GJD4 (gap junction protein delta 4)

symbol:
GJD4
locus group:
protein-coding gene
location:
10p11.21
gene_family:
Gap junction proteins
alias symbol:
CX40.1|FLJ90023
alias name:
connexin 40.1
entrez id:
219770
ensembl gene id:
ENSG00000177291
ucsc gene id:
uc001iyy.1
refseq accession:
NM_153368
hgnc_id:
HGNC:23296
approved reserved:
2007-11-06
10p11.21
基因染色体位置图

GJD4(Gap Junction Delta 4)是连接蛋白基因家族(Connexin gene family)的成员之一,属于delta亚家族。该基因家族编码的蛋白质是间隙连接(gap junction)的主要组成成分,这些蛋白质在细胞间通讯中起关键作用,允许小分子、离子和代谢物在相邻细胞间直接传递,从而协调组织功能,如电信号传导(如心肌细胞同步收缩)和代谢协同。GJD4编码的蛋白Connexin-40.1(Cx40.1)主要在心脏、血管内皮和部分神经组织中表达,对心脏电传导系统的稳定性尤为重要。其功能特点包括形成半通道(hemichannels)或完整的间隙连接通道,调控细胞间电耦合和化学信号传递。若GJD4发生功能丧失性突变,可能导致心脏传导异常,如心律失常或房室传导阻滞,因其影响心肌细胞的电同步性。相反,过表达GJD4可能增强细胞间耦合,但过度电信号传递在某些情况下可能诱发异常电活动。该基因与家族性心房颤动等疾病相关,部分病例中检测到其突变。基因家族共性包括:均含4个跨膜结构域,N端和C端位于胞内,通过保守的胱氨酸残基形成二硫键稳定结构。其他成员如GJA1(Cx43)、GJB2(Cx26)分别参与心脏发育和听力功能。GJD4表达水平受转录因子(如NKX2-5)和病理条件(如心肌缺血)调控,其下调可能导致组织电活动脱节,而上调可能影响其他连接蛋白(如Cx43)的分布,引发代偿性功能重组。研究还提示GJD4与血管发育相关,可能通过调节内皮细胞通讯影响血管张力。

Connexins, such as GJD4, are involved in the formation of gap junctions, intercellular conduits that directly connect the cytoplasms of contacting cells. Each gap junction channel is formed by docking of 2 hemichannels, each of which contains 6 connexin subunits (Sohl et al., 2003 [PubMed 12881038]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

连接蛋白,如GJD4,涉及间隙连接,细胞间的导管直接连接接触的细胞的细胞质的形成。每个间隙连接通道由2半通道,其每一个含有6个连接蛋白亚基(佐尔等人,2003 [搜索PubMed 12881038])对接而形成。[由OMIM,2008年3月提供的]

GJD4基因的碱基序列:[NCBI]
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GJD4基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs595652       rs622692       rs625042       rs627267       rs637881       rs637928       rs638413       rs657039       rs976573       rs1008787       rs2384382       rs2486502       rs4934760       rs7919686       rs7921764       rs11010233       rs11595555      

GJD4基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATTAAACTGCAACGTGACCA
58
AAGACAATCACCAGCATCC
57
TTAAACTGCAACGTGACCA
57
CAAGACAATCACCAGCATCC
59
TTAAACTGCAACGTGACCA
57
AAGACAATCACCAGCATCC
57
      尚未收录相关数据

GJD4基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

GJD4基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005922
Q96KN9 (UniProtKB)
IEA
GO:0007154
Q96KN9 (UniProtKB)
IEA
GO:0014717
Q96KN9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q96KN9 (UniProtKB)
IEA

可能调控 GJD4基因的相关microRNA:     

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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