FAT1 (FAT atypical cadherin 1)

symbol:
FAT1
locus group:
protein-coding gene
location:
4q35.2
gene_family:
Cadherin-related
alias symbol:
CDHF7|CDHR8
alias name:
cadherin-related family member 8
entrez id:
2195
ensembl gene id:
ENSG00000083857
ucsc gene id:
uc003izf.4
refseq accession:
NM_005245
hgnc_id:
HGNC:3595
approved reserved:
1995-08-11
4q35.2
基因染色体位置图

FAT1(FAT atypical cadherin 1)是一种非典型的钙黏蛋白,属于钙黏蛋白超家族中的FAT基因家族。该家族成员(如FAT1、FAT2、FAT3、FAT4)的共同特点是具有多个钙黏蛋白重复序列和EGF样结构域,参与细胞间黏附、细胞极性维持及信号转导等过程。FAT1基因编码的蛋白在多种组织中表达,尤其在发育中的神经系统、肾脏和皮肤中发挥重要作用。其主要功能包括调控细胞迁移、增殖和细胞骨架重组,并通过Hippo信号通路影响器官大小和组织稳态。FAT1的突变与多种疾病相关,例如肾小球疾病、癌症(如胶质母细胞瘤、结直肠癌)和神经发育障碍。突变可能导致蛋白功能丧失,破坏细胞黏附或信号传导,进而引发组织发育异常或肿瘤进展。FAT1过表达在某些癌症中可能促进细胞侵袭和转移,而在其他情况下(如皮肤伤口愈合)可能加速组织修复。相反,FAT1表达降低可能导致细胞极性缺陷、迁移异常或发育畸形,例如小鼠模型中FAT1缺失会引发肾小球病变和神经系统异常。该基因还与Wnt/β-catenin通路相互作用,影响胚胎发育和肿瘤发生。FAT家族成员的共性在于通过细胞膜定位介导细胞-细胞接触,并参与发育调控,但各成员在组织分布和具体功能上存在差异。研究FAT1有助于理解组织发育、癌症机制及潜在治疗靶点。

This gene is an ortholog of the Drosophila fat gene, which encodes a tumor suppressor essential for controlling cell proliferation during Drosophila development. The gene product is a member of the cadherin superfamily, a group of integral membrane proteins characterized by the presence of cadherin-type repeats. In addition to containing 34 tandem cadherin-type repeats, the gene product has five epidermal growth factor (EGF)-like repeats and one laminin A-G domain. This gene is expressed at high levels in a number of fetal epithelia. Its product probably functions as an adhesion molecule and/or signaling receptor, and is likely to be important in developmental processes and cell communication. Transcript variants derived from alternative splicing and/or alternative promoter usage exist, but they have not been fully described. [provided by RefSeq, Jul 2008]

此基因是果蝇脂肪基因,它编码肿瘤抑制果蝇发育过程中控制细胞增殖所必需的同源物。该基因产物为钙粘蛋白超家族的成员,一组完整的膜蛋白特征在于钙粘蛋白型重复序列的存在。除含有34串联钙粘蛋白型重复序列,所述基因产物具有五个表皮生长因子(EGF)样重复序列和一个层粘连蛋白A?G域。该基因以高水平在许多胎儿上皮细胞中表达。其产品可能用作一种粘附分子和/或信令的受体,并且很可能是在发育过程及细胞通讯重要。从选择性剪接和/或可选择的启动子的使用衍生转录变异体的存在,但是它们还没有被充分地描述。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

FAT1基因的碱基序列:[NCBI]
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FAT1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs162062       rs162063       rs162180       rs162181       rs162182       rs167852       rs167853       rs167854       rs170571       rs172903       rs179125       rs189008       rs189031       rs191272       rs192997       rs227585       rs327066      

FAT1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ACTCGGCTAGACTGATTCC
59
GTTGGAAGAGAAGGAGCAG
58
CTGTCATCACGGTTATGGC
59
TTGAGTAGTGGATGTGGCT
58
GTCAATCCGTGTTCCTCCA
59
ACTAAGCTGACACCTCTGAC
59
TACTGGTCAGAGGTGTCAG
58
CCATCCAAACTGTCAAAGC
57
CAGTTGTGTTGCAGGTGAC
60
CCAATATTTCCTGACTCGATCG
59
AGAACATATTCCACGCATGC
59
CAGCCTTCCATGATGAATCTC
59
GGAGAAAGCTCATCAAGGAG
58
AGAGACCTCTGTAGCATACG
59
GGTTATTACTGCAAATGCAGTG
59
TGGACTAAGCTGACACCTC
59
ATGACAATGCTTCCATAGTGAC
59
CTTGGTTTGCTGAGGTCAG
59
CATGAAGCTGTTCCAGCAC
60
CACAATCCTTGCAAAGTTGC
59
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
ING1
FAT1
Unknown

FAT1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

FAT1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
A0A087WVP1 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
A0A087WVP1 (UniProtKB)
IEA
GO:0007156
A0A087WVP1 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
A0A087WVP1 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
D6RCE4 (UniProtKB)
IEA
GO:0007156
D6RCE4 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
D6RCE4 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
Q14517 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q14517 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14517 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14517 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14517 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14517 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q14517 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q14517 (UniProtKB)
IDA
GO:0005887
Q14517 (UniProtKB)
TAS
GO:0005911
Q14517 (UniProtKB)
IDA
GO:0005925
Q14517 (UniProtKB)
IDA
GO:0007015
Q14517 (UniProtKB)
ISS
GO:0007155
Q14517 (UniProtKB)
TAS
GO:0007156
Q14517 (UniProtKB)
IEA
GO:0007163
Q14517 (UniProtKB)
ISS
GO:0007267
Q14517 (UniProtKB)
TAS
GO:0009653
Q14517 (UniProtKB)
TAS
GO:0016337
Q14517 (UniProtKB)
ISS
GO:0016477
Q14517 (UniProtKB)
ISS
GO:0030027
Q14517 (UniProtKB)
IEA
GO:0030175
Q14517 (UniProtKB)
IEA
GO:0048471
Q14517 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q14517 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q14517 (UniProtKB)
IDA

可能调控 FAT1基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Glioblastoma 0.120271442 1 0 BeFree_CTD_human
Squamous cell carcinoma of esophagus 0.12 1 0 CTD_human
Salivary Gland Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Head and Neck Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Colorectal Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Adenoid Cystic Carcinoma 0.12 1 0 CTD_human
Bipolar Disorder 0.005276948 3 0 BeFree_GAD
Obesity 0.003181358 4 1 BeFree_GAD
Squamous cell carcinoma 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Mouth Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN

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