CHFR (checkpoint with forkhead and ring finger domains)

symbol:
CHFR
locus group:
protein-coding gene
location:
12q24.33
gene_family:
Ring finger proteins
alias symbol:
FLJ10796|RNF196
alias name:
None
entrez id:
55743
ensembl gene id:
ENSG00000072609
ucsc gene id:
uc001ulf.3
refseq accession:
NM_001161344
hgnc_id:
HGNC:20455
approved reserved:
2003-02-14
12q24.33
基因染色体位置图

CHFR(Checkpoint with Forkhead and Ring Finger Domains)是一个重要的细胞周期检查点基因,属于Forkhead盒(FOX)基因家族中的一员。该基因编码的蛋白质含有叉头结构域(Forkhead domain)和环指结构域(RING finger domain),主要参与调控有丝分裂的进程,特别是在纺锤体组装检查点(Spindle Assembly Checkpoint, SAC)中发挥关键作用。CHFR的功能是在有丝分裂早期监测微管-着丝粒的附着状态,若检测到异常,会延迟染色体凝集和核膜破裂,从而确保基因组稳定性。CHFR的表达产物通过泛素化修饰靶蛋白(如PLK1和Aurora A激酶)来调控其降解,进而影响细胞周期进程。CHFR的突变或表观遗传沉默(如启动子甲基化)会导致其功能丧失,从而破坏细胞周期检查点,增加基因组不稳定性,这与多种癌症的发生发展密切相关,包括结直肠癌、胃癌、肺癌等。当CHFR表达降低或缺失时,细胞无法正常阻滞有丝分裂,可能导致非整倍体和染色体异常,促进肿瘤发生。相反,CHFR过表达可能增强细胞对有丝分裂应激的敏感性,导致细胞周期阻滞或凋亡,理论上可能抑制肿瘤生长。CHFR属于FOX基因家族,该家族成员均含有保守的叉头结构域,主要作为转录因子参与调控细胞增殖、分化、代谢和应激反应等生物学过程。FOX家族基因的异常表达或突变常与发育障碍、代谢性疾病和癌症相关。CHFR作为该家族中独特的一员,因其直接参与细胞周期调控而成为癌症研究的重点靶点。

This gene encodes an E3 ubiquitin-protein ligase required for the maintenance of the antephase checkpoint that regulates cell cycle entry into mitosis and, therefore, may play a key role in cell cycle progression and tumorigenesis. The encoded protein has an N-terminal forkhead-associated domain, a central RING-finger domain, and a cysteine-rich C-terminal region. Alternatively spliced transcript variants that encode different protein isoforms have been described. [provided by RefSeq, Mar 2014]

该基因编码的维持,调节细胞周期进入有丝分裂,因此,可能在细胞周期进展和肿瘤发生的关键作用antephase检查点的所需要的E3泛素 - 蛋白连接酶。所编码的蛋白质具有一个N-末端叉头相关联的域,一个中心环指结构域和富含半胱氨酸的C末端区域。编码不同蛋白同种型的可变剪接转录物变体已有描述。 [由RefSeq的,2014年3月提供]

CHFR基因的碱基序列:[NCBI]
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CHFR基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs3685       rs8021       rs15638       rs1045979       rs1046106       rs1046130       rs2062161       rs2062162       rs2062163       rs2076920       rs2128609       rs2279313       rs2291253       rs2291254       rs2291255       rs2306536       rs2306537      

CHFR基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAAGAATCCTTTGATACCTCAGG
59
CTCAAAGCACACCTGAGTG
59
TCTGAAATTTGGCTCCCAG
58
CTCCAGAGACCAGTTTATTGC
59
TGTGATTACAGGGTCTGGG
59
AAAGCTGGAGACTTCATCAC
58
GATCAGGAGGATTTGGAGC
58
CGGTTTGGGCATTTCTACG
60
GAAGGGAGTTCAGAGGACC
59
AGACCGCACCTAATGTCTG
60
CTTTCTGCCACCTGTACTG
58
CTGGTTGCCAGGTAATTCTG
59
GCTGTCTGATTACAGAGTCAC
59
ATACTGATAGGTCAGCTCACG
59
TCAACCTGGGTGACAAGTG
60
GTTGCCAGGTAATTCTTCAGG
59
GAAGATACCAGCACCAGTG
57
ACACCAAGTAGATGACATCC
57
GGAAGAATGAACCGGAACAC
59
GCACCTGAGGTATCAAAGGA
60
      尚未收录相关数据

CHFR基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CHFR基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0008270
A0A096P6K8 (UniProtKB)
IEA
GO:0000166
Q96EP1 (UniProtKB)
IDA
GO:0000209
Q96EP1 (UniProtKB)
IDA
GO:0004842
Q96EP1 (UniProtKB)
IDA
GO:0004842
Q96EP1 (UniProtKB)
IDA
GO:0005515
Q96EP1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q96EP1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q96EP1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q96EP1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q96EP1 (UniProtKB)
IDA
GO:0006511
Q96EP1 (UniProtKB)
IBA
GO:0007067
Q96EP1 (UniProtKB)
IEA
GO:0007093
Q96EP1 (UniProtKB)
TAS
GO:0007093
Q96EP1 (UniProtKB)
IMP
GO:0007093
Q96EP1 (UniProtKB)
IMP
GO:0008270
Q96EP1 (UniProtKB)
IEA
GO:0016605
Q96EP1 (UniProtKB)
IDA
GO:0016874
Q96EP1 (UniProtKB)
IEA
GO:0019941
Q96EP1 (UniProtKB)
IDA
GO:0031398
Q96EP1 (UniProtKB)
IEA
GO:0031648
Q96EP1 (UniProtKB)
IEA
GO:0032436
Q96EP1 (UniProtKB)
IEA
GO:0051301
Q96EP1 (UniProtKB)
IEA
GO:0061630
Q96EP1 (UniProtKB)
IEA

可能调控 CHFR基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Stomach Neoplasms 0.125720142 3 0 BeFree_CTD_human_LHGDN
Non-Small Cell Lung Carcinoma 0.121085767 4 0 BeFree_CTD_human
Endometrial Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Colorectal Neoplasms 0.0054487 2 0 LHGDN
Squamous cell carcinoma 0.003538676 3 0 BeFree_LHGDN
Malignant neoplasm of stomach 0.003257302 12 0 BeFree
Lung Neoplasms 0.002995792 2 0 BeFree_LHGDN
Esophageal Neoplasms 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Mammary Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Carcinogenesis 0.002714419 10 0 BeFree

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