DSC1 (desmocollin 1)

symbol:
DSC1
locus group:
protein-coding gene
location:
18q12.1
gene_family:
Major cadherins
alias symbol:
CDHF1
alias name:
None
entrez id:
1823
ensembl gene id:
ENSG00000134765
ucsc gene id:
uc002kwn.4
refseq accession:
NM_004948|NM_024421
hgnc_id:
HGNC:3035
approved reserved:
1991-09-25
18q12.1
基因染色体位置图

DSC1(Desmocollin-1)属于钙黏蛋白超家族中的桥粒胶蛋白(desmocollin)亚家族,是构成细胞间桥粒连接的重要跨膜蛋白之一。桥粒胶蛋白家族包括DSC1、DSC2和DSC3,它们与桥粒芯蛋白(desmoglein)共同形成桥粒结构,介导细胞间黏附,维持上皮组织的机械强度和完整性。DSC1主要表达于皮肤的分化上层(如颗粒层和角质层)以及某些黏膜组织中,其功能依赖于钙离子,通过胞外结构域与相邻细胞的同类蛋白相互作用,胞内部分则与角蛋白中间丝相连,形成稳定的细胞骨架网络。DSC1的突变或表达异常可导致桥粒结构缺陷,引发皮肤屏障功能障碍。例如,DSC1功能缺失突变与遗传性皮肤病如局限性表皮松解性掌跖角化症(NEPPK)相关,表现为皮肤脆弱、过度角化和水疱形成。此外,DSC1表达下调可能破坏上皮极性,促进肿瘤侵袭和转移,而过表达则可能增强细胞黏附,抑制肿瘤扩散。在自身免疫性疾病如天疱疮中,针对DSC1的自身抗体会破坏桥粒连接,导致表皮松解。DSC1还参与调控角质形成细胞的分化和凋亡,其表达受转录因子如p63和表观遗传修饰的影响。该基因家族成员的共性包括:含有钙黏蛋白重复序列的胞外域、跨膜区和高度保守的胞内锚定区,但各亚型在组织分布和功能上存在差异。研究DSC1有助于理解上皮稳态维持机制,并为相关疾病的治疗提供靶点。

The protein encoded by this gene is a calcium-dependent glycoprotein that is a member of the desmocollin subfamily of the cadherin superfamily. These desmosomal family members, along with the desmogleins, are found primarily in epithelial cells where they constitute the adhesive proteins of the desmosome cell-cell junction and are required for cell adhesion and desmosome formation. The desmosomal family members are arranged in two clusters on chromosome 18, occupying less than 650 kb combined. Alternative splicing results in two transcript variants encoding distinct isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白质是钙依赖性的糖蛋白,它是钙粘蛋白家族的desmocollin亚科的成员。这些桥粒的家庭成员,与desmogleins一起,主要在它们构成了桥粒细胞 - 细胞连接的粘合蛋白质和所需的细胞粘附和桥粒的形成上皮细胞中发现。桥粒家庭成员被安排在18号染色体上两个集群,占地不到650 KB的总和。两个转录剪接变异体结果不同编码的亚型。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

DSC1基因的碱基序列:[NCBI]
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DSC1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs985861       rs985862       rs1370450       rs1370451       rs1658108       rs1658109       rs1658110       rs1658111       rs1658112       rs1789036       rs1789043       rs1789071       rs1789072       rs1790703       rs1816632       rs1816633       rs1816634      

DSC1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ACATCAGACCTTGGAGTCC
59
AATGGATTCTTCGCCAAGC
59
TTGTAGGCAAAGTGAATCTGG
58
CTAGAATTCTGAAGGCAGGG
57
TTGTAGGCAAAGTGAATCTGG
59
CTAGAATTCTGAAGGCAGGG
58
CATCAGACCTTGGAGTCCG
60
AATGGATTCTTCGCCAAGC
59
CTTGTAGGCAAAGTGAATCTGG
59
TAGAATTCTGAAGGCAGGGTC
59
CTTGTAGGCAAAGTGAATCTGG
60
TAGAATTCTGAAGGCAGGGTC
60
GGAGATACTGGCAGATATGC
58
GTGTCCTCTAATGGATTCTTCG
59
AGGCTTAAGGTATCAGAAGTTAGG
59
TTTAGAGTTCTCAAGTCGCCA
59
AGGCTTAAGGTATCAGAAGTTAGG
60
TTTAGAGTTCTCAAGTCGCCA
60
      尚未收录相关数据

DSC1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

DSC1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
Q08554 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q08554 (UniProtKB)
IEA
GO:0005921
Q08554 (UniProtKB)
TAS
GO:0007156
Q08554 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
Q08554 (UniProtKB)
TAS
GO:0016021
Q08554 (UniProtKB)
IEA
GO:0030057
Q08554 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
Q08554 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q08554 (UniProtKB)
IDA

可能调控 DSC1基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
melanoma 0.12 1 0 CTD_human
Colorectal Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
IgA pemphigus 0.000542884 2 0 BeFree
Colitis 0.000271442 1 0 BeFree
Subcorneal pustular dermatosis 0.000271442 1 0 BeFree
Hemorrhoids 0.000271442 1 0 BeFree
Adenocarcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Adenocarcinoma of large intestine 0.000271442 1 0 BeFree

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