CHST15 (carbohydrate sulfotransferase 15)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CHST15
locus group:
protein-coding gene
location:
10q26.13
gene_family:
Sulfotransferases, membrane-bound
alias symbol:
GALNAC4S-6ST|BRAG|KIAA0598
alias name:
B cell RAG associated protein|N-ac…
entrez id:
51363
ensembl gene id:
ENSG00000182022
ucsc gene id:
uc001lhn.4
refseq accession:
NM_015892
hgnc_id:
HGNC:18137
approved reserved:
2009-05-20

基因染色体位置

基因染色体位置

10q26.13
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CHST15（碳水化合物磺基转移酶15）是一种编码碳水化合物磺基转移酶的基因，属于碳水化合物磺基转移酶（CHST）基因家族。该家族的主要功能是通过催化硫酸基团转移到碳水化合物分子（如糖胺聚糖）上，从而调节细胞外基质的结构和功能。CHST15特异性催化硫酸基团转移到软骨素聚糖的特定位置，形成硫酸软骨素E（CSE），这种修饰在细胞信号传导、细胞黏附和炎症反应中起重要作用。CHST15主要在结缔组织、软骨和某些免疫细胞中表达，其表达产物参与调控细胞外基质的组装和细胞间相互作用。突变或异常表达可能导致硫酸软骨素的结构改变，进而影响组织弹性和细胞行为。研究表明，CHST15的过表达与多种疾病相关，如纤维化疾病、炎症性肠病和某些癌症（如胰腺癌和胶质瘤），其机制可能与异常的细胞外基质重塑或炎症信号通路激活有关。相反，CHST15表达降低可能影响组织修复和再生能力，导致软骨或结缔组织功能异常。此外，CHST15还参与调节免疫细胞的迁移和活化，其表达水平变化可能影响炎症反应的程度和持续时间。CHST基因家族的成员通常具有保守的磺基转移酶结构域，并在糖胺聚糖的硫酸化修饰中发挥关键作用，从而影响细胞外基质的生物活性和细胞行为。CHST15作为该家族的一员，其功能异常可能通过改变硫酸软骨素的结构而间接影响其他依赖细胞外基质的信号通路或分子相互作用。

Chondroitin sulfate (CS) is a glycosaminoglycan which is an important structural component of the extracellular matrix and which links to proteins to form proteoglycans. Chondroitin sulfate E (CS-E) is an isomer of chondroitin sulfate in which the C-4 and C-6 hydroxyl groups are sulfated. This gene encodes a type II transmembrane glycoprotein that acts as a sulfotransferase to transfer sulfate to the C-6 hydroxal group of chondroitin sulfate. This gene has also been identified as being co-expressed with RAG1 in B-cells and as potentially acting as a B-cell surface signaling receptor. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding distinct isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2012]

硫酸软骨素（CS）是一种糖胺聚糖是细胞外基质的一个重要的结构成分和可链接到蛋白质形成蛋白聚糖。硫酸软骨素E（CS-E）的硫酸软骨素的异构体，其中C-4和C-6羟基被硫酸化。这个基因编码的II型跨膜糖蛋白充当磺硫酸转移到硫酸软骨素的C 6 hydroxal基。这种基因也被鉴定为共表达在B细胞RAG1和作为潜在的充当B细胞表面信号的受体。在多个转录剪接变异体结果不同编码的亚型。 [由RefSeq的，2012年7月提供]

OMIM数据库中对CHST15基因的介绍     Wikipedia数据库中对CHST15基因的介绍

基因序列

基因序列

CHST15基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CHST15基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs10899       rs12915       rs3862337       rs3934463       rs3934464       rs3934974       rs3935216       rs3935217       rs3935499       rs3935717       rs3935728       rs3936165       rs4072153       rs4072194       rs4072195       rs4072196       rs4072197      

基因表达

基因表达

CHST15基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTTCTCATTCTTCGCCTGG
58
TTAAGGGCCCTAGGTTCAG
58
GCTTCTCAGGAAATCTGGC
59
GCATCTGTGAAGATCTCCC
58
CTTCATCCACGCCTTTCAG
59
GAGATAGTCTGAGTACAACCTCTC
60
CTTCATCCACGCCTTTCAG
59
GAGATAGTCTGAGTACAACCTCTC
60
TTTCTCATTCTTCGCCTGG
58
TTAAGGGCCCTAGGTTCAG
58
CTTCATCCACGCCTTTCAG
58
GAGATAGTCTGAGTACAACCTCTC
59
CTTCATCCACGCCTTTCAG
59
AGATAGTCTGAGTACAACCTCTC
59
CTTCATCCACGCCTTTCAG
59
AGATAGTCTGAGTACAACCTCTC
59
CTTCTCAGGAAATCTGGCA
57
GCATCTGTGAAGATCTCCC
58
TTCTCATTCTTCGCCTGGA
59
CTTAAGGGCCCTAGGTTCAG
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CHST15基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CHST15基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000139
Q7LFX5 (UniProtKB)
TAS
GO:0016021
Q7LFX5 (UniProtKB)
NAS
GO:0019319
Q7LFX5 (UniProtKB)
IDA
GO:0030206
Q7LFX5 (UniProtKB)
TAS
GO:0050656
Q7LFX5 (UniProtKB)
IDA
GO:0050659
Q7LFX5 (UniProtKB)
IDA
GO:0050659
Q7LFX5 (UniProtKB)
TAS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CHST15基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Ovarian Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Glioblastoma 0.000271442 1 0 BeFree
Epithelial ovarian cancer 0.000271442 1 0 BeFree
Astrocytoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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