ICMT (isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
ICMT
locus group:
protein-coding gene
location:
1p36.31
gene_family:
alias symbol:
PCCMT|HSTE14|PPMT
alias name:
protein-S-isoprenylcysteine O-meth…
entrez id:
23463
ensembl gene id:
ENSG00000116237
ucsc gene id:
uc001amk.4
refseq accession:
NM_012405
hgnc_id:
HGNC:5350
approved reserved:
2000-01-20

基因染色体位置

基因染色体位置

1p36.31
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

ICMT（异戊二烯基半胱氨酸羧基甲基转移酶）是一种关键的酶，属于蛋白质羧基甲基转移酶家族。它的主要功能是对异戊二烯化蛋白（如Ras、Rho等小G蛋白）的C端半胱氨酸残基进行羧基甲基化修饰，这一修饰过程对于这些蛋白的膜定位和功能至关重要。ICMT的作用位点位于内质网膜上，通过催化S-腺苷甲硫氨酸（SAM）提供的甲基基团转移至异戊二烯化蛋白的C端羧基，从而增强其疏水性，促进蛋白与细胞膜的相互作用。ICMT的突变可能导致其酶活性丧失或降低，进而影响Ras等蛋白的膜定位和信号传导功能，与多种癌症（如胰腺癌、肺癌）和发育异常相关。研究表明，ICMT的过表达可能增强Ras蛋白的致癌活性，促进肿瘤细胞的增殖和转移；而降低ICMT表达或抑制其活性则能减弱Ras信号通路，抑制肿瘤生长。ICMT属于蛋白质甲基转移酶家族，该家族成员通常通过甲基化修饰调控蛋白功能，参与细胞信号转导、基因表达调控等重要生物学过程。ICMT的特异性在于其专一作用于异戊二烯化蛋白的羧基甲基化，这一特性使其成为抗癌药物开发的潜在靶点。

This gene encodes the third of three enzymes that posttranslationally modify isoprenylated C-terminal cysteine residues in certain proteins and target those proteins to the cell membrane. This enzyme localizes to the endoplasmic reticulum. Alternative splicing may result in other transcript variants, but the biological validity of those transcripts has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]

这个基因编码三种酶是翻译后修饰中的某些蛋白质isoprenylated C-末端半胱氨酸残基，并将这些蛋白质在细胞膜的三分之一。这种酶定位于内质网。选择性剪接可能导致其他转录变异体，但这些转录物的生物有效性尚未确定。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对ICMT基因的介绍     Wikipedia数据库中对ICMT基因的介绍

基因序列

基因序列

ICMT基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

ICMT基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2732       rs14281       rs846106       rs846107       rs846108       rs846109       rs846110       rs1059867       rs1064721       rs1064729       rs1802353       rs2057007       rs2206540       rs3221751       rs3747974       rs3747976       rs3789517      

基因表达

基因表达

ICMT基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TATACCAAAGAGGCTTACGGG
59
GTCCTTAAGGAGTTCATCTTGG
58
ATATACCAAAGAGGCTTACGG
57
GTCCTTAAGGAGTTCATCTTGG
59
CATCCGAGCTTGTTTCCTG
59
GATGCACTAGATGTGACCAG
58
CTTTGGCTGGTACATGTGC
60
GAAAGGAATCCAAGGACAGAC
59
CGCTACCAGATAGCCATCC
60
GACTCCAAGAAGACTGGCT
59
CGCTACCAGATAGCCATCC
59
GACTCCAAGAAGACTGGCT
59
CATCCGAGCTTGTTTCCTG
59
TGCACTAGATGTGACCAGC
60
GCTACCAGATAGCCATCCG
60
TGACTCCAAGAAGACTGGC
59
ATATACCAAAGAGGCTTACGG
57
TCCTTAAGGAGTTCATCTTGG
57
ATACCAAAGAGGCTTACGGG
59
GTCCTTAAGGAGTTCATCTTGG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

ICMT基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ICMT基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
K7EQW0 (UniProtKB)
IEA
GO:0003880
O60725 (UniProtKB)
TAS
GO:0004671
O60725 (UniProtKB)
TAS
GO:0005783
O60725 (UniProtKB)
IDA
GO:0005789
O60725 (UniProtKB)
TAS
GO:0006464
O60725 (UniProtKB)
TAS
GO:0006481
O60725 (UniProtKB)
IEA
GO:0006612
O60725 (UniProtKB)
TAS
GO:0016020
O60725 (UniProtKB)
TAS
GO:0016021
O60725 (UniProtKB)
IEA
GO:0043687
O60725 (UniProtKB)
TAS
GO:0046498
O60725 (UniProtKB)
IEA
GO:0046499
O60725 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q7Z750 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 ICMT基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
IGA Glomerulonephritis 0.12 1 0 CTD_human
Spina Bifida 0.002367032 1 0 GAD
Metabolic Syndrome X 0.002367032 1 0 GAD
Osteosarcoma of bone 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000271442 1 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000271442 1 0 BeFree
Osteosarcoma 0.000271442 1 0 BeFree
Pancreatic Ductal Adenocarcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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