IGSF21 (immunoglobin superfamily member 21)

symbol:
IGSF21
locus group:
protein-coding gene
location:
1p36.13
gene_family:
V-set domain containing|Immunoglobulin-like domain containing
alias symbol:
MGC15730|RP11-121A23.1
alias name:
None
entrez id:
84966
ensembl gene id:
ENSG00000117154
ucsc gene id:
uc001bau.3
refseq accession:
NM_032880
hgnc_id:
HGNC:28246
approved reserved:
2005-07-21
1p36.13
基因染色体位置图

IGSF21(Immunoglobulin Superfamily Member 21)属于免疫球蛋白超家族(IgSF),该家族是一类广泛存在于细胞表面的蛋白质,通常参与细胞间识别、黏附和信号传导。IGSF21基因编码的蛋白含有典型的免疫球蛋白样结构域,可能在神经系统的发育或功能中发挥作用,但目前其具体生物学功能尚未完全明确。研究表明,IGSF21可能参与神经元之间的相互作用或突触形成,尤其在嗅觉系统中表达较高,暗示其可能与嗅觉信号传导或神经回路建立有关。若IGSF21发生突变,可能导致其蛋白结构或功能异常,进而影响神经细胞间的通讯,但具体致病机制尚待研究。目前尚未发现IGSF21与特定疾病的直接关联,但免疫球蛋白超家族成员常与神经系统疾病、免疫失调或癌症相关,因此IGSF21可能在这些领域具有潜在研究价值。如果IGSF21过表达,可能会干扰正常的细胞间信号传递,导致神经功能异常;而表达降低则可能影响突触可塑性或神经元网络的形成。免疫球蛋白超家族的共性包括含有免疫球蛋白样结构域、参与细胞间相互作用及免疫调节等。由于IGSF21研究仍处于早期阶段,更多功能及机制需进一步探索。

This gene encodes a protein which has two immunoglobulin (Ig) domains and is a member of the immunoglobulin superfamily. Proteins in this superfamily are usually found on or in cell membranes and act as receptors in immune response pathways. [provided by RefSeq, Sep 2011]

这基因编码具有两个免疫球蛋白(Ig)结构域,并且是??免疫球蛋白超家族的成员的蛋白。在此超家族蛋白通常上或在细胞膜中发现并充当免疫应答途径的受体。 [由RefSeq的,2011年9月提供]

IGSF21基因的碱基序列:[NCBI]
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IGSF21基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs77633       rs100622       rs109489       rs109490       rs170341       rs192002       rs223155       rs223156       rs223157       rs223158       rs223159       rs223160       rs223161       rs223162       rs223163       rs223164       rs223165      

IGSF21基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTCTGACCTGGCCTTTCTC
60
GAAGACTTCGTTCTGAAACCC
59
CGGAGGACTCTAATGGTTCC
60
ACGTCAGCTCCAGAATCAC
60
CGGAGGACTCTAATGGTTCC
60
ACGTCAGCTCCAGAATCAC
60
CACCTCCATTGAAGTGGTG
58
TGAAATAAACCATGGGTGCTG
59
CACCTCCATTGAAGTGGTG
59
TGAAATAAACCATGGGTGCT
58
CTCTGACCTGGCCTTTCTC
60
AGACTTCGTTCTGAAACCCA
59
GGAGGACTCTAATGGTTCCA
59
GTCAGCTCCAGAATCACTG
58
ACCTCCATTGAAGTGGTGG
59
TGAAATAAACCATGGGTGCTG
59
CACCTCCATTGAAGTGGTG
59
TGAAATAAACCATGGGTGCTG
59
GGAGGACTCTAATGGTTCCA
59
GTCAGCTCCAGAATCACTG
58
      尚未收录相关数据

IGSF21基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

IGSF21基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005576
Q96ID5 (UniProtKB)
IEA

可能调控 IGSF21基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Bladder Neoplasm 0.12 1 0 CTD_human
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD

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