KCNJ6 (potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 6)

symbol:
KCNJ6
locus group:
protein-coding gene
location:
21q22.13
gene_family:
Potassium channels, inwardly rectifying subfamily J
alias symbol:
Kir3.2|GIRK2|KATP2|BIR1|hiGIRK2
alias name:
G protein-activated inward rectifi…
entrez id:
3763
ensembl gene id:
ENSG00000157542
ucsc gene id:
uc002ywn.2
refseq accession:
NM_002240
hgnc_id:
HGNC:6267
approved reserved:
1995-04-13
21q22.13
基因染色体位置图

KCNJ6(钾电压门控通道亚家族J成员6)属于内向整流钾通道(Kir)基因家族,该家族以调控细胞膜电位和维持静息膜电位为共性。KCNJ6编码G蛋白偶联内向整流钾通道(GIRK2),主要在神经系统和心脏中表达,负责介导乙酰胆碱、多巴胺等神经递质对钾通道的调控,影响神经元兴奋性和心脏节律。其功能特点是允许钾离子内流多于外流,从而抑制细胞兴奋性。主要作用位点包括大脑(如海马、黑质)、心脏窦房结和心房细胞。突变可能导致功能增益或丧失,例如KCNJ6功能丧失突变与Keppen-Lubinsky综合征相关,表现为严重发育迟缓、面部畸形和肌张力障碍;而某些错义突变可能改变通道门控特性,引发心律失常或癫痫。KCNJ6过表达会增强细胞超极化,降低神经元放电频率,可能改善癫痫但导致心动过缓;表达降低则可能引发神经元过度兴奋(如精神分裂症相关)或心脏早搏。该基因与多种疾病相关,包括神经精神疾病(自闭症、成瘾行为)、心律失常(心房颤动)和代谢紊乱。在基因家族中,KCNJ6与KCNJ3/9/12等形成GIRK亚家族,共享四聚体结构和对Gβγ亚基的敏感性,但各成员具有组织特异性分布。

This gene encodes a member of the G protein-coupled inwardly-rectifying potassium channel family of inward rectifier potassium channels. This type of potassium channel allows a greater flow of potassium into the cell than out of it. These proteins modulate many physiological processes, including heart rate in cardiac cells and circuit activity in neuronal cells, through G-protein coupled receptor stimulation. Mutations in this gene are associated with Keppen-Lubinsky Syndrome, a rare condition characterized by severe developmental delay, facial dysmorphism, and intellectual disability. [provided by RefSeq, Apr 2015]

该基??因编码的G蛋白偶合向内整流内向整流钾离子通道的钾离子通道家族的一个成员。这种类型的钾通道允许钾更大流入比出它的细胞。这些蛋白调节许多生理过程,包括在心脏细胞心脏速率和电路的活性在神经细胞中,通过G蛋白偶联型受体的刺激。在这个基因的突变与克片,Lubinsky综合症,一种罕见的疾病特点是严重的发育迟缓,面部畸形和智力障碍有关。 [由RefSeq的,2015年4月提供]

KCNJ6基因的碱基序列:[NCBI]
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KCNJ6基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs3392       rs702858       rs702859       rs702860       rs702861       rs702862       rs702863       rs702864       rs702865       rs702866       rs711996       rs717859       rs721014       rs721279       rs722557       rs724491       rs724492      

KCNJ6基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ACAGAATCCATGACTAACGTC
58
AACTTTGGCTGGTGAATGG
59
CAGAATCCATGACTAACGTCC
59
AACTTTGGCTGGTGAATGG
59
AGAATCCATGACTAACGTCCT
59
AACTTTGGCTGGTGAATGG
59
      尚未收录相关数据

KCNJ6基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

KCNJ6基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005242
P48051 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
P48051 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P48051 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P48051 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P48051 (UniProtKB)
IPI
GO:0005794
P48051 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
P48051 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
P48051 (UniProtKB)
TAS
GO:0006813
P48051 (UniProtKB)
TAS
GO:0008076
P48051 (UniProtKB)
TAS
GO:0010107
P48051 (UniProtKB)
IBA
GO:0015467
P48051 (UniProtKB)
TAS
GO:0034765
P48051 (UniProtKB)
IEA

可能调控 KCNJ6基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
KEPPEN-LUBINSKY SYNDROME 0.360271442 1 2 BeFree_CLINVAR_ORPHANET_UNIPROT
Down Syndrome 0.125720142 4 0 BeFree_CTD_human_LHGDN
Nerve Degeneration 0.12 1 0 CTD_human
Muscle Weakness 0.12 1 0 CTD_human
Glycogen Storage Disease Type IV 0.00272435 1 0 LHGDN
Lung Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Thyroid Nodule 0.00272435 1 0 LHGDN
Hyperparathyroidism, Secondary 0.002367032 1 0 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Bipolar Disorder 0.002367032 1 0 GAD

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