GHET1 (gastric carcinoma proliferation enhancing transcript 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
GHET1
locus group:
non-coding RNA
location:
7q36.1
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
lncRNA-GHET1
alias name:
gastric carcinoma high expressed t…
entrez id:
102723099
ensembl gene id:
ENSG00000281189
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_130107
hgnc_id:
HGNC:49425
approved reserved:
2014-01-07

基因染色体位置

基因染色体位置

7q36.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

GHET1（Gastric High Expressed Transcript 1）是一种长链非编码RNA（lncRNA），主要在人胃组织中高表达，其功能与细胞增殖、凋亡和肿瘤发生密切相关。GHET1通过调控多种信号通路影响癌症的发展，尤其在胃癌中表现突出。它能够结合并稳定c-Myc mRNA，增强其表达，从而促进肿瘤细胞的增殖和转移。此外，GHET1还能与胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白1（IGF2BP1）相互作用，进一步稳定癌基因的mRNA，增强肿瘤的恶性表型。GHET1的突变或异常表达可能导致其功能失调，进而影响相关信号通路的正常调控，促进肿瘤的发生和发展。研究表明，GHET1在多种癌症中过表达，如胃癌、肝癌和结直肠癌，与肿瘤的进展、侵袭性和不良预后密切相关。当GHET1过表达时，会显著增强癌细胞的增殖、迁移和侵袭能力，同时抑制凋亡；而降低GHET1表达则能抑制肿瘤生长并促进癌细胞凋亡。GHET1属于lncRNA家族，这一家族的成员通常不编码蛋白质，但通过调控基因表达、染色质修饰和信号转导等机制在多种生物学过程中发挥重要作用。lncRNA家族的共性包括参与表观遗传调控、作为竞争性内源RNA（ceRNA）吸附miRNA，以及通过结合蛋白质或RNA分子影响细胞功能。GHET1的深入研究有助于理解其在癌症中的作用机制，并为肿瘤的诊断和治疗提供潜在靶点。

This gene encodes an unspliced long non-coding RNA that has been suggested to promote the proliferation of gastric carcinoma cells and bladder cancer cells. [provided by RefSeq, Dec 2014]

None

OMIM数据库中对GHET1基因的介绍     Wikipedia数据库中对GHET1基因的介绍

基因序列

基因序列

GHET1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

GHET1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2616856       rs2616857       rs7784971       rs12671106       rs35954058       rs36108747       rs55754821       rs56043350       rs56104013       rs56276044       rs56692209       rs56714074       rs58650856       rs71529654       rs75228237       rs75471843       rs77186221      

基因表达

基因表达

GHET1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTGTTTCTCAGCCAGATCC
58
TCAGTGTCTTCATTTGTGGG
58
TGTTTCTCAGCCAGATCCT
58
TTCAGTGTCTTCATTTGTGGG
59
TGTTTATACCTTTCACTCTGCC
59
GTCCACATAGTAGACTAGATCACC
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

GHET1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

GHET1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 GHET1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Stomach Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of urinary bladder 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinoma of bladder 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of stomach 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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