CCL27 (C-C motif chemokine ligand 27)

symbol:
CCL27
locus group:
protein-coding gene
location:
9p13.3
gene_family:
Chemokine ligands|Endogenous ligands
alias symbol:
ALP|ILC|CTACK|skinkine|ESkine|PESKY|CTAK
alias name:
CC chemokine ILC|IL-11 Ralpha-locu…
entrez id:
10850
ensembl gene id:
ENSG00000213927
ucsc gene id:
uc003zvm.1
refseq accession:
NM_006664
hgnc_id:
HGNC:10626
approved reserved:
1999-07-30
9p13.3
基因染色体位置图

CCL27(趋化因子配体27,Chemokine (C-C motif) ligand 27)是一种小分子分泌蛋白,属于CC趋化因子家族(CC chemokine family),该家族成员通常含有两个相邻的半胱氨酸(Cysteine)残基(简称CC结构),主要功能是招募免疫细胞到特定组织部位参与炎症或免疫调节。CCL27由角质形成细胞(皮肤表皮的Keratinocytes)持续分泌,通过与受体CCR10(趋化因子受体10)结合发挥作用,主导T细胞(特别是记忆T细胞)向皮肤归巢(Homing),维持皮肤免疫稳态。其生物学特点包括对特定免疫细胞的化学吸引(Chemotaxis)能力及参与局部免疫防御。突变可能导致CCL27-CCR10信号轴异常,与多种皮肤病相关,如牛皮癣(Psoriasis)和特应性皮炎(Atopic dermatitis),表现为炎症细胞浸润过度或皮肤屏障功能障碍。若CCL27过表达,会过度招募T细胞至皮肤,加剧炎症反应;而表达降低可能导致皮肤免疫监视(Immune surveillance)减弱,增加感染或肿瘤风险。CC趋化因子家族的共性是通过CCR受体介导白细胞迁移,参与炎症、感染和自身免疫病的调控。目前“归巢”等术语在免疫学中已广泛使用,无需额外标注英文。

This gene is one of several CC cytokine genes clustered on the p-arm of chromosome 9. Cytokines are a family of secreted proteins involved in immunoregulatory and inflammatory processes. The CC cytokines are proteins characterized by two adjacent cysteines. The protein encoded by this gene is chemotactic for skin-associated memory T lymphocytes. This cytokine may also play a role in mediating homing of lymphocytes to cutaneous sites. It specifically binds to chemokine receptor 10 (CCR10). Studies of a similar murine protein indicate that these protein-receptor interactions have a pivotal role in T cell-mediated skin inflammation. [provided by RefSeq, Sep 2014]

该基因是聚集在染色体的p臂9细胞因子是参与免疫调节和炎症过程的分泌蛋白的一个家族几个CC细胞因子基因之一。在CC细胞因子是蛋白质特征在于两个相邻的半胱氨酸。由该基因编码的蛋白质是用于皮肤相关的记忆性T淋巴细胞的趋化。这种细胞因子也可能在介导淋巴细胞归巢到皮肤位点发挥作用。它特异性地结合趋化因子受体10(CCR10)。类似鼠蛋白的研究表明,这些蛋白质 - 受体相互作用在T细胞介导的??皮肤炎症举足轻重的作用。 [由RefSeq的,2014年9月提供]

CCL27基因的碱基序列:[NCBI]
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CCL27基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs867811       rs883934       rs913835       rs913836       rs55831143       rs115978672       rs116804298       rs140791129       rs185220832       rs189951439       rs375167912       rs375452269       rs532455490       rs532569410       rs532629591       rs537917965       rs538845914      

CCL27基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTACAGCAGCATTCCTACTG
58
CTTCCTCAGTAGCTTGTCTG
58
AAACAGGAAGCATTCCTACTG
58
TCAGTAGCTTGTCTGAGAGTG
59
AACAGGAAGCATTCCTACTG
58
CTCAGTAGCTTGTCTGAGAG
57
CTACAGCAGCATTCCTACTG
58
TCCTCAGTAGCTTGTCTGAG
59
AAACAGGAAGCATTCCTACTG
58
CAGTAGCTTGTCTGAGAGTG
58
CTACAGCAGCATTCCTACTG
58
CTCAGTAGCTTGTCTGAGAG
57
      尚未收录相关数据

CCL27基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CCL27基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005576
Q9Y4X3 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
Q9Y4X3 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
Q9Y4X3 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
Q9Y4X3 (UniProtKB)
TAS
GO:0005615
Q9Y4X3 (UniProtKB)
IEA
GO:0006935
Q9Y4X3 (UniProtKB)
TAS
GO:0006955
Q9Y4X3 (UniProtKB)
IEA
GO:0007267
Q9Y4X3 (UniProtKB)
TAS
GO:0008009
Q9Y4X3 (UniProtKB)
IEA
GO:0060326
Q9Y4X3 (UniProtKB)
IEA

可能调控 CCL27基因的相关microRNA:     

Reactome

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Contact Dermatitis 0.12 1 0 CTD_human
Dermatitis, Atopic 0.008444493 3 0 BeFree_LHGDN
Dermatologic disorders 0.006263026 5 0 BeFree_LHGDN
Psoriasis 0.003538676 4 0 BeFree_LHGDN
Mycosis Fungoides 0.002995792 2 0 BeFree_LHGDN
Asthma 0.002367032 1 0 GAD
Chronic Lymphocytic Leukemia 0.002367032 1 0 GAD
Bronchiolitis, Viral 0.002367032 1 0 GAD
Respiratory Syncytial Virus Infections 0.002367032 1 0 GAD
Hypophosphatasia 0.001900093 7 0 BeFree

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