FNBP1L (formin binding protein 1 like)

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FNBP1L
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protein-coding gene
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1p22.1
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TOCA1|FLJ20275
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HGNC:20851
approved reserved:
2003-05-08
1p22.1
基因染色体位置图

FNBP1L(Formin Binding Protein 1 Like)是一种参与细胞骨架动态调控的基因,属于FNBP基因家族。该家族成员通常含有FCH结构域(Fes/CIP4同源结构域)和BAR结构域(Bin/Amphiphysin/Rvs结构域),这些结构域使其能够结合细胞膜并参与膜变形、囊泡运输以及细胞骨架重组等过程。FNBP1L通过与formin家族蛋白(如DAAM1)相互作用,调控肌动蛋白(actin)的聚合,从而影响细胞迁移、胞质分裂和神经元发育等生物学过程。FNBP1L在多种组织中表达,尤其在脑组织中表达较高,表明其在神经系统中可能具有重要作用。 FNBP1L的主要作用位点包括细胞膜和细胞骨架,它通过调控肌动蛋白的组装影响细胞形态和运动能力。突变或异常表达可能破坏其功能,导致细胞迁移障碍或神经元发育异常。研究表明,FNBP1L与某些神经系统疾病(如精神分裂症和自闭症谱系障碍)相关,可能因其在突触可塑性和神经元连接中的作用受到影响。此外,FNBP1L还参与肿瘤细胞的侵袭和转移,其表达水平在某些癌症(如乳腺癌和胶质瘤)中异常升高,可能促进肿瘤进展。 如果FNBP1L过表达,可能增强细胞迁移能力,促进肿瘤转移,同时可能影响神经元突触的形成和功能,导致神经系统紊乱。相反,如果FNBP1L表达降低,可能抑制细胞运动,影响胚胎发育或神经元的正常功能,甚至导致细胞分裂异常。FNBP1L的调控异常还可能影响其他依赖肌动蛋白动态的细胞过程,如内吞作用和细胞极性建立。 FNBP基因家族的共性在于它们均含有FCH和BAR结构域,能够感知和诱导膜曲率变化,并参与细胞骨架重塑和膜运输。家族成员(如FNBP1、FNBP3和FNBP4)在多种细胞活动中发挥关键作用,包括内吞作用、细胞迁移和细胞分裂。FNBP1L作为该家族的一员,共享这些功能,但可能具有组织特异性或更专一的作用机制。总体而言,FNBP1L在细胞骨架调控和神经系统功能中扮演重要角色,其异常表达或突变可能影响多种生理和病理过程。

The protein encoded by this gene binds to both CDC42 and N-WASP. This protein promotes CDC42-induced actin polymerization by activating the N-WASP-WIP complex and, therefore, is involved in a pathway that links cell surface signals to the actin cytoskeleton. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白结合两个CDC42和N-WASP。该蛋白质通过激活N-WASP-WIP复杂促进CDC42诱导肌动蛋白聚合,因此,参与链接细胞表面信号的肌动蛋白细胞骨架的路径。在多个转录剪接变异体导致编码不同亚型。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

FNBP1L基因的碱基序列:[NCBI]
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FNBP1L基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs11683       rs23766       rs237433       rs237434       rs237435       rs698931       rs698933       rs1417884       rs1417885       rs3754188       rs3754189       rs3767969       rs6662891       rs6674143       rs6702206       rs7525522       rs7525880      

FNBP1L基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGAAAGAAGCCAAAGCCAC
60
GAAACTGGGACCCATTAGGA
59
AATCCATAAGAATGAGGCTTGG
58
TATGTCACTGCTATGTCTTCTG
57
AAGAGCCACGGTTTACCTC
60
CTACAACTTCTCGCTGTCCT
60
AAGAGCCACGGTTTACCTC
60
CTACAACTTCTCGCTGTCCT
60
AATCCATAAGAATGAGGCTTGG
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TATGTCACTGCTATGTCTTCTG
58
GGAAAGAAGCCAAAGCCAC
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59
GGAAAGAAGCCAAAGCCAC
60
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59
AAAGAAGCCAAAGCCACAG
59
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59
ATCCATAAGAATGAGGCTTGG
58
TATGTCACTGCTATGTCTTCTG
58
GAAGAGCCACGGTTTACCT
60
TACAACTTCTCGCTGTCCTG
60
      尚未收录相关数据

FNBP1L基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

FNBP1L基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0006897
A0A075B6Q2 (UniProtKB)
IEA
GO:0005086
Q5T0N5 (UniProtKB)
IBA
GO:0005515
Q5T0N5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q5T0N5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005737
Q5T0N5 (UniProtKB)
IDA
GO:0005802
Q5T0N5 (UniProtKB)
IBA
GO:0005856
Q5T0N5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q5T0N5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005938
Q5T0N5 (UniProtKB)
IEA
GO:0006900
Q5T0N5 (UniProtKB)
IDA
GO:0006914
Q5T0N5 (UniProtKB)
IEA
GO:0008289
Q5T0N5 (UniProtKB)
IEA
GO:0010324
Q5T0N5 (UniProtKB)
IDA
GO:0016023
Q5T0N5 (UniProtKB)
IDA
GO:0016050
Q5T0N5 (UniProtKB)
IDA
GO:0030050
Q5T0N5 (UniProtKB)
IDA
GO:0042384
Q5T0N5 (UniProtKB)
IMP
GO:0043547
Q5T0N5 (UniProtKB)
IEA
GO:0051491
Q5T0N5 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q5T0N5 (UniProtKB)
IDA
GO:0072583
Q5T0N5 (UniProtKB)
IDA
GO:0097320
Q5T0N5 (UniProtKB)
IDA
GO:0006897
S4R347 (UniProtKB)
IEA

可能调控 FNBP1L基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Neoplasm Metastasis 0.000542884 2 0 BeFree
Secondary malignant neoplasm of lung 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000542884 2 0 BeFree
Breast adenocarcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Mammary Neoplasms 0.000271442 1 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

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