CD83 (CD83 molecule)

symbol:
CD83
locus group:
protein-coding gene
location:
6p23
gene_family:
CD molecules|V-set domain containing
alias symbol:
HB15|BL11
alias name:
None
entrez id:
9308
ensembl gene id:
ENSG00000112149
ucsc gene id:
uc003nbi.4
refseq accession:
NM_001040280
hgnc_id:
HGNC:1703
approved reserved:
1999-03-26
6p23
基因染色体位置图

CD83是一种I型跨膜糖蛋白,属于免疫球蛋白超家族(IgSF)成员,主要在成熟的树突状细胞(DC)、激活的B细胞和T细胞表面高表达。其生物学功能主要涉及免疫调节,作为共刺激分子参与T细胞活化及免疫突触形成,促进抗原提呈细胞(APC)与T细胞的相互作用。CD83的表达产物通过结合未知受体(推测为CD83配体)传递信号,增强T细胞增殖和细胞因子(如IL-2)分泌,对适应性免疫应答起正向调控作用。该基因的作用位点集中在免疫细胞膜表面及细胞间接触区域。CD83基因突变可能导致免疫缺陷或自身免疫性疾病,例如实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)模型中,CD83缺失会加剧炎症反应,而过度表达可减轻症状,表明其具有抗炎特性。CD83与疾病的关系包括:在类风湿关节炎、多发性硬化症等自身免疫病中表达异常;某些B细胞淋巴瘤中CD83过表达可能促进肿瘤免疫逃逸。若CD83过表达,可能抑制过度免疫反应,降低炎症损伤,但可能削弱抗肿瘤免疫;若表达降低,则可能导致免疫应答失调,增加自身免疫风险或感染易感性。CD83属于免疫球蛋白超家族,该家族共性为含有免疫球蛋白样结构域(Ig-like domains),参与细胞识别、黏附和信号传导。专业术语解释:跨膜糖蛋白(穿过细胞膜的蛋白质,带有糖链修饰)、免疫突触(免疫细胞间信号传递的特化接触区)、抗原提呈细胞(如树突状细胞,负责将抗原信息传递给T细胞)。目前中文术语“CD83”为通用名,无争议翻译。

The protein encoded by this gene is a single-pass type I membrane protein and member of the immunoglobulin superfamily of receptors. The encoded protein may be involved in the regulation of antigen presentation. A soluble form of this protein can bind to dendritic cells and inhibit their maturation. Three transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2011]

由该基因编码的蛋白质是一个单通的I型膜受体的免疫球蛋白超家族的蛋白质和构件。所编码的蛋白质可能参与抗原呈递的调节。这种蛋白质的可溶形式可以结合到树突细胞并抑制它们的成熟。已发现该基因编码不同亚型三个抄本变形。 [由RefSeq的,2011年10月提供]

CD83基因的碱基序列:[NCBI]
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CD83基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1526       rs9230       rs853357       rs853358       rs853359       rs853360       rs1050648       rs1050649       rs1050650       rs2064972       rs2230193       rs2235368       rs2235369       rs3041787       rs3209813       rs3734665       rs3734666      

CD83基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTTGAGAGTGACAGGATGC
58
AAATAACCAGAGCCAGCAG
58
AAATACAGAGCGGAGATTGTC
58
CCGTGCAAACTTACAAGTG
58
AATACAGAGCGGAGATTGTC
58
CCGTGCAAACTTACAAGTG
58
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
NFKB1
CD83
Activation
NFKB1
CD83
Unknown
PPARG
CD83
Activation
RELA
CD83
Activation
SP1
CD83
Unknown
SP3
CD83
Unknown

CD83基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CD83基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
A0A087WX61 (UniProtKB)
IEA
GO:0001817
Q01151 (UniProtKB)
IBA
GO:0005886
Q01151 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
Q01151 (UniProtKB)
TAS
GO:0006952
Q01151 (UniProtKB)
TAS
GO:0006959
Q01151 (UniProtKB)
TAS
GO:0007165
Q01151 (UniProtKB)
TAS
GO:0009897
Q01151 (UniProtKB)
IEA
GO:0014070
Q01151 (UniProtKB)
IEA
GO:0032713
Q01151 (UniProtKB)
IEA
GO:0032733
Q01151 (UniProtKB)
IEA
GO:0032743
Q01151 (UniProtKB)
IEA
GO:0043372
Q01151 (UniProtKB)
IEA

可能调控 CD83基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Rheumatoid Arthritis 0.123267234 4 12 BeFree_CTD_human_LHGDN
Dermatologic disorders 0.120271442 2 0 BeFree_CTD_human
Arsenic Poisoning 0.12 1 0 CTD_human
Juvenile arthritis 0.12 1 0 CTD_human
Chronic Lymphocytic Leukemia 0.002995792 2 0 BeFree_LHGDN
Crohn Disease 0.002995792 2 0 BeFree_LHGDN
Cervix carcinoma 0.002909916 2 0 BeFree_GAD
Adenocarcinoma 0.002909916 3 0 BeFree_GAD
Malignant lymphoma, lymphocytic, intermediate differentiation, diffuse 0.00272435 1 0 LHGDN
Cytomegalovirus Infections 0.00272435 1 0 LHGDN

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