ITGB8 (integrin subunit beta 8)

symbol:
ITGB8
locus group:
protein-coding gene
location:
7p21.1
gene_family:
Integrins
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None
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None
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3696
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ENSG00000105855
ucsc gene id:
uc003suu.4
refseq accession:
NM_002214
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HGNC:6163
approved reserved:
1992-10-06
7p21.1
基因染色体位置图

ITGB8(整合素β8)是整合素家族的一员,属于β亚基家族。整合素是一类跨膜受体蛋白,由α和β亚基组成异二聚体,主要介导细胞与细胞外基质(ECM)的黏附以及细胞间的信号传导。ITGB8通常与αv亚基(如αvβ8)结合,形成功能性的整合素受体。该基因在多种组织中表达,尤其在神经系统、血管内皮细胞和某些上皮细胞中较为显著。ITGB8的主要功能是通过激活TGF-β(转化生长因子-β)信号通路来调节细胞增殖、分化和免疫反应。具体来说,αvβ8整合素能够通过结合潜伏态TGF-β并使其活化,从而在组织稳态、免疫调节和血管发育中发挥关键作用。ITGB8的突变或表达异常可能导致多种疾病。例如,ITGB8功能缺失突变与某些神经系统疾病(如脑积水)和血管畸形相关,因为其参与神经和血管的发育调控。此外,ITGB8在肿瘤微环境中也扮演重要角色,其过表达可能促进肿瘤的侵袭和转移,部分原因是它增强了TGF-β的活化,进而促进上皮-间质转化(EMT)和免疫逃逸。相反,ITGB8表达降低可能导致TGF-β信号减弱,影响组织修复和免疫耐受,甚至引发自身免疫性疾病。在基因家族方面,整合素β家族共有8个成员(β1-β8),它们均具有保守的结构域,如胞外域、跨膜区和胞内尾部,能够与不同的α亚基组合形成多种整合素受体。这些整合素在细胞黏附、迁移和信号转导中具有广泛但特异的功能。ITGB8的独特之处在于其专一性地参与TGF-β的活化,而其他β亚基(如β1或β3)更多介导机械性黏附或生长因子信号。研究还发现,ITGB8的表达受多种因素调控,包括炎症因子和机械应力,其异常表达可能影响其他基因(如MMPs或胶原基因)的功能,进而改变ECM的组成和细胞行为。总之,ITGB8是一个多功能基因,其表达水平或活性的变化可能对发育、免疫和疾病进程产生深远影响。

This gene is a member of the integrin beta chain family and encodes a single-pass type I membrane protein with a VWFA domain and four cysteine-rich repeats. This protein noncovalently binds to an alpha subunit to form a heterodimeric integrin complex. In general, integrin complexes mediate cell-cell and cell-extracellular matrix interactions and this complex plays a role in human airway epithelial proliferation. Alternatively spliced variants which encode different protein isoforms have been described; however, not all variants have been fully characterized. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因是整联β链家族的成员,并编码我膜蛋白与VWFA域和四个富半胱氨酸的重复序列的单通型。这种蛋白非共价结合到一个α亚基以形成异二聚体整联复合物。在一般情况下,整联复合物介导的细胞 - 细胞和细胞 - 细胞外基质相互作用和该复合扮演人呼吸道上皮细胞增殖的作用。可变剪接变体,其编码不同蛋白同种型已被描述;然而,并非所有的变体已被充分表征。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

ITGB8基因的碱基序列:[NCBI]
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ITGB8基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs206197       rs206198       rs206199       rs206200       rs206201       rs206202       rs206203       rs206204       rs717861       rs717862       rs727339       rs727340       rs739751       rs739752       rs752474       rs1014038       rs1023522      

ITGB8基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAGGTGAGTGTCAGAAGAC
58
CAAGAAGAGTAGTTCTTGAAGAGG
59
TCTCTGGAAACATAGATACACCAG
60
GCCATCCGATATGACTTTCAC
59
CCATCTGTGCATGTTATAATACCC
60
AATTAGCTTCGGCTCCTGG
60
CTGTGCATGTTATAATACCCAC
57
AAATTAGCTTCGGCTCCTG
58
CAGGTGAGTGTCAGAAGAC
58
AGAAGAGTAGTTCTTGAAGAGG
57
CATTGGTATAAGGATCTTCTACCC
58
ATTATTGAGGTTTGCAGCCT
58
GTGCATGTTATAATACCCACTG
57
AAATTAGCTTCGGCTCCTG
58
CAGGTGAGTGTCAGAAGAC
58
GAAGAGTAGTTCTTGAAGAGGA
57
GATCTCTGGAAACATAGATACACC
59
CATCCGATATGACTTTCACAGAC
59
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
ATF2
ITGB8
Unknown
JUN
ITGB8
Unknown

ITGB8基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ITGB8基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0001573
P26012 (UniProtKB)
IEA
GO:0004872
P26012 (UniProtKB)
IEA
GO:0005102
P26012 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
P26012 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
P26012 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
P26012 (UniProtKB)
TAS
GO:0007155
P26012 (UniProtKB)
TAS
GO:0007229
P26012 (UniProtKB)
IEA
GO:0008305
P26012 (UniProtKB)
TAS
GO:0009986
P26012 (UniProtKB)
IDA
GO:0009986
P26012 (UniProtKB)
IDA
GO:0010628
P26012 (UniProtKB)
IMP
GO:0010629
P26012 (UniProtKB)
IMP
GO:0030198
P26012 (UniProtKB)
TAS
GO:0034686
P26012 (UniProtKB)
IDA
GO:0034686
P26012 (UniProtKB)
IDA
GO:0051216
P26012 (UniProtKB)
IMP
GO:0060674
P26012 (UniProtKB)
TAS
GO:0070062
P26012 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P26012 (UniProtKB)
IDA
GO:1990430
P26012 (UniProtKB)
IDA
GO:0007160
P26012 (UniProtKB)
IMP

可能调控 ITGB8基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Endometriosis 0.12 1 0 CTD_human
Non-Small Cell Lung Carcinoma 0.002367032 1 0 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Arteriovenous Malformations, Cerebral 0.000271442 1 0 BeFree
Biliary Atresia 0.000271442 1 0 BeFree
Idiopathic Pulmonary Fibrosis 0.000271442 1 0 BeFree
Systemic Scleroderma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant Peripheral Nerve Sheath Tumor 0.000271442 1 0 BeFree

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