IFI30 (IFI30 lysosomal thiol reductase)

symbol:
IFI30
locus group:
protein-coding gene
location:
19p13.11
gene_family:
alias symbol:
IFI-30|GILT|IP30|MGC32056|IP-30
alias name:
gamma-interferon-inducible lysosom…
entrez id:
10437
ensembl gene id:
ENSG00000216490
ucsc gene id:
uc002nic.3
refseq accession:
NM_006332
hgnc_id:
HGNC:5398
approved reserved:
1999-12-09
19p13.11
基因染色体位置图

IFI30(Interferon Gamma Inducible Protein 30)是一种由干扰素γ(IFN-γ)诱导表达的基因,主要编码溶酶体硫醇还原酶(GILT),在免疫系统中发挥重要作用。其表达产物GILT蛋白的主要功能是还原二硫键,帮助抗原呈递细胞(如树突状细胞和巨噬细胞)处理外源性蛋白质抗原,使其能够被主要组织相容性复合体(MHC)II类分子识别并激活T细胞免疫应答。IFI30在溶酶体中高度表达,通过还原蛋白质的二硫键,促进抗原的降解和加工,从而增强机体的适应性免疫反应。该基因的突变可能导致抗原加工异常,影响免疫系统的正常功能,增加感染或自身免疫性疾病的风险。研究表明,IFI30在某些自身免疫性疾病(如类风湿性关节炎和多发性硬化症)以及某些癌症(如黑色素瘤和乳腺癌)中表达异常,可能参与疾病的发生和发展。如果IFI30过表达,可能会增强抗原呈递效率,但过度免疫激活也可能导致自身免疫反应;而降低表达则可能削弱免疫应答,增加感染风险或降低抗肿瘤免疫力。IFI30属于干扰素刺激基因(ISG)家族,该家族成员通常由干扰素(如IFN-α、IFN-β或IFN-γ)诱导表达,参与抗病毒、免疫调节和细胞增殖抑制等生物学过程。这一家族的基因共性在于它们多与先天免疫和适应性免疫相关,能够响应细胞因子信号,调控免疫细胞的活化和功能。IFI30作为ISG家族的一员,其表达受干扰素信号通路(如JAK-STAT通路)调控,进一步体现了其在免疫防御中的关键作用。

The protein encoded by this gene is a lysosomal thiol reductase that at low pH can reduce protein disulfide bonds. The enzyme is expressed constitutively in antigen-presenting cells and induced by gamma-interferon in other cell types. This enzyme has an important role in MHC class II-restricted antigen processing. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白质是溶酶体硫醇还原酶,在低pH值可减少蛋白质二硫键。所述酶在抗原呈递细胞组成型表达并通过在其他细胞类型γ-干扰素诱导。这种酶在MHC II类限制性抗原加工中起重要作用。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

IFI30基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
IFI30基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2082       rs2921       rs7125       rs15057       rs15953       rs200372       rs200373       rs200374       rs200375       rs200376       rs273262       rs273263       rs273264       rs273265       rs273266       rs273267       rs887945      

IFI30基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAACTTGACATGGAGCTAGC
59
TAGAGCTGCAGGCATAGTG
59
CCACCAGTTAACTACAAGACAG
59
GAGGGTCACATTGACAAGC
59
ACTTGACATGGAGCTAGCC
60
TAGAGCTGCAGGCATAGTG
59
CACCAGTTAACTACAAGACAGG
59
GAGGGTCACATTGACAAGC
59
CTTGACATGGAGCTAGCCT
59
TAGAGCTGCAGGCATAGTG
59
CCAGTTAACTACAAGACAGGC
59
GAGGGTCACATTGACAAGC
59
      尚未收录相关数据

IFI30基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

IFI30基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
P13284 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P13284 (UniProtKB)
IPI
GO:0005576
P13284 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
P13284 (UniProtKB)
IDA
GO:0005764
P13284 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
P13284 (UniProtKB)
IDA
GO:0016667
P13284 (UniProtKB)
EXP
GO:0016667
P13284 (UniProtKB)
IMP
GO:0016667
P13284 (UniProtKB)
EXP
GO:0019886
P13284 (UniProtKB)
TAS
GO:0030054
P13284 (UniProtKB)
IDA
GO:0042590
P13284 (UniProtKB)
ISS
GO:0043202
P13284 (UniProtKB)
TAS
GO:0043202
P13284 (UniProtKB)
TAS
GO:0043231
P13284 (UniProtKB)
IDA
GO:0048147
P13284 (UniProtKB)
IEA
GO:0050821
P13284 (UniProtKB)
IEA
GO:0055114
P13284 (UniProtKB)
IEA
GO:0060333
P13284 (UniProtKB)
TAS

可能调控 IFI30基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Leukemia, Myelocytic, Acute 0.12 1 0 CTD_human
Dermatitis, Allergic Contact 0.12 1 0 CTD_human
melanoma 0.005720142 3 0 BeFree_LHGDN
Neuromyelitis Optica 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Obesity 0.000542884 2 1 BeFree
Tumor Immunity 0.000271442 1 0 BeFree
Cirrhosis 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinoma breast stage IV 0.000271442 1 0 BeFree
Diabetes Mellitus 0.000271442 1 1 BeFree

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。