CASP4 (caspase 4)

symbol:
CASP4
locus group:
protein-coding gene
location:
11q22.3
gene_family:
Caspases
alias symbol:
ICE(rel)II|ICH-2|TX
alias name:
None
entrez id:
837
ensembl gene id:
ENSG00000196954
ucsc gene id:
uc001pid.2
refseq accession:
NM_001225
hgnc_id:
HGNC:1505
approved reserved:
1996-07-22
11q22.3
基因染色体位置图

CASP4(Caspase-4)是一种半胱氨酸蛋白酶(cysteine protease),属于炎症性caspase家族(inflammatory caspases),该家族还包括CASP1、CASP5和CASP12(人类中为假基因)。炎症性caspases的共同特点是参与先天免疫反应,通过激活炎症小体(inflammasome)和促炎细胞因子(如IL-1β和IL-18)的成熟来调控炎症反应。CASP4主要在细胞质中发挥作用,其表达产物是一种酶原(zymogen),需要被剪切激活后才能发挥功能。CASP4的生物学功能包括识别细胞内病原体相关分子模式(PAMPs)和损伤相关分子模式(DAMPs),特别是在响应革兰氏阴性菌感染时,它能直接结合细菌脂多糖(LPS)并激活非经典炎症小体通路,导致细胞焦亡(pyroptosis,一种程序性细胞死亡形式)。突变或异常表达的CASP4可能导致炎症反应失调,与多种疾病相关,如败血症(sepsis)、炎症性肠病(IBD)和自身免疫性疾病。CASP4过表达会增强炎症反应,可能加剧组织损伤或自身免疫疾病,而降低表达则可能削弱机体对感染的防御能力,增加病原体易感性。CASP4与CASP1功能部分重叠,但CASP4对人类LPS的反应更为直接。在基因家族中,炎症性caspases均含有CARD结构域(caspase recruitment domain,参与蛋白相互作用)和蛋白酶结构域,通过剪切底物蛋白发挥作用。CASP4的调控异常还可能影响其他炎症相关基因(如NLRP3、IL1B)的表达或激活,形成复杂的炎症信号网络。

This gene encodes a protein that is a member of the cysteine-aspartic acid protease (caspase) family. Sequential activation of caspases plays a central role in the execution-phase of cell apoptosis. Caspases exist as inactive proenzymes composed of a prodomain and a large and small protease subunit. Activation of caspases requires proteolytic processing at conserved internal aspartic residues to generate a heterodimeric enzyme consisting of the large and small subunits. This caspase is able to cleave and activate its own precursor protein, as well as caspase 1 precursor. When overexpressed, this gene induces cell apoptosis. Alternative splicing results in transcript variants encoding distinct isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008]

这个基因编码的蛋白质,它是半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶(胱天蛋白酶)家族的一个成员。胱天蛋白酶的顺序激活在细胞凋亡的执行阶段发挥中心作用。胱天蛋白酶存在的前结构域和大,小亚基蛋白酶组成为不活动酶原。胱天蛋白酶的活化需要蛋白酶解加工在保守内部天冬氨酸残基,以产生由大,小亚单位的异二聚体酶。此蛋白酶是能够切割并激活它自己的前体蛋白,以及胱天蛋白酶1的前体。当过度表达,这种基因诱导细胞凋亡。在转录剪接变异体结果不同编码的亚型。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CASP4基因的碱基序列:[NCBI]
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CASP4基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs9507       rs473086       rs474866       rs506761       rs509982       rs532244       rs540262       rs540813       rs543889       rs543923       rs546463       rs547584       rs552932       rs560891       rs564436       rs571407       rs574232      

CASP4基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGTTCCCTATGGCAGAAGG
59
TTCCTCTTCCTTCCAGTTCAG
60
AGAGCTGAAGAGATCTATCCA
58
TGGTCAAACTCTGTATTGCA
58
TGTTCCCTATGGCAGAAGG
59
TTCCTCTTCCTTCCAGTTCAG
60
AGAGCTGAAGAGATCTATCCA
58
TGGTCAAACTCTGTATTGCA
58
TGTTCCCTATGGCAGAAGG
59
CACCAGTGAGGAAATCTTTGC
60
ATTGCTTTCTGCTCTTCAACG
60
TAGAGCCCATTGTGCTGTC
60
GGAAGTATTTCGGAAGGTACAG
59
ATGGACAGTCGTTCTATGGT
59
TGTTCCCTATGGCAGAAGG
59
CACCAGTGAGGAAATCTTTGC
59
GGAAGTATTTCGGAAGGTACAG
59
ATGGACAGTCGTTCTATGGT
59
AGAGCTGAAGAGATCTATCCA
58
TGGTCAAACTCTGTATTGCA
58
      尚未收录相关数据

CASP4基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CASP4基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004197
A0A087WZP8 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
A0A087WZP8 (UniProtKB)
IEA
GO:0006915
A0A087WZP8 (UniProtKB)
IEA
GO:0042981
E9PMT1 (UniProtKB)
IEA
GO:0004197
H0YD34 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
H0YD34 (UniProtKB)
IEA
GO:0005576
P49662 (UniProtKB)
IEA
GO:0005739
P49662 (UniProtKB)
IDA
GO:0005783
P49662 (UniProtKB)
IDA
GO:0005789
P49662 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
P49662 (UniProtKB)
IEA
GO:0006915
P49662 (UniProtKB)
TAS
GO:0006915
P49662 (UniProtKB)
TAS
GO:0006954
P49662 (UniProtKB)
IEA
GO:0042981
P49662 (UniProtKB)
IEA
GO:0045087
P49662 (UniProtKB)
IEA
GO:0050727
P49662 (UniProtKB)
IBA
GO:0070059
P49662 (UniProtKB)
IMP
GO:0072557
P49662 (UniProtKB)
IBA
GO:0072559
P49662 (UniProtKB)
IBA
GO:0097169
P49662 (UniProtKB)
IBA
GO:0097193
P49662 (UniProtKB)
IMP
GO:1904646
P49662 (UniProtKB)
IMP
GO:0097153
P49662 (UniProtKB)
IBA

可能调控 CASP4基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Schizophrenia 0.12 1 0 CTD_human
Lymphoma, Non-Hodgkin 0.004734064 2 0 GAD
Alzheimer's Disease 0.00272435 1 0 LHGDN
Gastrointestinal Stromal Tumors 0.002638474 1 0 BeFree_GAD
Prostatic Neoplasms 0.002367032 1 0 GAD
Adenocarcinoma 0.002367032 1 0 GAD
melanoma 0.000814326 3 0 BeFree
Neuronal Ceroid-Lipofuscinoses 0.000271442 1 0 BeFree
Neuroblastoma 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinoma of lung 0.000271442 1 0 BeFree

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