CLIC3 (chloride intracellular channel 3)

基因基本信息

基因基本信息

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CLIC3
locus group:
protein-coding gene
location:
9q34.3
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Chloride intracellular channels
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9022
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HGNC:2064
approved reserved:
1999-01-19

基因染色体位置

基因染色体位置

9q34.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CLIC3（氯离子细胞内通道蛋白3）属于CLIC基因家族，该家族成员编码的蛋白质具有双重功能，既可作为可溶性蛋白存在于细胞质中，也可插入细胞膜形成离子通道。CLIC家族蛋白通常参与调节细胞内氯离子浓度、细胞体积、膜电位及细胞内pH值，并在细胞增殖、分化和凋亡等过程中发挥作用。CLIC3主要定位于细胞内膜系统（如内质网、高尔基体）和质膜，其表达产物是一种功能多样的氯离子通道蛋白，参与维持细胞内离子稳态和膜运输过程。该蛋白在肿瘤细胞迁移、血管生成及突触小泡循环等生理过程中起关键作用，尤其在肿瘤微环境中通过调节细胞外基质的重塑促进侵袭转移。CLIC3突变可能导致其通道功能异常，引发细胞内离子失衡，与多种疾病相关，包括肿瘤（如乳腺癌、结直肠癌的转移增强）、神经系统疾病（突触传递异常）和心血管疾病（血管平滑肌功能紊乱）。当CLIC3过表达时，会显著增强肿瘤细胞的迁移侵袭能力，促进上皮-间质转化（EMT），同时通过激活MMP2/9等基质金属蛋白酶加速细胞外基质降解；此外还可能通过调节ROS水平影响细胞凋亡。其低表达则可能导致内体/溶酶体系统功能障碍，影响突触小泡回收，并抑制血管内皮细胞的管腔形成能力。在CLIC家族中，各成员（如CLIC1、CLIC4、CLIC5）均具有保守的谷胱甘肽S-转移酶样结构域，但组织分布和具体功能存在差异，例如CLIC1更多参与神经兴奋性调节，而CLIC4与线粒体凋亡通路相关。目前针对CLIC3的干预策略（如小分子抑制剂）正在肿瘤治疗领域进行探索，其作为转移性癌症的潜在治疗靶点备受关注。

Chloride channels are a diverse group of proteins that regulate fundamental cellular processes including stabilization of cell membrane potential, transepithelial transport, maintenance of intracellular pH, and regulation of cell volume. Chloride intracellular channel 3 is a member of the p64 family and is predominantly localized in the nucleus and stimulates chloride ion channel activity. In addition, this protein may participate in cellular growth control, based on its association with ERK7, a member of the MAP kinase family. [provided by RefSeq, Jul 2008]

氯离子通道是调节基本细胞过程，包括细胞的膜电位的稳定，跨膜运输，细胞内pH的维护和细胞体积的调控蛋白的一个多元化的群体。氯离子通道3是P64家族的成员，并在细胞核中被主要定位并刺激氯离子通道活性。此外，此蛋白质可能参与了细胞生长控制的基础上，其与ERK7，MAP激酶家族的一个成员关联。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对CLIC3基因的介绍     Wikipedia数据库中对CLIC3基因的介绍

基因序列

基因序列

CLIC3基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CLIC3基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs13795       rs908834       rs908835       rs908836       rs2292922       rs2292923       rs3188722       rs3793641       rs3829902       rs4880183       rs7023982       rs7033101       rs7855602       rs7865849       rs12348585       rs12379285       rs56020478      

基因表达

基因表达

CLIC3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTTTGTCAAGGCGAGTGAG
59
TGTCATAGAGCAGGATGGG
59
AGGACTTTCTGGAGGAGAC
58
TTGGACTCCCTGTAACGAG
59
GTTTGTCAAGGCGAGTGAG
59
GGAGCAGGACCATGAAGAG
60
CTGTTTGTCAAGGCGAGTG
60
TGAAAGGTACGCCCTTGAG
60
CTGTTTGTCAAGGCGAGTG
60
TGAAAGGTACGCCCTTGAG
60
GGACTTTCTGGAGGAGACG
60
GTTGGACTCCCTGTAACGA
59
GGACTTTCTGGAGGAGACG
60
TTGGACTCCCTGTAACGAG
59
GTTTGTCAAGGCGAGTGAG
59
TGAAAGGTACGCCCTTGAG
60
GTTTGTCAAGGCGAGTGAG
59
TGAAAGGTACGCCCTTGAG
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CLIC3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CLIC3基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005244
O95833 (UniProtKB)
IEA
GO:0005254
O95833 (UniProtKB)
IMP
GO:0005515
O95833 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O95833 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O95833 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
O95833 (UniProtKB)
IDA
GO:0005634
O95833 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
O95833 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
O95833 (UniProtKB)
IDA
GO:0006821
O95833 (UniProtKB)
IMP
GO:0007165
O95833 (UniProtKB)
TAS
GO:0034707
O95833 (UniProtKB)
IEA
GO:0034765
O95833 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
O95833 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
O95833 (UniProtKB)
IDA
GO:1902476
O95833 (UniProtKB)
IEA
GO:0004364
O95833 (UniProtKB)
IBA
GO:0006749
O95833 (UniProtKB)
IBA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CLIC3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of ovary 0.000271442 1 0 BeFree
Ovarian Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of urinary bladder 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 0 BeFree
Eclampsia 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinoma of bladder 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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