DENR (density regulated re-initiation and release factor)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
DENR
locus group:
protein-coding gene
location:
12q24.31
gene_family:
alias symbol:
DRP|DRP1|SMAP-3
alias name:
None
entrez id:
8562
ensembl gene id:
ENSG00000139726
ucsc gene id:
uc001uda.4
refseq accession:
NM_003677
hgnc_id:
HGNC:2769
approved reserved:
1999-06-17

基因染色体位置

基因染色体位置

12q24.31
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

DENR（Density-regulated protein）是一种在真核生物中保守的基因，编码一种参与翻译调控的蛋白质。它主要通过与真核起始因子2D（eIF2D）相互作用，在非典型翻译起始过程中发挥作用，帮助核糖体识别特定的mRNA并启动蛋白质合成。DENR在细胞增殖、分化和发育过程中具有重要作用，尤其在神经系统的发育中表现突出。该基因的突变可能导致翻译失调，影响蛋白质的正常合成，进而引发发育异常或疾病。研究发现，DENR的异常表达与某些癌症（如胶质母细胞瘤）和神经发育障碍（如自闭症谱系障碍）相关。当DENR过表达时，可能促进细胞增殖和肿瘤发生；而降低表达则可能导致翻译效率下降，影响细胞生长和分化。DENR属于一个小的基因家族，与eIF2D功能相关，家族成员在翻译起始的非经典通路中协同作用，共同调控特定mRNA的翻译效率。这一家族的共性在于它们能够绕过典型的帽依赖性翻译机制，在应激条件或特定生理状态下维持关键蛋白质的合成。

This gene encodes a protein whose expression was found to increase in cultured cells at high density but not during growth arrest. This gene was also shown to have increased expression in cells overexpressing HER-2/neu proto-oncogene. The protein contains an SUI1 domain. In budding yeast, SUI1 is a translation initiation factor that along with eIF-2 and the initiator tRNA-Met, directs the ribosome to the proper translation start site. Proteins similar to SUI have been found in mammals, insects, and plants. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码的表达，发现增加在高密度培养的细胞，但不会在生长停滞的蛋白质。这种基因也显示出具有增加的表达在细胞中过表达HER-2 / neu原癌基因。蛋白质含有SUI1域。在芽殖酵母，SUI1是翻译起始因子，与的eIF-2和引发剂的tRNA-Met的沿，指示核糖体到适当的翻译起始位点。类似于隋蛋白已在哺乳动物，昆虫，和植物中发现。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对DENR基因的介绍     Wikipedia数据库中对DENR基因的介绍

基因序列

基因序列

DENR基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

DENR基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2154       rs839356       rs839357       rs1045743       rs1128578       rs1128579       rs1128583       rs1260120       rs1260121       rs1260122       rs1260123       rs1671688       rs1975761       rs2649896       rs2649902       rs2649903       rs2656812      

基因表达

基因表达

DENR基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTGCATGTGTTGGTTCAGC
59
GCCATTTCACAAACCCAGG
59
AAGGAGACCCAAGGAACAG
59
GTTGGTAATGAACAGACTCCA
58
TTGCATGTGTTGGTTCAGC
59
CCATTTCACAAACCCAGGC
59
AAGGAGACCCAAGGAACAG
59
GTTGGTAATGAACAGACTCCAC
59
CATGTGTTGGTTCAGCTGG
59
CAGCCATTTCACAAACCCA
59
AAGGAGACCCAAGGAACAG
59
TTGGTAATGAACAGACTCCAC
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

DENR基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

DENR基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003743
F8VVL1 (UniProtKB)
IEA
GO:0006413
F8VVL1 (UniProtKB)
IEA
GO:0001731
O43583 (UniProtKB)
IDA
GO:0002192
O43583 (UniProtKB)
IDA
GO:0003674
O43583 (UniProtKB)
ND
GO:0003743
O43583 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
O43583 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O43583 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O43583 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O43583 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O43583 (UniProtKB)
IPI
GO:0005575
O43583 (UniProtKB)
ND
GO:0032790
O43583 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 DENR基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of breast 0.000542884 2 0 BeFree
Parkinson Disease 0.000542884 2 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Osteosarcoma of bone 0.000271442 1 0 BeFree
Osteosarcoma 0.000271442 1 0 BeFree
Impaired cognition 0.000271442 1 0 BeFree
melanoma 0.000271442 1 0 BeFree
Coinfection 0.000271442 1 0 BeFree
Muscular Dystrophy, Duchenne 0.000271442 1 0 BeFree
Pulmonary Hypertension, Primary, 1, With Hereditary Hemorrhagic Telangiectasia 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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