GFRA1 (GDNF family receptor alpha 1)

symbol:
GFRA1
locus group:
protein-coding gene
location:
10q25.3
gene_family:
alias symbol:
RETL1|GDNFR|GFR-ALPHA-1|RET1L|TRNR1
alias name:
None
entrez id:
2674
ensembl gene id:
ENSG00000151892
ucsc gene id:
uc009xyr.4
refseq accession:
NM_145793
hgnc_id:
HGNC:4243
approved reserved:
1997-01-17
10q25.3
基因染色体位置图

GFRA1(GDNF Family Receptor Alpha 1)是胶质细胞源性神经营养因子(GDNF)家族受体α的一员,属于GDNF受体家族。这个基因家族包括GFRA1、GFRA2、GFRA3和GFRA4,它们共同的特点是作为GDNF家族配体(如GDNF、neurturin、artemin和persephin)的共受体,与RET酪氨酸激酶受体结合形成复合物,激活下游信号通路,参与神经元的存活、分化、迁移和突触可塑性等过程。GFRA1主要与GDNF结合,在中枢和周围神经系统的发育及维持中发挥关键作用,特别是在多巴胺能神经元、运动神经元和感觉神经元的存活与功能中尤为重要。GFRA1的表达部位包括肾脏、神经系统(如黑质、脊髓背根神经节)以及睾丸等组织。GFRA1的功能异常或突变可能导致多种疾病。例如,GFRA1突变与先天性巨结肠(Hirschsprung病)相关,因为该基因在肠神经嵴细胞的迁移和存活中起重要作用。此外,GFRA1的异常表达还与帕金森病、神经母细胞瘤和某些肾脏疾病有关。在帕金森病中,GFRA1表达下降可能导致多巴胺能神经元退化,而某些癌症中GFRA1过表达可能促进肿瘤细胞存活和侵袭。如果GFRA1过表达,可能增强GDNF/RET信号通路的活性,促进细胞增殖和存活,这在某些情况下可能有益(如神经保护),但也可能增加肿瘤风险。相反,GFRA1表达降低可能导致神经营养支持不足,引发神经元退化或功能障碍,例如运动神经元疾病或感觉神经病变。GFRA1的调控异常还可能影响其他基因或通路,如MAPK/ERK和PI3K/AKT信号通路,进而影响细胞生长、代谢和凋亡。总体而言,GFRA1是神经发育和维持的关键基因,其表达水平需精确调控以维持正常生理功能。

Glial cell line-derived neurotrophic factor (GDNF) and neurturin (NTN) are two structurally related, potent neurotrophic factors that play key roles in the control of neuron survival and differentiation. The protein encoded by this gene is a member of the GDNF receptor family. It is a glycosylphosphatidylinositol(GPI)-linked cell surface receptor for both GDNF and NTN, and mediates activation of the RET tyrosine kinase receptor. This gene is a candidate gene for Hirschsprung disease. Multiple alternatively spliced transcript variants have been described for this gene. [provided by RefSeq, Feb 2009]

胶质细胞源性神经营养因子(GDNF)和neurturin(NTN)是两个结构相关的,有效的神经,在神经元的存活和分化的控制中发挥关键作用的因素。由该基因编码的蛋白质是GDNF受体家族的一个成员。它是一个糖基(GPI) - 连接的细胞表面受体为GDNF和NTN,并介导所述RET酪氨酸激酶受体的激活。这种基因是先天性巨结肠症的候选基因。多个可变剪接转录物变体已被用于这个基因说明。 [由RefSeq的,2009年2月提供]

GFRA1基因的碱基序列:[NCBI]
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GFRA1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs15473       rs180550       rs180551       rs180552       rs180553       rs180554       rs180555       rs730357       rs881042       rs881726       rs886979       rs886980       rs886981       rs899698       rs950677       rs952918       rs952919      

GFRA1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AATTACATCTGCAGATCTCGC
59
CTTTAGACAGCTGCTGACAG
59
CGAATTACATCTGCAGATCTCG
60
TTAGACAGCTGCTGACAGAC
60
ACGAATTACATCTGCAGATCTC
59
TAGACAGCTGCTGACAGAC
59
      尚未收录相关数据

GFRA1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

GFRA1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000165
P56159 (UniProtKB)
TAS
GO:0005088
P56159 (UniProtKB)
TAS
GO:0005102
P56159 (UniProtKB)
TAS
GO:0005622
P56159 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
P56159 (UniProtKB)
TAS
GO:0007166
P56159 (UniProtKB)
NAS
GO:0007399
P56159 (UniProtKB)
IEA
GO:0016167
P56159 (UniProtKB)
TAS
GO:0019898
P56159 (UniProtKB)
TAS
GO:0031225
P56159 (UniProtKB)
IEA
GO:0035860
P56159 (UniProtKB)
IEA
GO:0043547
P56159 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
P56159 (UniProtKB)
IDA

可能调控 GFRA1基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Neuralgia 0.12 1 0 CTD_human
Parkinsonian Disorders 0.08 2 0 RGD
Sciatic Neuropathy 0.08 1 0 RGD
Brain Ischemia 0.08 1 0 RGD
Cerebrovascular accident 0.08 1 0 RGD
Hyperalgesia 0.08 1 0 RGD
Hirschsprung Disease 0.005905708 5 0 BeFree_GAD_LHGDN
Thyroid carcinoma 0.004734064 2 0 GAD
Neoplasms, Germ Cell and Embryonal 0.00272435 1 0 LHGDN
Thyroid Neoplasm 0.00272435 1 0 LHGDN

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