ITFG1 (integrin alpha FG-GAP repeat containing 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
ITFG1
locus group:
protein-coding gene
location:
16q12.1
gene_family:
alias symbol:
CDA08|TIP|LNKN-1
alias name:
T cell immunomodulatory protein|LI…
entrez id:
81533
ensembl gene id:
ENSG00000129636
ucsc gene id:
uc002eet.4
refseq accession:
NM_030790
hgnc_id:
HGNC:30697
approved reserved:
2006-03-06

基因染色体位置

基因染色体位置

16q12.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

ITFG1（Integrin Alpha FG-GAP Repeat Containing 1）是一种编码跨膜蛋白的基因，属于整合素相关蛋白家族。该基因的主要功能与细胞粘附、迁移和信号传导相关，其表达产物通过参与细胞外基质（ECM）的相互作用调控细胞行为。ITFG1蛋白结构中含有FG-GAP重复序列，这一特征常见于整合素相互作用蛋白，暗示其可能在整合素介导的信号通路中发挥作用。该基因在多种组织中表达，尤其在发育中的神经系统和免疫系统中表现活跃。研究表明，ITFG1的突变可能导致细胞粘附功能异常，进而影响组织发育和修复过程。某些研究发现ITFG1表达异常与肿瘤转移相关，可能通过影响癌细胞侵袭能力参与肿瘤进展。当ITFG1过表达时，可能增强细胞迁移能力，但同时也可能破坏正常的细胞-基质相互作用；而降低表达则可能导致细胞粘附缺陷，影响组织完整性。ITFG1属于包含FG-GAP结构域的基因家族，该家族成员普遍参与细胞-基质相互作用和信号转导。这个家族的共性在于它们通常作为衔接分子，介导整合素与其他信号分子之间的相互作用，从而调节细胞行为。目前对ITFG1的研究仍在深入，其在神经系统发育、免疫调节和肿瘤发生中的具体机制有待进一步阐明。

None

无

OMIM数据库中对ITFG1基因的介绍     Wikipedia数据库中对ITFG1基因的介绍

基因序列

基因序列

ITFG1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

ITFG1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs6598800       rs9674161       rs11644557       rs11860378       rs12051057       rs12051064       rs12923956       rs16952886       rs16952925       rs17799353       rs62060597       rs71380986       rs73536895       rs74696279       rs76180171       rs77097115       rs78703983      

基因表达

基因表达

ITFG1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAGAGGCAAATGTAGACTTATCTC
59
GTCGTCAGGAATAAATCTATCCCT
60
TATTAGGAGGCCATACCACC
58
AGCACTAACCAGGTCTGAC
59
CTACTGGGAGCTGACAGAC
59
AATGTCCAAGATTCCATCTTCG
59
CAGACTTTGATGGAGATGGAC
59
GATCTCACTAAGTAGATGGTACTC
58
CATGGCATCCAGCATTGAC
60
GTCGTCAGGAATAAATCTGCTG
60
GATTCCCTGCTCCTCTGAG
59
CCTGCTGGTTGAGTTTATGC
60
GAGTGGACTGCAATCATTCC
59
TTTGGCACTCCAACTTCGA
60
GTCCTCGTAAGATAACACCCT
59
CAGATACCCATTTGCATCTACAG
59
GGAGCTGTTATCTTCTGGG
57
GCCATGATAAATTCCCTCCT
58
GCTGCGGGAAAGAAATGAC
60
GAAGGACATCCATTTGAGAATCTC
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

ITFG1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ITFG1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
H3BUJ1 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q8TB96 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
Q8TB96 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 ITFG1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
IGA Glomerulonephritis 0.12 1 0 CTD_human
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Graft-vs-Host Disease 0.000271442 1 0 BeFree
Acute GVH disease 0.000271442 1 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Mammary Neoplasms 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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