CCL19 (C-C motif chemokine ligand 19)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CCL19
locus group:
protein-coding gene
location:
9p13.3
gene_family:
Chemokine ligands|Endogenous ligands
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ELC|MIP-3b|exodus-3|CKb11
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CC chemokine ligand 19|macrophage …
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HGNC:10617
approved reserved:
1997-02-19

基因染色体位置

基因染色体位置

9p13.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CCL19（Chemokine (C-C motif) ligand 19，趋化因子C-C基序配体19）是一种由趋化因子基因家族编码的小分子分泌蛋白，属于CC亚家族（β-趋化因子）。该家族成员均含有两个相邻的半胱氨酸（C-C结构），主要功能是通过与G蛋白偶联受体结合介导免疫细胞迁移。CCL19主要由淋巴器官（如淋巴结、脾脏）中的基质细胞和树突状细胞分泌，其受体为CCR7（趋化因子受体7）。CCL19的核心生物学功能是引导T细胞、树突状细胞和B细胞向次级淋巴器官定向迁移，从而调控适应性免疫应答的启动。其作用位点集中在淋巴组织的T细胞区（如淋巴结副皮质区），通过形成浓度梯度吸引表达CCR7的免疫细胞归巢。CCL19基因突变可能导致其蛋白结构异常，表现为免疫细胞迁移障碍，与某些原发性免疫缺陷病相关。该基因过表达常见于类风湿性关节炎、多发性硬化等自身免疫疾病，会加剧炎症部位淋巴细胞浸润；而表达降低则可能影响疫苗免疫效果或肿瘤免疫监视功能。在肿瘤微环境中，CCL19表达下降可能导致树突状细胞无法有效激活T细胞，促进免疫逃逸。值得注意的是，CCL19与同家族成员CCL21共享CCR7受体，但两者在组织分布和结合亲和力上存在差异。该基因家族（CC趋化因子家族）的共性包括：分子量8-10kDa、依赖二硫键维持空间结构、通过趋化作用调控白细胞运输。目前研究发现CCL19还具有非趋化功能，如促进树突状细胞成熟和调节淋巴管生成。在临床应用中，重组CCL19被探索作为肿瘤免疫治疗的佐剂，用于增强抗肿瘤T细胞反应。

This antimicrobial gene is one of several CC cytokine genes clustered on the p-arm of chromosome 9. Cytokines are a family of secreted proteins involved in immunoregulatory and inflammatory processes. The CC cytokines are proteins characterized by two adjacent cysteines. The cytokine encoded by this gene may play a role in normal lymphocyte recirculation and homing. It also plays an important role in trafficking of T cells in thymus, and in T cell and B cell migration to secondary lymphoid organs. It specifically binds to chemokine receptor CCR7. [provided by RefSeq, Sep 2014]

此抗微生物基因的簇号染色体上的p臂9细胞因子是参与免疫调节和炎症过程的分泌蛋白的一个家族几个CC细胞因子基因之一。在CC细胞因子是蛋白质特征在于两个相邻的半胱氨酸。由该基因编码的细胞因子可能在正常淋巴细胞再循环和归巢作用。它还在胸腺T细胞的贩卖中起重要作用，并在T细胞和B细胞迁移至次级淋巴器官。它特异性地结合趋化因子受体CCR7。 [由RefSeq的，2014年9月提供]

OMIM数据库中对CCL19基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCL19基因的介绍

基因序列

基因序列

CCL19基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CCL19基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2227302       rs2233870       rs2233871       rs2233872       rs2233873       rs2233874       rs2233877       rs3136658       rs3176813       rs3176814       rs3176815       rs10814132       rs10972196       rs12345128       rs34694628       rs72737166       rs74180568      

基因表达

基因表达

CCL19基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
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60
CAGTCTCTGGATGATGCGT
60
CCTGCTGTAGTGTTCACCA
60
CAGTCTCTGGATGATGCGT
60
CCTGCTGTAGTGTTCACCA
60
CAGTCTCTGGATGATGCGT
60
GCTGTAGTGTTCACCACAC
59
CAGTCTCTGGATGATGCGT
60
GCTGTAGTGTTCACCACAC
59
CAGTCTCTGGATGATGCGT
60
GCTGTAGTGTTCACCACAC
59
CAGTCTCTGGATGATGCGT
60
CCTGCTGTAGTGTTCACCA
60
TCTGGATGATGCGTTCTACC
60
CCTGCTGTAGTGTTCACCA
60
TCTGGATGATGCGTTCTACC
60
CCTGCTGTAGTGTTCACCA
60
TCTGGATGATGCGTTCTACC
60

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
NFKB1
CCL19
Activation
20953353
NFKB1
CCL19
Unknown
17182562
RELA
CCL19
Unknown
17182562
RELB
CCL19
Activation
20953353

基因本体信息

CCL19基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CCL19基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
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Q99731 (UniProtKB)
ISS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CCL19基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Dermatitis, Allergic Contact 0.12272435 1 0 CTD_human_LHGDN
Pneumonia 0.12 1 0 CTD_human
Hypersensitivity 0.12 1 0 CTD_human
Polymyositis 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Asthma 0.002909916 3 0 BeFree_GAD
Malignant lymphoma, lymphocytic, intermediate differentiation, diffuse 0.00272435 1 0 LHGDN
Infection 0.00272435 1 0 LHGDN
Leukemia, B-Cell 0.00272435 1 0 LHGDN
Inflammation 0.00272435 1 0 LHGDN
Sezary Syndrome 0.00272435 1 0 LHGDN

基因相关服务

基因相关服务

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