CHTF18 (chromosome transmission fidelity factor 18)

symbol:
CHTF18
locus group:
protein-coding gene
location:
16p13.3
gene_family:
AAA ATPases (ATPases associated with diverse cellular activities)
alias symbol:
CHL12|C321D2.4|Ctf18
alias name:
None
entrez id:
63922
ensembl gene id:
ENSG00000127586
ucsc gene id:
uc002cke.4
refseq accession:
NM_022092
hgnc_id:
HGNC:18435
approved reserved:
2003-04-04
16p13.3
基因染色体位置图

CHTF18(Chromosome Transmission Fidelity Factor 18)是一种在DNA复制和染色体稳定性维持中起关键作用的基因,属于RFC(Replication Factor C)基因家族。RFC家族成员通常编码复制因子C复合物的亚基,该复合物在DNA复制和修复过程中负责加载和卸载PCNA(增殖细胞核抗原),从而确保DNA复制的准确性和基因组稳定性。CHTF18编码的蛋白是RFC复合物的一个亚基,与其他RFC亚基(如RFC1、RFC2、RFC3、RFC4和RFC5)共同发挥作用。CHTF18的突变或表达异常可能导致DNA复制错误、染色体不稳定性和基因组损伤,进而增加癌症风险。研究表明,CHTF18的突变与某些遗传性疾病(如小头畸形和智力障碍)以及多种癌症(如结直肠癌和乳腺癌)的发生有关。CHTF18过表达可能干扰正常的DNA复制和修复机制,导致基因组不稳定性和肿瘤发生;而降低表达则可能导致复制叉停滞和DNA损伤积累,同样增加癌症风险。此外,CHTF18的表达水平变化还可能影响其他与DNA复制和修复相关的基因(如BRCA1、BRCA2和TP53)的功能,进一步加剧基因组不稳定性。RFC基因家族的共性在于它们编码的蛋白均参与DNA复制、修复和染色体分离过程,确保遗传信息的准确传递。CHTF18作为该家族的一员,其功能异常可能对细胞周期调控和基因组完整性产生深远影响。

CHTF18, CHTF8 (MIM 613202), and DCC1 (DSCC1; MIM 613203) are components of an alternative replication factor C (RFC) (see MIM 600404) complex that loads PCNA (MIM 176740) onto DNA during S phase of the cell cycle (Merkle et al., 2003 [PubMed 12766176]; Bermudez et al., 2003 [PubMed 12930902]).[supplied by OMIM, Dec 2009]

CHTF18,CHTF8(MIM 613202)和DCC1(DSCC1; MIM 613203)是另一种复制因子C(RFC)的组成部分(见MIM 600404),在S期加载PCNA(MIM 176740)到DNA复合物细胞周期(梅克尔等,2003 [搜索PubMed 12766176];伯姆德兹等,2003 [搜索PubMed 12930902])。[由OMIM,2009年12月供给]

CHTF18基因的碱基序列:[NCBI]
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CHTF18基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs531278       rs546305       rs569951       rs577688       rs742317       rs742318       rs742319       rs742320       rs2063911       rs2272896       rs2272898       rs2272899       rs2277894       rs2277895       rs2277896       rs2277897       rs2277898      

CHTF18基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCACAGCGATTCTACCGTG
60
GTTGTCAAACAAGCCCTGG
60
TCACAGCGATTCTACCGTG
60
GTTGTCAAACAAGCCCTGG
60
GTCATCGATGAGATCGACG
58
GTTCAGGATGCTCAGGAGG
60
TCACAGCGATTCTACCGTG
60
GTTGTCAAACAAGCCCTGG
60
TGATTTCCACAACCAGTTCG
59
AGTTCAGCCTCTTGACCAC
60
CTCCCTGAAGAAGCAGGTC
60
GGGTGTCTGAAAGCTTCTG
59
GAAGCTTTCAGACACCCTG
59
GGTTGGTGAAGTCATCACTG
59
TCACAGCGATTCTACCGTG
60
GTTGTCAAACAAGCCCTGG
60
GAAGCTTTCAGACACCCTG
59
GGTTGGTGAAGTCATCACTG
59
GAGGAACAGCCTGAGAAGG
60
AGCAAGTCCCTGATGTACAG
60
      尚未收录相关数据

CHTF18基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CHTF18基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005524
A0A0D9SF58 (UniProtKB)
IEA
GO:0005524
E7EXA6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005524
F8WCC1 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q8WVB6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8WVB6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005524
Q8WVB6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005654
Q8WVB6 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q8WVB6 (UniProtKB)
IDA
GO:0006260
Q8WVB6 (UniProtKB)
IEA
GO:0007049
Q8WVB6 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
Q8WVB6 (UniProtKB)
IDA
GO:0031390
Q8WVB6 (UniProtKB)
IDA
GO:1900264
Q8WVB6 (UniProtKB)
IDA
GO:0003689
Q8WVB6 (UniProtKB)
IDA
GO:0043142
Q8WVB6 (UniProtKB)
IDA

可能调控 CHTF18基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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