HDAC10 (histone deacetylase 10)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
HDAC10
locus group:
protein-coding gene
location:
22q13.33
gene_family:
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DKFZP761B039
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None
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NM_032019
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HGNC:18128
approved reserved:
2002-04-30

基因染色体位置

基因染色体位置

22q13.33
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

HDAC10（组蛋白去乙酰化酶10）属于组蛋白去乙酰化酶（HDAC）家族中的IIb亚类，该家族共有11个成员（HDAC1-11），主要功能是通过去除组蛋白上的乙酰基团来调控基因表达，从而影响染色质结构和转录活性。HDAC家族成员在细胞增殖、分化、凋亡和代谢等过程中发挥重要作用，并与多种疾病如癌症、神经退行性疾病和免疫疾病密切相关。HDAC10主要定位于细胞质和细胞核，除了参与组蛋白去乙酰化外，还能作用于非组蛋白底物，调控多种信号通路。HDAC10在多种组织中表达，尤其在肾脏、肝脏和免疫系统中表达较高。HDAC10的生物学功能包括调控自噬过程、影响细胞应激反应、参与免疫调节以及维持氧化还原平衡。研究表明，HDAC10通过去乙酰化特定蛋白如热休克蛋白HSP70来影响蛋白质折叠和降解，从而参与细胞保护机制。HDAC10的突变或表达异常可能导致其功能失调，与多种疾病相关。例如，HDAC10表达下调与某些癌症（如神经母细胞瘤和白血病）的进展和不良预后相关，可能通过影响自噬和凋亡途径促进肿瘤细胞存活。相反，HDAC10过表达在某些情况下可能抑制肿瘤生长，显示出组织特异性作用。此外，HDAC10在神经系统中也发挥重要作用，其异常表达可能与神经退行性疾病如阿尔茨海默病有关。HDAC10还参与免疫调节，影响T细胞功能和炎症反应，与自身免疫疾病如类风湿性关节炎存在潜在关联。在基因调控网络中，HDAC10与其他HDAC家族成员（如HDAC6）协同或拮抗作用，共同调控下游靶基因的表达。例如，HDAC10和HDAC6均可调控微管蛋白的乙酰化状态，影响细胞骨架动力学。降低HDAC10表达可能导致自噬功能受损和细胞应激敏感性增加，而过表达可能增强细胞对氧化应激的抵抗能力。HDAC10作为表观遗传调控的关键分子，其功能复杂且具有组织特异性，是疾病治疗（尤其是癌症和神经疾病）的潜在靶点。

The protein encoded by this gene belongs to the histone deacetylase family, members of which deacetylate lysine residues on the N-terminal part of the core histones. Histone deacetylation modulates chromatin structure, and plays an important role in transcriptional regulation, cell cycle progression, and developmental events. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2011]

由该基因编码的蛋白质属于组蛋白脱乙酰家族，成员，其中脱乙酰基的核心组蛋白的N末端部分的赖氨酸残基。组蛋白去乙酰化调节染色质结构，并起着转录调控，细胞周期进展，并发育事件中起重要作用。已发现该基因编码不同亚型选择性剪接转录变异体。 [由RefSeq的，2011年8月提供]

OMIM数据库中对HDAC10基因的介绍     Wikipedia数据库中对HDAC10基因的介绍

基因序列

基因序列

HDAC10基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

HDAC10基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs738334       rs742182       rs760746       rs909688       rs1555048       rs2142849       rs2235354       rs2294404       rs2341111       rs3830750       rs4838866       rs5771271       rs5771274       rs5771275       rs7288675       rs7292864       rs11553697      

基因表达

基因表达

HDAC10基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATGTATCCCTGGTCAGGGA
59
AGTGAAAGGTACTCGGGTG
59
ATGTATCCCTGGTCAGGGA
59
AGTGAAAGGTACTCGGGTG
59
CATGACAGTACAGACGCTG
58
GATGGACTCTAGGGCACTC
59
CATGACAGTACAGACGCTG
58
GATGGACTCTAGGGCACTC
59
CTACACAGGATCCTCGTCG
59
CTCCCTGTAGAACGCTGAC
60
TAGAGTCCATCCAGAGTGC
58
GAACCAATGTGATATCCGGC
59
CTGACGTCATCCAACAGGA
59
TGCTATACCACTGTTCACCTG
60
ATGTATCCCTGGTCAGGGA
59
AGTGAAAGGTACTCGGGTG
59
GGCCTTTGAGGATTTGACTC
59
CTGTCATGCACACTGACTC
59
TATCACATTGGTTCTGCCC
58
GCTATACCACTGTTCACCTG
58

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
HDAC10
TXNIP
Repression
20680488

基因本体信息

HDAC10基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

HDAC10基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016787
C9J8B8 (UniProtKB)
IEA
GO:0016787
Q08AP5 (UniProtKB)
IEA
GO:0000118
Q969S8 (UniProtKB)
IDA
GO:0000122
Q969S8 (UniProtKB)
IDA
GO:0004407
Q969S8 (UniProtKB)
IDA
GO:0004407
Q969S8 (UniProtKB)
IDA
GO:0004407
Q969S8 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
Q969S8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q969S8 (UniProtKB)
IDA
GO:0005634
Q969S8 (UniProtKB)
IDA
GO:0005654
Q969S8 (UniProtKB)
IDA
GO:0005654
Q969S8 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q969S8 (UniProtKB)
TAS
GO:0005737
Q969S8 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q969S8 (UniProtKB)
IDA
GO:0006351
Q969S8 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
Q969S8 (UniProtKB)
IDA
GO:0006476
Q969S8 (UniProtKB)
IDA
GO:0014003
Q969S8 (UniProtKB)
IEA
GO:0016568
Q969S8 (UniProtKB)
NAS
GO:0016575
Q969S8 (UniProtKB)
IDA
GO:0016575
Q969S8 (UniProtKB)
IDA
GO:0019899
Q969S8 (UniProtKB)
IPI
GO:0032041
Q969S8 (UniProtKB)
IEA
GO:0033558
Q969S8 (UniProtKB)
IDA
GO:0042826
Q969S8 (UniProtKB)
IDA
GO:0045892
Q969S8 (UniProtKB)
IDA
GO:0045892
Q969S8 (UniProtKB)
IDA
GO:0070932
Q969S8 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 HDAC10基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Lung Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Schizophrenia 0.002367032 1 0 GAD
Liver carcinoma 0.002367032 1 0 GAD
Hepatitis B, Chronic 0.002367032 1 0 GAD
Liver neoplasms 0.002367032 1 0 GAD
Neoplasm Metastasis 0.000271442 1 0 BeFree
Central neuroblastoma 0.000271442 1 0 BeFree
Neuroblastoma 0.000271442 1 0 BeFree
B-Cell Lymphomas 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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