DPPA3 (developmental pluripotency associated 3)

symbol:
DPPA3
locus group:
protein-coding gene
location:
12p13.31
gene_family:
alias symbol:
Stella|Pgc7
alias name:
None
entrez id:
359787
ensembl gene id:
ENSG00000187569
ucsc gene id:
uc001qtf.4
refseq accession:
NM_199286
hgnc_id:
HGNC:19199
approved reserved:
2003-07-09
12p13.31
基因染色体位置图

DPPA3(Developmental Pluripotency Associated 3),也称为STELLA或PGC7,是一种在小鼠和人类中高度保守的基因,属于DPPA基因家族。该家族主要与早期胚胎发育和细胞多能性维持相关,其成员通常在胚胎干细胞和生殖细胞中高表达,参与调控表观遗传修饰和基因组稳定性。DPPA3基因编码一种核蛋白,其表达产物在受精后的合子中发挥重要作用,特别是在保护父源基因组免受DNA去甲基化的影响方面。DPPA3通过结合组蛋白H3K9me2标记,阻止TET3介导的DNA去甲基化,从而维持父源基因组的甲基化状态,这对早期胚胎的正常发育至关重要。 DPPA3的突变或表达异常可能导致严重的发育缺陷。例如,在小鼠模型中,DPPA3缺失会导致胚胎停滞在早期发育阶段,甚至引发胚胎死亡。此外,DPPA3的表达异常还与某些生殖系统疾病和癌症相关,如在卵巢癌和精原细胞瘤中可观察到DPPA3的异常高表达,这可能与其在表观遗传调控中的作用有关。 如果DPPA3过表达,可能会干扰正常的DNA甲基化模式,影响胚胎发育或导致肿瘤发生。相反,若DPPA3表达降低,可能导致父源基因组的异常去甲基化,破坏基因印记,进而影响胚胎的存活和发育。DPPA3还与其他基因如DNMTs(DNA甲基转移酶)和TET家族蛋白相互作用,共同调控表观遗传修饰。 DPPA3基因家族(DPPA家族)的成员通常具有在早期胚胎和干细胞中高表达的特点,并参与多能性维持和表观遗传调控。该家族的基因在进化上高度保守,表明其在发育过程中的关键作用。总之,DPPA3在早期胚胎发育、表观遗传调控和疾病发生中扮演重要角色,其功能异常可能对机体产生深远影响。

This gene encodes a protein that in mice may function as a maternal factor during the preimplantation stage of development. In mice, this gene may play a role in transcriptional repression, cell division, and maintenance of cell pluripotentiality. In humans, related intronless loci are located on chromosomes 14 and X. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码,在老鼠可能在开发的胚胎植入前阶段为母体因素发挥作用的蛋白质。在小鼠中,该基因可在转录抑制,细胞分裂和细胞pluripotentiality维持中发挥作用。在人类中,相关的内含子位点位于染色体14和X [由RefSeq的,2008年7月提供]

DPPA3基因的碱基序列:[NCBI]
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DPPA3基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs999074       rs999075       rs999076       rs1055423       rs1558534       rs2024320       rs2286947       rs2376898       rs2376899       rs3069535       rs7133011       rs7298056       rs7301214       rs7969455       rs10082714       rs10082742       rs10772650      

DPPA3基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGAGTTAAGAAGGAATCAAGACC
59
AGCATTCTCAGAAGGATCCC
59
GGGAGTTAAGAAGGAATCAAGAC
59
GCATTCTCAGAAGGATCCCA
60
TTCGTACGCATGAAAGAAGAC
59
TGCAGGGACATTTGAATGG
58
      尚未收录相关数据

DPPA3基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

DPPA3基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0001939
Q6W0C5 (UniProtKB)
ISS
GO:0005634
Q6W0C5 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q6W0C5 (UniProtKB)
IDA
GO:0016568
Q6W0C5 (UniProtKB)
IEA
GO:0035064
Q6W0C5 (UniProtKB)
ISS
GO:0035064
Q6W0C5 (UniProtKB)
IBA
GO:0040016
Q6W0C5 (UniProtKB)
IEA
GO:0044726
Q6W0C5 (UniProtKB)
ISS
GO:0044726
Q6W0C5 (UniProtKB)
IBA
GO:1901536
Q6W0C5 (UniProtKB)
ISS
GO:1901536
Q6W0C5 (UniProtKB)
IBA
GO:2000653
Q6W0C5 (UniProtKB)
ISS
GO:2000653
Q6W0C5 (UniProtKB)
IBA
GO:0001940
Q6W0C5 (UniProtKB)
ISS

可能调控 DPPA3基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Neoplasms, Germ Cell and Embryonal 0.12 1 0 CTD_human

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