CXCL9 (C-X-C motif chemokine ligand 9)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CXCL9
locus group:
protein-coding gene
location:
4q21.1
gene_family:
Chemokine ligands|Endogenous ligands
alias symbol:
SCYB9|Humig|crg-10
alias name:
None
entrez id:
4283
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ucsc gene id:
uc003hjh.2
refseq accession:
NM_002416
hgnc_id:
HGNC:7098
approved reserved:
1996-05-28

基因染色体位置

基因染色体位置

4q21.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CXCL9（也称为MIG，即干扰素γ诱导的单核因子）是一种属于CXC趋化因子家族的基因，其编码的蛋白质主要参与免疫系统的调控，特别是在炎症和免疫应答中发挥关键作用。CXCL9的主要功能是吸引和激活特定的免疫细胞，如T细胞和自然杀伤细胞（NK细胞），通过与其受体CXCR3结合，引导这些细胞迁移到炎症或感染部位。CXCL9主要由干扰素γ（IFN-γ）诱导产生，常见于病毒感染、自身免疫疾病和肿瘤微环境中。CXCL9基因突变可能导致其功能异常，影响免疫细胞的招募和激活，从而削弱机体的抗感染或抗肿瘤能力。例如，CXCL9表达降低可能与某些癌症的免疫逃逸相关，而过表达则可能加剧自身免疫疾病（如类风湿性关节炎或多发性硬化症）的炎症反应。CXCL9属于CXC趋化因子家族，该家族成员共享一个保守的CXC（半胱氨酸-任意氨基酸-半胱氨酸）结构域，并主要参与白细胞迁移和血管生成等过程。CXCL9与家族中的CXCL10和CXCL11功能相似，均通过CXCR3受体发挥作用，但它们的表达模式和调控机制略有不同。CXCL9的过表达可能增强抗肿瘤免疫反应，但也可能引发过度炎症，而低表达则可能导致免疫监视功能下降。此外，CXCL9的表达水平还被用作某些疾病（如癌症或慢性炎症）的生物标志物，帮助评估疾病进展或治疗效果。

This antimicrobial gene encodes a protein thought to be involved in T cell trafficking. The encoded protein binds to C-X-C motif chemokine 3 and is a chemoattractant for lymphocytes but not for neutrophils. [provided by RefSeq, Sep 2014]

这抗菌基因编码被认为参与T细胞贩卖的蛋白质。所编码的蛋白质结合在C-X-C基序趋化因子3和为淋巴细胞，但不为嗜中性粒细胞化学引诱物。 [由RefSeq的，2014年9月提供]

OMIM数据库中对CXCL9基因的介绍     Wikipedia数据库中对CXCL9基因的介绍

基因序列

基因序列

CXCL9基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CXCL9基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs7670156       rs137922881       rs530024065       rs532682236       rs540431561       rs544379936       rs562932329       rs10336       rs10337       rs1050176       rs2276885       rs2276886       rs3733236       rs6532083       rs6532084       rs6841775       rs10031051      

基因表达

基因表达

CXCL9基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GATTGGAGTGCAAGGAACC
58
AGGATTGTAGGTGGATAGTCC
58
GATTGGAGTGCAAGGAACC
58
GGATTGTAGGTGGATAGTCCC
59
GATTGGAGTGCAAGGAACC
58
GATTGTAGGTGGATAGTCCCT
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CXCL9基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CXCL9基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0002690
Q07325 (UniProtKB)
IBA
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Q07325 (UniProtKB)
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GO:0005515
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IPI
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IPI
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IPI
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IPI
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IPI
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TAS
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TAS
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TAS
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Q07325 (UniProtKB)
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IEA
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IDA
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TAS
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IEA
GO:0006955
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TAS
GO:0007165
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GO:1901741
Q07325 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CXCL9基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Biliary cirrhosis 0.12272435 2 0 CTD_human_LHGDN
Alopecia Areata 0.120271442 2 0 BeFree_CTD_human
Interstitial Cystitis 0.12 1 0 CTD_human
Mammary Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Liver Neoplasms, Experimental 0.12 1 0 CTD_human
Neoplasm Recurrence, Local 0.12 1 0 CTD_human
Pneumonia 0.12 1 0 CTD_human
Hypersensitivity 0.12 1 0 CTD_human
Myasthenia Gravis, Autoimmune, Experimental 0.08 1 0 RGD
Crohn Disease 0.005634266 2 0 BeFree_GAD_LHGDN

基因相关服务

基因相关服务

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