CDH15 (cadherin 15)

symbol:
CDH15
locus group:
protein-coding gene
location:
16q24.3
gene_family:
Major cadherins
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
1013
ensembl gene id:
ENSG00000129910
ucsc gene id:
uc002fmt.4
refseq accession:
NM_004933
hgnc_id:
HGNC:1754
approved reserved:
1994-12-14
16q24.3
基因染色体位置图

CDH15(Cadherin 15)是一种钙依赖性细胞黏附分子,属于钙黏蛋白(Cadherin)基因家族。该家族成员以介导细胞间黏附为主要功能,通过钙离子依赖的方式参与组织形成、细胞极性和信号传导等生物学过程。CDH15主要在肌肉组织中表达,尤其是骨骼肌和心肌,其编码的蛋白通过同源结合方式促进肌细胞间的黏附,对肌肉发育和功能维持至关重要。CDH15的突变可能导致其黏附功能受损,与某些肌肉疾病相关,如先天性肌营养不良或肌纤维发育异常。若CDH15表达降低,可能破坏肌细胞间的连接,影响肌肉组织的完整性和收缩功能;而过表达则可能干扰正常的细胞迁移或分化过程,例如在胚胎发育中导致肌肉形态发生异常。CDH15还可能与某些癌症的转移抑制有关,因其黏附特性可抑制肿瘤细胞脱离原发灶。该基因家族(钙黏蛋白家族)的共性包括:拥有重复的细胞外钙结合结构域、高度保守的胞内区(与连环蛋白结合以锚定细胞骨架),以及依赖钙离子实现细胞选择性黏附。研究CDH15有助于理解肌肉疾病的分子机制,并为相关治疗提供靶点。

This gene is a member of the cadherin superfamily of genes, encoding calcium-dependent intercellular adhesion glycoproteins. Cadherins consist of an extracellular domain containing 5 cadherin domains, a transmembrane region, and a conserved cytoplasmic domain. Transcripts from this particular cadherin are expressed in myoblasts and upregulated in myotubule-forming cells. The protein is thought to be essential for the control of morphogenetic processes, specifically myogenesis, and may provide a trigger for terminal muscle cell differentiation. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因是基因的钙粘蛋白家族的成员,编码钙依赖性细胞间粘附糖蛋白。钙黏着蛋白由包含5钙粘蛋白结构域,跨膜区,和一个保守的胞质域的胞外结构域组成。从这个特定钙粘蛋白转录物在成肌细胞表达和肌管形成细胞上调。该蛋白被认为是对形态发生过程的控制必不可少的,特别是肌形成,并且可以提供用于终端肌细胞分化的触发器。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CDH15基因的碱基序列:[NCBI]
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CDH15基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs729200       rs729201       rs729202       rs882650       rs1109821       rs2270415       rs2270416       rs2287354       rs2287355       rs2287356       rs2287357       rs2287358       rs2287359       rs3785413       rs3785414       rs3785415       rs3815615      

CDH15基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GATCGCTTCAGGCTAAGAG
58
ACAACTACAATCTCCAGGTC
57
ACTTCATCAATGATGGCTTGG
59
CGTAGTCATAGATGAGGGCT
59
GATCGCTTCAGGCTAAGAG
58
ACAACTACAATCTCCAGGTC
57
GTATCCGAGAACCACAAGC
58
AAGTCTAAAGGAGGATTTGGG
57
GATCGCTTCAGGCTAAGAG
58
CAACTACAATCTCCAGGTCC
58
TCATCAATGATGGCTTGGAG
58
CCTCGTAGTCATAGATGAGGG
59
ATCAGCGTATCCGAGAACC
59
TTTGAGATGGCATCTCGCT
60
GATCGCTTCAGGCTAAGAG
58
CAACTACAATCTCCAGGTCC
58
ACTTCATCAATGATGGCTTGG
59
CGTAGTCATAGATGAGGGCTG
60
TGATCGCTTCAGGCTAAGAG
60
AACTACAATCTCCAGGTCCG
59
      尚未收录相关数据

CDH15基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CDH15基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
P55291 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
P55291 (UniProtKB)
IPI
GO:0005886
P55291 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
P55291 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
P55291 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
P55291 (UniProtKB)
TAS
GO:0005901
P55291 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
P55291 (UniProtKB)
TAS
GO:0007156
P55291 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
P55291 (UniProtKB)
IEA
GO:0031594
P55291 (UniProtKB)
IEA
GO:0034332
P55291 (UniProtKB)
TAS
GO:0051149
P55291 (UniProtKB)
TAS
GO:0070062
P55291 (UniProtKB)
IDA

可能调控 CDH15基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Mental Retardation, Autosomal Dominant 3 0.36 1 3 CLINVAR_CTD_human_UNIPROT
Polycystic Ovary Syndrome 0.12 1 0 CTD_human
Medium-chain acyl-coenzyme A dehydrogenase deficiency 0.002714419 10 0 BeFree
Heart failure 0.002638474 1 1 BeFree_GAD
Cerebral Hemorrhage 0.002367032 1 0 GAD
Cerebrovascular accident 0.002367032 1 0 GAD
Intracranial Hemorrhages 0.002367032 1 0 GAD
Subarachnoid Hemorrhage 0.002367032 1 0 GAD
Hereditary macular dystrophy 0.001900093 7 0 BeFree
Age related macular degeneration 0.001900093 7 0 BeFree

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山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

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