CNTN6 (contactin 6)

symbol:
CNTN6
locus group:
protein-coding gene
location:
3p26.3
gene_family:
Fibronectin type III domain containing|I-set domain containing
alias symbol:
NB-3
alias name:
neural adhesion molecule
entrez id:
27255
ensembl gene id:
ENSG00000134115
ucsc gene id:
uc003boz.5
refseq accession:
NM_014461
hgnc_id:
HGNC:2176
approved reserved:
2000-05-26
3p26.3
基因染色体位置图

CNTN6(Contactin 6)是Contactin基因家族的一员,属于免疫球蛋白超家族(IgSF)的细胞黏附分子。Contactin家族共有6个成员(CNTN1-CNTN6),它们共同的特点是含有多个免疫球蛋白(Ig)和纤维连接蛋白III(FNIII)结构域,通过介导细胞间或细胞与基质的相互作用参与神经系统的发育和功能调控。CNTN6主要在大脑皮层、海马和小脑中表达,尤其在神经元轴突和突触部位富集,其功能涉及神经元迁移、轴突导向和突触可塑性。CNTN6通过与配体如受体蛋白酪氨酸磷酸酶(RPTP)结合,激活下游信号通路(如Fyn激酶),调控神经网络的精确连接。若CNTN6发生突变(如错义突变或缺失),可能导致其与配体结合能力下降或信号传导异常,与自闭症谱系障碍(ASD)、智力障碍和精神分裂症等神经发育疾病相关。研究显示,CNTN6缺失的小鼠模型表现出社交行为缺陷和认知功能障碍,印证了其在高级神经活动中的作用。当CNTN6过表达时,可能过度激活神经元生长信号,导致异常突触形成或神经环路紊乱;而表达降低则可能损害神经元迁移和突触稳定性,影响学习记忆能力。此外,CNTN6与家族其他成员(如CNTN2、CNTN4)功能部分冗余,但各自具有独特的时空表达模式。例如,CNTN2更多参与髓鞘形成,而CNTN6更偏向于皮质神经元发育。这种家族共性与特异性的结合,使得Contactin成员能协同调控复杂的神经系统发育过程。目前针对CNTN6的研究仍处于探索阶段,但其作为神经精神疾病的潜在生物标志物或治疗靶点,具有重要价值。

The protein encoded by this gene is a member of the immunoglobulin superfamily. It is a glycosylphosphatidylinositol (GPI)-anchored neuronal membrane protein that functions as a cell adhesion molecule. It may play a role in the formation of axon connections in the developing nervous system. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jan 2014]

由该基因编码的蛋白质是免疫球蛋白超家族中的一员。它是一个糖基(GPI)锚定的神经元膜蛋白,其功能是作为细胞粘附分子。它可能发挥在神经系统发育形成轴突连接的作用。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的,2014年1月提供]

CNTN6基因的碱基序列:[NCBI]
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CNTN6基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs149792       rs149793       rs154959       rs154960       rs155224       rs155225       rs155226       rs155227       rs155228       rs155229       rs155230       rs155231       rs155232       rs155233       rs155234       rs155235       rs155384      

CNTN6基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCTTCTGCAGGTGATGGTC
59
GCACAATTCAGGATGACCTC
59
TCTTCTGCAGGTGATGGTC
59
GCACAATTCAGGATGACCTC
59
CCTGAGGATGACATGTGAG
57
TCAGTATCTCAAGAGTCTGGT
58
CTCTGGCTTCTTCATTTGGA
58
AAAGACCATCACCTCTTTGC
59
ACATTTCCCTGGTGATGGT
59
CACAATTCAGGATGACCTCAG
59
GGTACAAGATTCTGTACCGG
58
AAATGGAACCAGAAGCTCAG
58
ACAGTATCTGTCCGAGAAGG
58
GGTCCATGCATAAGATAAATCTCC
59
CTCTTCTGCAGGTGATGGT
59
CACAATTCAGGATGACCTCAG
59
TGAGGATGACATGTGAGGC
60
GTCAGTATCTCAAGAGTCTGGT
59
CTCTTCTGCAGGTGATGGT
59
CACAATTCAGGATGACCTCAG
59
      尚未收录相关数据

CNTN6基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CNTN6基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
F8WDQ0 (UniProtKB)
IEA
GO:0005112
Q9UQ52 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q9UQ52 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
Q9UQ52 (UniProtKB)
IEA
GO:0007219
Q9UQ52 (UniProtKB)
IEA
GO:0007417
Q9UQ52 (UniProtKB)
TAS
GO:0030182
Q9UQ52 (UniProtKB)
IEA
GO:0031225
Q9UQ52 (UniProtKB)
IEA

可能调控 CNTN6基因的相关microRNA:     

Reactome

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Adenoid Cystic Carcinoma 0.12 1 0 CTD_human
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Mental disorders 0.002367032 1 0 GAD
Prostatic Neoplasms 0.002367032 1 1 GAD
Neoplasm Metastasis 0.000542884 2 0 BeFree
Monosomy 0.000271442 1 0 BeFree
Bipolar Disorder 0.000271442 1 1 BeFree
Trisomy 0.000271442 1 0 BeFree
X-linked hydrocephalus syndrome 0.000271442 1 0 BeFree
Muscular fasciculation 0.000271442 1 0 BeFree

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