N3J6 (UniProtKB)
IBA
GO:0008037
Q8N3J6 (UniProtKB)
IBA
GO:0030424
Q8N3J6 (UniProtKB)
IEA
GO:0034332
Q8N3J6 (UniProtKB)
TAS
GO:0042803
Q8N3J6 (UniProtKB)
IBA
GO:0045202
Q8N3J6 (UniProtKB)
IEA
GO:0050839
Q8N3J6 (UniProtKB)
IBA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CADM2基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Obesity 0.120542884 3 1 BeFree_GWASCAT
Ulcerative Colitis 0.002367032 1 0 GAD
Prostatic Neoplasms 0.002367032 1 1 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Brain Diseases 0.002367032 1 1 GAD
Carcinogenesis 0.000271442 1 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.000271442 1 0 BeFree
Inattention 0.000271442 1 0 BeFree
Liver carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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