CLNK (cytokine dependent hematopoietic cell linker)

symbol:
CLNK
locus group:
protein-coding gene
location:
4p16.1
gene_family:
SH2 domain containing
alias symbol:
MIST
alias name:
mast cell immunoreceptor signal tr…
entrez id:
116449
ensembl gene id:
ENSG00000109684
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uc003gmo.5
refseq accession:
NM_052964
hgnc_id:
HGNC:17438
approved reserved:
2008-11-20
4p16.1
基因染色体位置图

CLNK(也称为细胞质连接器适配蛋白,Cytoplasmic Linker Adaptor Protein)是一个参与免疫信号传导的基因,尤其在淋巴细胞的激活和功能调控中发挥重要作用。它编码的蛋白质属于SLP-76家族适配蛋白(SLP-76 family adaptor proteins),这类蛋白的共同特点是作为支架分子,通过多个蛋白相互作用域(如SH2、SH3结构域)将信号分子聚集在一起,形成信号复合物,从而传递免疫受体(如T细胞受体、B细胞受体)的激活信号。CLNK主要在造血细胞(如T细胞、B细胞、自然杀伤细胞)中表达,其功能依赖于与家族成员BLNK(B细胞连接蛋白)和SLP-76的协同作用。 CLNK的生物学功能集中在调节免疫细胞的激活、增殖和分化。例如,在T细胞中,它通过连接T细胞受体(TCR)下游的激酶(如ZAP-70)和效应分子(如PLCγ1),促进钙离子流动和NFAT(活化T细胞核因子)信号通路的激活,这对T细胞的免疫应答至关重要。若CLNK发生功能丧失性突变(如截短突变或错义突变),可能导致免疫信号传导缺陷,表现为免疫细胞活化受阻、增殖减少或功能异常,进而增加对感染的易感性或引发免疫失调性疾病。某些研究发现,CLNK的异常表达可能与自身免疫疾病(如类风湿性关节炎)或淋巴系统恶性肿瘤(如某些白血病)相关。 当CLNK过表达时,可能过度激活免疫信号通路,导致淋巴细胞异常增殖或自身免疫反应增强;而表达降低则可能削弱免疫应答,增加感染风险。此外,CLNK的表达变化可能影响其他信号分子的招募(如Vav1、Grb2),从而干扰细胞迁移、细胞因子分泌等功能。在基因家族层面,SLP-76家族成员均含SH2和SH3结合域,但组织分布和具体功能存在差异:BLNK主要在B细胞中起作用,SLP-76主导T细胞信号,而CLNK则在多种免疫细胞中发挥辅助作用。 目前对CLNK的研究仍在深入,其精确机制和疾病关联需进一步验证。术语解释:SH2/SH3结构域(能特异性结合磷酸化酪氨酸或富含脯氨酸序列的蛋白互作模块)、NFAT(调控免疫相关基因转录的蛋白家族)、PLCγ1(分解磷脂产生第二信使的酶)。若中文术语不准确,可参考英文原词(如“适配蛋白”对应adaptor protein)。

MIST is a member of the SLP76 family of adaptors (see LCP2, MIM 601603; BLNK, MIM 604515). MIST plays a role in the regulation of immunoreceptor signaling, including PLC-gamma (PLCG1; MIM 172420)-mediated B cell antigen receptor (BCR) signaling and FC-epsilon R1 (see FCER1A, MIM 147140)-mediated mast cell degranulation (Cao et al., 1999 [PubMed 10562326]; Goitsuka et al., 2000, 2001 [PubMed 10744659] [PubMed 11463797]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

MIST是SLP76系列适配器中的一员(参见LCP2,MIM 601603; BLNK,MIM 604515)。 MIST起着免疫信令的调节,包括PLC-γ作用(PLCG1; MIM 172420)介导的B细胞抗原受体(BCR)的信号传导和FC厄普西隆R1(见FCER1A,MIM 147140) - 介导的肥大细胞脱粒(曹等,1999 [考研10562326]。Goitsuka等人,2000年,2001年[1考研0744659] [考研11463797])。[由OMIM,2008年3月供应]

CLNK基因的碱基序列:[NCBI]
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CLNK基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs758332       rs763676       rs763677       rs887112       rs887113       rs953930       rs976149       rs977125       rs978591       rs997219       rs1004325       rs1004326       rs1004327       rs1004328       rs1004329       rs1019123       rs1019124      

CLNK基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GCACAATGAATGGTACATTGGA
60
AAACTACCATCCTTGTTCTCCT
59
AACATTAAAGGAGATGCATCCG
59
CTTCTTCGGAAGTGTTATGAGAG
59
GAAGCCTGAATCAACTCATCTG
60
GTCGTGAATGAAGAACTGCT
59
GGCAGGGCAATAGAAAGAC
59
AGCAAAGTTTCTTTCCCAGTC
59
GCACAATGAATGGTACATTGG
58
AAACTACCATCCTTGTTCTCCT
59
GCACAATGAATGGTACATTGG
58
AAACTACCATCCTTGTTCTCC
58
GAGGTTGGAAAGAGTGGAC
58
TTCTTTCTTACGGATGCATCTC
59
GGCAGGGCAATAGAAAGAC
59
GCAAAGTTTCTTTCCCAGTC
58
GCACAATGAATGGTACATTGG
58
AAACTACCATCCTTGTTCTCCT
59
AAGCCTGAATCAACTCATCTG
58
TGTCGTGAATGAAGAACTGC
59
      尚未收录相关数据

CLNK基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CLNK基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005070
Q7Z7G1 (UniProtKB)
NAS
GO:0005515
Q7Z7G1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q7Z7G1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005622
Q7Z7G1 (UniProtKB)
NAS
GO:0006955
Q7Z7G1 (UniProtKB)
IBA
GO:0006955
Q7Z7G1 (UniProtKB)
NAS
GO:0007169
Q7Z7G1 (UniProtKB)
IBA
GO:0009967
Q7Z7G1 (UniProtKB)
IEA
GO:0035556
Q7Z7G1 (UniProtKB)
IDA

可能调控 CLNK基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Vitiligo 0.12 1 0 CTD_human
Amyotrophic Lateral Sclerosis 0.004734064 2 1 GAD
Liver Cirrhosis 0.000271442 1 0 BeFree
Liver diseases 0.000271442 1 0 BeFree
Cirrhosis 0.000271442 1 0 BeFree

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