CHST11 (carbohydrate sulfotransferase 11)

symbol:
CHST11
locus group:
protein-coding gene
location:
12q23.3
gene_family:
Sulfotransferases, membrane-bound
alias symbol:
C4ST1|C4St-1|C4ST|HSA269537
alias name:
chondroitin 4-sulfotransferase 1
entrez id:
50515
ensembl gene id:
ENSG00000171310
ucsc gene id:
uc001tkz.4
refseq accession:
NM_018413
hgnc_id:
HGNC:17422
approved reserved:
2003-08-06
12q23.3
基因染色体位置图

CHST11(碳水化合物磺基转移酶11,Carbohydrate Sulfotransferase 11)是一种编码硫酸基转移酶的基因,属于CHST基因家族(Carbohydrate Sulfotransferase Family)。该家族的主要功能是通过催化硫酸基团从供体分子(如PAPS,3'-磷酸腺苷-5'-磷酰硫酸)转移到碳水化合物底物(如糖胺聚糖GAGs)上,从而参与细胞外基质的修饰和信号传导。CHST11的生物学功能集中在硫酸化软骨素(Chondroitin Sulfate)的合成过程中,特别是在4-O位点的硫酸化修饰(4-sulfation),这种修饰对软骨素的生物活性和结构稳定性至关重要。CHST11的作用位点主要在细胞的高尔基体中,其表达产物通过调控硫酸化水平影响细胞外基质的组成,进而参与细胞黏附、迁移、增殖以及组织发育(如骨骼和软骨形成)。突变或功能异常可能导致硫酸化失衡,与多种疾病相关,例如骨骼发育异常(如短指症)、关节炎、肿瘤转移和心血管疾病。CHST11过表达可能增强软骨素的硫酸化,导致细胞外基质过度硬化,影响组织弹性(如血管或关节软骨),而表达降低则可能削弱基质的结构支持功能,加速组织退化。在癌症中,CHST11的异常表达可通过改变肿瘤微环境促进侵袭和转移。该基因家族(CHST)的共性在于均依赖PAPS作为硫酸基供体,并特异性修饰不同糖链结构,参与从神经发育到免疫调节的广泛生理过程。专业术语解释:硫酸化(Sulfation)指在分子中添加硫酸基团的生化过程;糖胺聚糖(GAGs)是一类带负电的多糖,存在于细胞表面和基质中;PAPS是硫酸化的通用供体分子。若中文术语不准确,可参考英文原词(如“硫酸化”对应Sulfation)。

The protein encoded by this gene belongs to the sulfotransferase 2 family. It is localized to the golgi membrane, and catalyzes the transfer of sulfate to position 4 of the N-acetylgalactosamine (GalNAc) residue of chondroitin. Chondroitin sulfate constitutes the predominant proteoglycan present in cartilage, and is distributed on the surfaces of many cells and extracellular matrices. A chromosomal translocation involving this gene and IgH, t(12;14)(q23;q32), has been reported in a patient with B-cell chronic lymphocytic leukemia. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2011]

由该基因编码的蛋白质属于磺基转移酶2家族。它被定位于高尔基体膜,并催化硫酸盐转移到软骨素N-乙酰胺(GalNAc)残基的4位。硫酸软骨素构成主要的蛋白聚糖存在于软骨中,并分布许多细胞和细胞外基质的表面上。染色体易位涉及此基因和IgH基因,叔(12; 14)(Q23; Q32),据报道,在B细胞慢性淋巴细胞白血病的患者。已发现该基因编码不同亚型选择性剪接转录变异体。 [由RefSeq的,2011年8月提供]

CHST11基因的碱基序列:[NCBI]
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CHST11基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs7847       rs10179       rs167490       rs167510       rs182587       rs192859       rs312136       rs312137       rs312138       rs312139       rs312140       rs312141       rs312142       rs312143       rs312144       rs312145       rs312146      

CHST11基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AACGACTCTGTCTGAAGCT
58
CGCCTGTGAATAAGTTGCT
58
TACAACCCAATCCAGCTGG
60
CAGTAGATGAGCTCGTGGT
59
TGAGCAAGCAACTTATTCACAG
60
TTACCAAATGCAACTCGCG
60
TCCTGGTCATCTTCTATTTCCA
59
CACACCAAAGGGATTCCTC
58
TTTCCAAATCATGCGGAGG
59
GTTGTAGAGTTCCTGCAGG
58
TACAACCCAATCCAGCTGG
60
CAGTAGATGAGCTCGTGGT
59
TTTCCAAATCATGCGGAGG
59
GTTGTAGAGTTCCTGCAGG
58
AAGTATGTTGCACCCAGTC
57
GTTGTAGAGTTCCTGCAGG
57
TACAACCCAATCCAGCTGG
59
CAGTAGATGAGCTCGTGGT
58
TACAACCCAATCCAGCTGG
60
GTAGATGAGCTCGTGGTCC
60
      尚未收录相关数据

CHST11基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CHST11基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0008146
F8VRG6 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
F8VRG6 (UniProtKB)
IEA
GO:0016051
F8VRG6 (UniProtKB)
IEA
GO:0008146
F8VXK3 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
F8VXK3 (UniProtKB)
IEA
GO:0016051
F8VXK3 (UniProtKB)
IEA
GO:0008146
F8VXK7 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
F8VXK7 (UniProtKB)
IEA
GO:0016051
F8VXK7 (UniProtKB)
IEA
GO:0000139
Q9NPF2 (UniProtKB)
TAS
GO:0001537
Q9NPF2 (UniProtKB)
IDA
GO:0002063
Q9NPF2 (UniProtKB)
IEA
GO:0007585
Q9NPF2 (UniProtKB)
IEA
GO:0009791
Q9NPF2 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
Q9NPF2 (UniProtKB)
IDA
GO:0016021
Q9NPF2 (UniProtKB)
NAS
GO:0016051
Q9NPF2 (UniProtKB)
IEA
GO:0030206
Q9NPF2 (UniProtKB)
IDA
GO:0030206
Q9NPF2 (UniProtKB)
TAS
GO:0030512
Q9NPF2 (UniProtKB)
IEA
GO:0033037
Q9NPF2 (UniProtKB)
IEA
GO:0036342
Q9NPF2 (UniProtKB)
IEA
GO:0042127
Q9NPF2 (UniProtKB)
IEA
GO:0042733
Q9NPF2 (UniProtKB)
IEA
GO:0043066
Q9NPF2 (UniProtKB)
IEA
GO:0047756
Q9NPF2 (UniProtKB)
IDA
GO:0047756
Q9NPF2 (UniProtKB)
TAS
GO:0048589
Q9NPF2 (UniProtKB)
IEA
GO:0048703
Q9NPF2 (UniProtKB)
IEA
GO:0050659
Q9NPF2 (UniProtKB)
IEA

可能调控 CHST11基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Pregnancy Complications, Parasitic 0.002367032 1 0 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Placenta Disorders 0.002367032 1 0 GAD
Malignant neoplasm of prostate 0.002367032 1 0 GAD
Malaria, Falciparum 0.002367032 1 0 GAD
Marijuana Abuse 0.002367032 1 1 GAD
Malignant neoplasm of breast 0.000542884 2 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Invasive breast carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Chronic Lymphocytic Leukemia 0.000271442 1 0 BeFree

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