CHAF1B (chromatin assembly factor 1 subunit B)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CHAF1B
locus group:
protein-coding gene
location:
21q22.12-q22.13
gene_family:
WD repeat domain containing
alias symbol:
CAF1P60|CAF-1|CAF1|CAF1A|MPP7|MPHOSPH7
alias name:
M-phase phosphoprotein 7|Chromatin…
entrez id:
8208
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ENSG00000159259
ucsc gene id:
uc002yvj.4
refseq accession:
NM_005441
hgnc_id:
HGNC:1911
approved reserved:
1999-09-29

基因染色体位置

基因染色体位置

21q22.12-q22.13
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CHAF1B（染色质组装因子1亚基B）是染色质组装因子1（CAF-1）复合物的一个关键亚基，属于CAF-1基因家族。CAF-1复合物由CHAF1A、CHAF1B和RBBP4三个亚基组成，主要功能是在DNA复制和修复过程中介导组蛋白H3和H4的组装，从而促进染色质结构的形成和维持基因组稳定性。CHAF1B在细胞周期S期表达较高，通过与组蛋白和新合成的DNA结合，确保染色质正确组装，这对DNA复制、基因表达调控和表观遗传修饰至关重要。CHAF1B的突变或表达异常可能导致染色质组装缺陷，进而引发基因组不稳定性、复制压力增加以及细胞周期紊乱。研究发现，CHAF1B的突变或低表达与某些癌症（如乳腺癌、结直肠癌）的发生发展相关，可能通过影响DNA修复和表观遗传调控促进肿瘤进展。相反，CHAF1B的过表达可能加速细胞增殖，在某些癌症中与不良预后相关。此外，CHAF1B还参与干细胞维持和分化过程，其表达水平异常可能影响细胞命运决定。CAF-1基因家族的共性在于它们共同参与染色质组装和维持，调控染色质动态变化，并在DNA代谢过程中发挥核心作用。CHAF1B作为该家族的重要成员，其功能异常不仅影响染色质结构，还可能通过干扰其他基因的表达或信号通路（如p53通路）对细胞产生广泛影响。因此，CHAF1B是研究染色质生物学、癌症发生和细胞周期调控的重要靶点。

Chromatin assembly factor I (CAF-I) is required for the assembly of histone octamers onto newly-replicated DNA. CAF-I is composed of three protein subunits, p50, p60, and p150. The protein encoded by this gene corresponds to the p60 subunit and is required for chromatin assembly after replication. The encoded protein is differentially phosphorylated in a cell cycle-dependent manner. In addition, it is normally found in the nucleus except during mitosis, when it is released into the cytoplasm. This protein is a member of the WD-repeat HIR1 family and may also be involved in DNA repair. [provided by RefSeq, Jul 2008]

None

OMIM数据库中对CHAF1B基因的介绍     Wikipedia数据库中对CHAF1B基因的介绍

基因序列

基因序列

CHAF1B基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CHAF1B基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs8596       rs9108       rs170144       rs190068       rs218623       rs218624       rs218625       rs218626       rs218627       rs218628       rs218629       rs218630       rs218631       rs218646       rs218647       rs218649       rs218650      

基因表达

基因表达

CHAF1B基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTTATGTCCAAGGAGTAACCTG
59
ACAGAGTGAGACTGTGTCTG
59
CAGTATACAGAAGAAGCGTGTG
59
GTAGCTTCTTGCCTCTCCT
59
AGTATACAGAAGAAGCGTGTG
57
GTAGCTTCTTGCCTCTCCT
58
CAGTGACATTTCATGGTCCA
58
CTCAAATGTCACAAATGAGCAG
59
CAGTGACATTTCATGGTCCAG
59
CTCAAATGTCACAAATGAGCAG
59
TGAAGGAGAGGCAAGAAGC
60
TCGGGAGTGAAACTCAGTC
59
AAGTTATGTCCAAGGAGTAACC
58
AGAGTGAGACTGTGTCTGTC
59
CAATGTCAGGATCTGGAAGG
58
GTATGACGAGCAAGATTGGA
57
AATGTCAGGATCTGGAAGGT
58
GGTATGACGAGCAAGATTGG
58
AGTATACAGAAGAAGCGTGTG
58
GTAGCTTCTTGCCTCTCCT
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CHAF1B基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CHAF1B基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000790
Q13112 (UniProtKB)
IDA
GO:0002230
Q13112 (UniProtKB)
IMP
GO:0003682
Q13112 (UniProtKB)
TAS
GO:0005634
Q13112 (UniProtKB)
NAS
GO:0005654
Q13112 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q13112 (UniProtKB)
NAS
GO:0006260
Q13112 (UniProtKB)
IEA
GO:0006281
Q13112 (UniProtKB)
IEA
GO:0006335
Q13112 (UniProtKB)
IDA
GO:0006351
Q13112 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
Q13112 (UniProtKB)
IEA
GO:0006461
Q13112 (UniProtKB)
TAS
GO:0007049
Q13112 (UniProtKB)
IEA
GO:0031497
Q13112 (UniProtKB)
IDA
GO:0033186
Q13112 (UniProtKB)
IDA
GO:0042393
Q13112 (UniProtKB)
IBA
GO:0042393
Q13112 (UniProtKB)
NAS
GO:0043234
Q13112 (UniProtKB)
IDA
GO:0051082
Q13112 (UniProtKB)
TAS
GO:0098779
Q13112 (UniProtKB)
IGI
GO:0098792
Q13112 (UniProtKB)
IMP
GO:0005654
Q13112 (UniProtKB)
IDA
GO:0005829
Q13112 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CHAF1B基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Down Syndrome 0.123267234 4 0 BeFree_CTD_human_LHGDN
Muscle Weakness 0.12 1 0 CTD_human
Mouth Diseases 0.12 1 0 CTD_human
Poor school performance 0.12 0 1 CLINVAR
Alzheimer's Disease 0.00272435 1 0 LHGDN
Squamous cell carcinoma of tongue 0.000271442 1 0 BeFree
Mammary Neoplasms 0.000271442 1 0 BeFree
DOWN SYNDROME CRITICAL REGION 0.000271442 1 0 BeFree
Lupus Erythematosus, Systemic 0.000271442 1 0 BeFree
Aseptic Meningitis 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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