HPGDS (hematopoietic prostaglandin D synthase)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
HPGDS
locus group:
protein-coding gene
location:
4q22.3
gene_family:
Glutathione S-transferases
alias symbol:
GSTS|PGDS|H-PGDS|PGD2|GSTS1-1|GSTS1
alias name:
glutathione S-transferase sigma
entrez id:
27306
ensembl gene id:
ENSG00000163106
ucsc gene id:
uc003hte.2
refseq accession:
NM_014485
hgnc_id:
HGNC:17890
approved reserved:
2009-07-14

基因染色体位置

基因染色体位置

4q22.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

HPGDS（造血前列腺素D合成酶）是一种关键的酶，属于谷胱甘肽S-转移酶（GST）超家族中的Sigma类家族成员。它的主要功能是催化前列腺素H2（PGH2）转化为前列腺素D2（PGD2），后者是一种重要的脂质介质，参与多种生理和病理过程，包括炎症反应、免疫调节、过敏反应和睡眠调节。PGD2通过与受体DP1和DP2（CRTH2）结合发挥作用，影响多种细胞类型，如肥大细胞、嗜酸性粒细胞和Th2细胞。HPGDS主要在造血系统中表达，特别是在肥大细胞、巨噬细胞和树突状细胞中高度活跃。HPGDS的突变可能导致其酶活性改变，进而影响PGD2的产生。PGD2水平异常与多种疾病相关，例如过敏性疾病（如哮喘和过敏性鼻炎）、自身免疫疾病和某些癌症。HPGDS过表达会导致PGD2水平升高，可能加剧炎症和过敏反应，而降低表达则可能减少PGD2的产生，从而减轻这些症状。此外，HPGDS的活性还可能影响其他信号通路，如NF-κB和MAPK通路，进一步调节免疫和炎症反应。作为GST超家族的一员，HPGDS与其他GST家族成员共享谷胱甘肽结合和催化活性，但Sigma类家族成员（如HPGDS和MGST1）更倾向于参与类花生酸代谢。HPGDS的研究为开发针对炎症和免疫相关疾病的治疗策略提供了潜在靶点。

Prostaglandin-D synthase is a sigma class glutathione-S-transferase family member. The enzyme catalyzes the conversion of PGH2 to PGD2 and plays a role in the production of prostanoids in the immune system and mast cells. The presence of this enzyme can be used to identify the differentiation stage of human megakaryocytes. [provided by RefSeq, Jul 2008]

前列腺素D合成酶是一个Σ类谷胱甘肽-S-转移酶家族成员。酶催化PGH 2的对PGD 2的转化率和起到在生产在免疫系统细胞和肥大细胞的前列腺素的作用。这种酶的存在可以被用于识别人的巨核细胞的分化阶段。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对HPGDS基因的介绍     Wikipedia数据库中对HPGDS基因的介绍

基因序列

基因序列

HPGDS基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

HPGDS基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs724260       rs767657       rs901615       rs901616       rs1344612       rs1386531       rs1426575       rs1906238       rs2016476       rs2016483       rs2059605       rs2059606       rs2129595       rs2171381       rs2289186       rs2865351       rs2865352      

基因表达

基因表达

HPGDS基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAAATCAACTCTCCCATTTGG
58
CTTGCTATTGCTAGGCTCTG
59
CTTATTGGTAACTCTGTAACTTGGG
60
CAGGTCAGGCTTAAAGACCA
60
CAAATCAACTCTCCCATTTGG
58
CTTGCTATTGCTAGGCTCTG
59
CATATAAACCCAAGGCACAGTC
60
TGGTGCAATTCTGTGTTATGTC
60
GAAGTTGATGGACTTACTCTTCAC
60
TGTGTTTCCAGCCAAATCTG
59
GAAGTTGATGGACTTACTCTTCAC
60
TGTGTTTCCAGCCAAATCTG
59
TAATGCGCCTCATCTTATGC
59
GCCCAAGTTACAGAGTTACC
58
TCATATAAACCCAAGGCACAG
58
GGTGCAATTCTGTGTTATGTC
58
TTGGAAGTTGATGGACTTACTC
58
GTTTCCAGCCAAATCTGTG
57
CGCCTCATCTTATGCAAGAC
59
AGTCTGCCCAAGTTACAGAG
60

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
POU2F1
HPGDS
Unknown
10998423

基因本体信息

HPGDS基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

HPGDS基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000287
O60760 (UniProtKB)
IDA
GO:0004364
O60760 (UniProtKB)
TAS
GO:0004667
O60760 (UniProtKB)
EXP
GO:0004667
O60760 (UniProtKB)
IDA
GO:0005509
O60760 (UniProtKB)
IDA
GO:0005515
O60760 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O60760 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O60760 (UniProtKB)
IPI
GO:0005737
O60760 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
O60760 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
O60760 (UniProtKB)
TAS
GO:0006693
O60760 (UniProtKB)
IDA
GO:0007165
O60760 (UniProtKB)
NAS
GO:0007626
O60760 (UniProtKB)
TAS
GO:0019371
O60760 (UniProtKB)
TAS
GO:0042803
O60760 (UniProtKB)
IPI
GO:1901687
O60760 (UniProtKB)
TAS
GO:2000255
O60760 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 HPGDS基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Testicular Germ Cell Tumor 0.240542884 2 3 BeFree_CTD_human_GWASCAT
Liver diseases 0.120271442 2 0 BeFree_CTD_human
Carcinoma of lung 0.017100838 63 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.016829396 62 7 BeFree
Breast Carcinoma 0.016557954 61 7 BeFree
Malignant neoplasm of lung 0.016557954 61 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.016557954 61 1 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.016286512 60 1 BeFree
Asthma 0.012486326 46 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.012214884 45 2 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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