HOXB7 (homeobox B7)

symbol:
HOXB7
locus group:
protein-coding gene
location:
17q21.32
gene_family:
HOXL subclass homeoboxes
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
3217
ensembl gene id:
ENSG00000260027
ucsc gene id:
uc002inv.4
refseq accession:
NM_004502
hgnc_id:
HGNC:5118
approved reserved:
1990-06-15
17q21.32
基因染色体位置图

HOXB7是HOX基因家族的一员,属于HOXB簇(位于17号染色体上),该家族在进化上高度保守,主要调控胚胎发育过程中的体节模式形成、器官发生及细胞分化。HOX基因家族的共性是通过编码转录因子,结合特定DNA序列调控下游靶基因表达,从而决定身体前后轴发育的时空顺序。HOXB7在多种组织中表达,尤其在造血系统、乳腺、皮肤及神经系统发育中起关键作用。其编码的蛋白质含有典型的同源异型结构域(homeodomain),可识别并结合TAAT核心序列的DNA片段。HOXB7的功能包括促进细胞增殖、抑制凋亡及参与组织再生。在肿瘤中,HOXB7常异常高表达,例如乳腺癌、卵巢癌和白血病中,其过表达通过激活EGFR/MAPK信号通路或上调血管生成因子(如VEGF)促进肿瘤侵袭转移;而在某些实体瘤(如结肠癌)中低表达可能导致分化障碍。突变研究显示,HOXB7的错义突变可能破坏DNA结合能力,导致肢体发育异常(如短指症),而启动子区甲基化引起的沉默与骨髓增生异常综合征相关。该基因还参与免疫调节,过表达会抑制T细胞活化相关基因(如IL-2),而敲低后可能影响造血干细胞自我更新。HOXB7与同家族成员(如HOXB6、HOXB8)存在功能冗余,但特异性调控某些靶基因(如cyclin D1)。在基因家族中,HOXB簇成员通常协同调控胸腺和脊髓发育,而HOXB7的特殊性在于其对上皮-间质转化(EMT)的强诱导作用。

This gene is a member of the Antp homeobox family and encodes a protein with a homeobox DNA-binding domain. It is included in a cluster of homeobox B genes located on chromosome 17. The encoded nuclear protein functions as a sequence-specific transcription factor that is involved in cell proliferation and differentiation. Increased expression of this gene is associated with some cases of melanoma and ovarian carcinoma. [provided by RefSeq, Jul 2008]

此基因是ANTP同源家族的成员,并且编码蛋白质有同源DNA结合结构域。它被包括在位于17号染色??体上的编码核蛋白质的功能作为参与细胞增殖和分化序列特异性转录因子同源b基因序列的簇。该基因的表达增加与黑素瘤和卵巢癌的一些情况相关联。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

HOXB7基因的碱基序列:[NCBI]
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HOXB7基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs9909884       rs189802739       rs538607794       rs555742927       rs573601164       rs575504605       rs377605190       rs9380       rs15689       rs734492       rs890430       rs890431       rs1042216       rs1042226       rs2228185       rs2303483       rs3786138      

HOXB7基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGTAACTTCCGGATCTACCC
58
ATTCTTTCTCCAGCTCCAGG
60
CTGTGTTAGCCAGGAACTG
58
AAATTCTTTCTCCAGCTCCAG
58
GGAAGAGACATGAGAAAGGG
58
GTTTCCTGATTCAGTTCCCA
58
TGTTAGCCAGGAACTGACC
59
GTGAAATTCTTTCTCCAGCTCC
60
GAGTAACTTCCGGATCTACCC
60
TTCTTTCTCCAGCTCCAGG
59
AAGAGACATGAGAAAGGGAGAG
59
GAGTTTCCTGATTCAGTTCCC
59
GTGTTAGCCAGGAACTGAC
58
TGAAATTCTTTCTCCAGCTCC
58
AGTAACTTCCGGATCTACCC
58
TTCTTTCTCCAGCTCCAGG
59
GAAGAGACATGAGAAAGGGAG
58
AGTTTCCTGATTCAGTTCCC
58
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
HOXB7
CCND1
Activation
HOXB7
CDKN1B
Repression
HOXB7
DAPK1
Repression
HOXB7
EGFR
Activation
HOXB7
FGF2
Activation
HOXB7
MMP2
Activation
HOXB7
PDGFA
Activation
HOXB7
THBS2
Repression
HOXB7
VEGFA
Activation
HOXB7
WNT5A
Activation

HOXB7基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

HOXB7基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003700
P09629 (UniProtKB)
NAS
GO:0005515
P09629 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P09629 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P09629 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
P09629 (UniProtKB)
NAS
GO:0005654
P09629 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
P09629 (UniProtKB)
IDA
GO:0006351
P09629 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
P09629 (UniProtKB)
NAS
GO:0007275
P09629 (UniProtKB)
NAS
GO:0009952
P09629 (UniProtKB)
IEA
GO:0030099
P09629 (UniProtKB)
IEA
GO:0043565
P09629 (UniProtKB)
IEA
GO:0048704
P09629 (UniProtKB)
IEA
GO:0090190
P09629 (UniProtKB)
IEA

可能调控 HOXB7基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Glioblastoma 0.003267234 2 0 BeFree_LHGDN
Bile Duct Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Hirschsprung Disease 0.002367032 1 0 GAD
Breast Carcinoma 0.001900093 7 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.001900093 7 0 BeFree
Tumor Progression 0.000814326 3 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000814326 3 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000814326 3 0 BeFree
Pancreatic carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of pancreas 0.000542884 2 0 BeFree

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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