CLDN12 (claudin 12)

symbol:
CLDN12
locus group:
protein-coding gene
location:
7q21.13
gene_family:
Claudins
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
9069
ensembl gene id:
ENSG00000157224
ucsc gene id:
uc003ukr.4
refseq accession:
NM_012129
hgnc_id:
HGNC:2034
approved reserved:
1998-12-11
7q21.13
基因染色体位置图

CLDN12(Claudin-12)是紧密连接蛋白家族(Claudin家族)的成员之一,该家族由至少27个成员组成,主要功能是形成细胞间的紧密连接结构,维持细胞旁屏障的完整性和选择性通透性。Claudin家族蛋白的共同特点是具有四个跨膜结构域、两个细胞外环和一个细胞内环,通过调控离子和小分子的跨细胞旁转运参与多种生理过程。CLDN12在多个组织中表达,包括肾脏、肠道、睾丸和大脑,其表达产物是一种跨膜蛋白,主要定位于上皮细胞和内皮细胞的紧密连接处,参与调节钙离子(Ca²⁺)的旁细胞转运。研究表明,CLDN12可能通过其第二个细胞外环中的特定氨基酸残基与钙离子相互作用,影响钙的吸收和稳态。CLDN12的功能异常或突变可能导致紧密连接结构的破坏,进而影响组织的屏障功能。例如,在肾脏中,CLDN12的异常表达可能与钙的重吸收失调有关,但具体机制尚不明确。目前尚未发现CLDN12突变直接导致人类疾病的明确证据,但某些研究提示其可能与慢性肾病或电解质紊乱相关。当CLDN12过表达时,可能增强细胞旁钙离子的通透性,从而影响局部钙信号或钙依赖性生理过程;而降低表达则可能削弱钙转运,潜在干扰矿化组织(如骨骼或牙齿)的发育或功能。此外,CLDN12的表达变化可能影响其他Claudin家族成员(如CLDN2或CLDN16)的功能,因为这些蛋白常在紧密连接中协同作用。在癌症中,CLDN12的表达异常曾被报道,但其作用机制尚需进一步研究。总体而言,CLDN12作为Claudin家族中钙调控相关的一员,其功能细节和病理关联仍需更多实验验证。

This gene encodes a member of the claudin family. Claudins are integral membrane proteins and components of tight junction strands. Tight junction strands serve as a physical barrier to prevent solutes and water from passing freely through the paracellular space between epithelial or endothelial cell sheets, and also play critical roles in maintaining cell polarity and signal transductions. This gene is expressed in the inner ear and bladder epithelium, and it is over-expressed in colorectal carcinomas. This protein and claudin 2 are critical for vitamin D-dependent Ca2+ absorption between enterocytes. Multiple alternatively spliced transcript variants encoding the same protein have been found.[provided by RefSeq, Sep 2011]

该基因编码的紧密连接蛋白家族的一个成员。 Claudins是整合膜蛋白和紧密连接链的组分。紧密连接绳股用作物理屏障,以防止溶质和水自由通过上皮或内皮细胞片之间的细胞旁空间,并且还维持细胞极性和信号转导中发挥关键作用。该基因在内耳和膀胱上皮中表达,并且它是过度表达在结肠直肠癌。此蛋白和紧密连接蛋白2是肠上皮细胞间维生素D依赖性钙吸收是至关重要的。编码相同的蛋白质多选择性剪接转录变异体已被发现。[由RefSeq的,2011年9月提供]

CLDN12基因的碱基序列:[NCBI]
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CLDN12基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs9731       rs917660       rs1017104       rs1017105       rs1017106       rs1048883       rs2058333       rs2058334       rs2058335       rs3810874       rs6951229       rs6961218       rs6963257       rs6968678       rs7792018       rs7792438       rs7792909      

CLDN12基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AATCTGGCCCAAGTCTGAC
60
AGGAAGGAAAGGACTGTGG
59
GGCTCAGATTATTGCTACTCTG
59
TTTCTTCATGCTTTGAGGTACC
59
TTCTTCAATGGCTTCCTTCAG
59
GTTCAATCATTCTCAAAGAGGC
58
ATGATGCTTCTACTCATTGCAG
59
CTGTTCAAATCCTGCAGGT
58
TACCTCAAAGCTCTGACTGAC
60
GAAGGAAAGGACTGTGGCT
60
CTGGAGGATCTGCAGAGTC
59
CTTCTTTACAGCACATTCAGCA
60
GATCTTCATGTGTCTCTTCTAAGC
59
CTCTTCTTTACAGCACATTGCT
59
TGCCATAACTCGGAAAGGT
59
GATACTCCTAATGTTGACTCTGC
59
GCAGGCTCAGATTATTGCT
58
CAGCTTTATTCAGCTTAGAAGAGAC
60
AGCAGGCTCAGATTATTGCT
59
TTTCTTCATGCTTTGAGGTACC
59
      尚未收录相关数据

CLDN12基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CLDN12基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005198
A8MX62 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
A8MX62 (UniProtKB)
IEA
GO:0005923
A8MX62 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
A8MX62 (UniProtKB)
IEA
GO:0005198
C9J4P0 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
C9J4P0 (UniProtKB)
IEA
GO:0005923
C9J4P0 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
C9J4P0 (UniProtKB)
IEA
GO:0005198
C9J841 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
C9J841 (UniProtKB)
IEA
GO:0005923
C9J841 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
C9J841 (UniProtKB)
IEA
GO:0005198
P56749 (UniProtKB)
IEA
GO:0005923
P56749 (UniProtKB)
ISS
GO:0016021
P56749 (UniProtKB)
IEA
GO:0016328
P56749 (UniProtKB)
IEA
GO:0016338
P56749 (UniProtKB)
ISS
GO:0042802
P56749 (UniProtKB)
ISS

可能调控 CLDN12基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Colorectal Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Breast Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 0 BeFree

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