FRAT2 (FRAT regulator of WNT signaling pathway 2)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
FRAT2
locus group:
protein-coding gene
location:
10q24.1
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
GSK-3 binding protein FRAT2
entrez id:
23401
ensembl gene id:
ENSG00000181274
ucsc gene id:
uc001knd.2
refseq accession:
NM_012083
hgnc_id:
HGNC:16048
approved reserved:
2001-07-06

基因染色体位置

基因染色体位置

10q24.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

FRAT2（Frequently Rearranged in Advanced T-cell Lymphomas 2）属于FRAT基因家族，该家族包括FRAT1和FRAT2两个成员，均参与Wnt/β-catenin信号通路的调控。FRAT2的主要功能是通过与GSK-3β（糖原合成酶激酶3β）结合，阻止其磷酸化β-catenin，从而稳定β-catenin并促进其核转位，激活下游靶基因的转录，影响细胞增殖、分化和凋亡。FRAT2在多种癌症中过表达，如T细胞淋巴瘤、结直肠癌和乳腺癌，与肿瘤侵袭性和不良预后相关。若FRAT2过表达，可能过度激活Wnt通路，导致细胞异常增殖和肿瘤发生；反之，降低表达可能抑制肿瘤生长，但可能影响正常组织发育。FRAT2突变的研究较少，但功能丧失突变可能削弱Wnt信号传导，而功能获得性突变可能加剧致癌效应。FRAT基因家族的共性是与GSK-3β相互作用并调控Wnt通路，但FRAT1主要在胚胎发育中起作用，而FRAT2更多与癌症相关。专业术语解释：Wnt/β-catenin通路（调控细胞命运的经典信号途径）、GSK-3β（一种激酶，可标记β-catenin使其降解）、核转位（蛋白质进入细胞核的过程）。目前FRAT2的中文译名较统一，无需额外标注英文。

The protein encoded by this intronless gene belongs to the GSK-3-binding protein family. Studies show that this protein plays a role as a positive regulator of the WNT signaling pathway. It may be upregulated in tumor progression. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该内含子基因编码的蛋白质属于GSK-3结合蛋白家族。研究表明，这种蛋白质发挥作用的Wnt信号通路的正调节。它可能在肿瘤进展中上调。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对FRAT2基因的介绍     Wikipedia数据库中对FRAT2基因的介绍

基因序列

基因序列

FRAT2基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

FRAT2基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs915196       rs945189       rs1890966       rs3740518       rs3740519       rs7095780       rs10882899       rs11189134       rs11189135       rs11189136       rs11189137       rs11331137       rs12267671       rs12359467       rs12413688       rs12571098       rs12767255      

基因表达

基因表达

FRAT2基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AAACCTCATCAAGGAAGCC
58
TTAGTAGGAACTGGACGCTG
59
GAAACCTCATCAAGGAAGCC
59
TAGTAGGAACTGGACGCTG
59
AAACCTCATCAAGGAAGCC
58
TAGTAGGAACTGGACGCTG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

FRAT2基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

FRAT2基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003674
O75474 (UniProtKB)
ND
GO:0005575
O75474 (UniProtKB)
ND
GO:0005829
O75474 (UniProtKB)
TAS
GO:0007275
O75474 (UniProtKB)
NAS
GO:0008283
O75474 (UniProtKB)
NAS
GO:1904886
O75474 (UniProtKB)
TAS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 FRAT2基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Stomach Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of stomach 0.000542884 2 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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