KRT19 (keratin 19)

symbol:
KRT19
locus group:
protein-coding gene
location:
17q21.2
gene_family:
Keratins, type I
alias symbol:
K19|CK19|K1CS|MGC15366
alias name:
keratin, type I cytoskeletal 19|ke…
entrez id:
3880
ensembl gene id:
ENSG00000171345
ucsc gene id:
uc002hxd.5
refseq accession:
NM_002276
hgnc_id:
HGNC:6436
approved reserved:
1988-05-11
17q21.2
基因染色体位置图

KRT19(角蛋白19)是一种属于角蛋白基因家族的成员,该家族是中间丝蛋白的重要组成部分,主要在上皮细胞中表达,负责维持细胞的结构完整性和机械强度。KRT19是一种I型酸性角蛋白,分子量较小(约40 kDa),通常与II型碱性角蛋白(如KRT8或KRT18)配对形成异二聚体,进一步组装成中间丝网络。它在多种上皮组织中表达,包括单层上皮(如肝细胞、胰腺导管细胞)和某些复层上皮的基底细胞层。KRT19在细胞分化、迁移和信号传导中发挥重要作用,并参与细胞应激响应。KRT19的突变可能导致角蛋白相关疾病,如角蛋白病,表现为皮肤脆弱或肝脏疾病。此外,KRT19的表达异常与多种癌症相关,例如乳腺癌、结肠癌和肝癌,其过表达常被视为肿瘤标志物,可能与肿瘤侵袭、转移和不良预后相关。降低KRT19表达可能影响上皮细胞的机械稳定性和伤口愈合能力。KRT19属于角蛋白基因家族,该家族包含54个成员,分为I型(酸性)和II型(碱性)角蛋白,它们共同特点是形成中间丝,为细胞提供结构支持并参与细胞应激保护。KRT19因其在循环肿瘤细胞(CTCs)检测中的应用而受到关注,是液体活检中的重要标志物之一。

The protein encoded by this gene is a member of the keratin family. The keratins are intermediate filament proteins responsible for the structural integrity of epithelial cells and are subdivided into cytokeratins and hair keratins. The type I cytokeratins consist of acidic proteins which are arranged in pairs of heterotypic keratin chains. Unlike its related family members, this smallest known acidic cytokeratin is not paired with a basic cytokeratin in epithelial cells. It is specifically expressed in the periderm, the transiently superficial layer that envelopes the developing epidermis. The type I cytokeratins are clustered in a region of chromosome 17q12-q21. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白质是角蛋白家族的一个成员。所述角蛋白是负责上皮细胞的结构完整性中间丝蛋白和被细分为细胞角蛋白和头发角蛋白。 I型角蛋白包括被布置成对异型角蛋白链的酸性蛋白质。不像它相关家族成员,这个最小的已知的酸性细胞角蛋白不与在上皮细胞中的基本细胞角蛋白配对。它是在周皮的瞬时表面层的信封显影表皮特异性表达。 I型角蛋白聚集在染色体17q12-Q21的一个区域。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

KRT19基因的碱基序列:[NCBI]
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KRT19基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1049547       rs1049551       rs1049558       rs1049559       rs1869719       rs2016199       rs56973674       rs78344415       rs116184262       rs117306400       rs117356140       rs138382069       rs139245805       rs139350359       rs140130892       rs141241260       rs144149113      

KRT19基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGAGAACTCCAGGATTGTCC
59
TGTTCCGTCTCAAACTTGGT
60
GCGAAGCCAATATGAGGTC
59
TTCAATTCTTCAGTCCGGCT
60
AACCATGAGGAGGAAATCAG
57
CATGTCACTCAGGATCTTGG
58
AAGGTTTGAGACGGAACAG
58
TACTGATTTCCTCCTCATGGT
58
TGCGAAGCCAATATGAGGT
60
TCAATTCTTCAGTCCGGCT
59
AAAGGTTTGAGACGGAACAG
59
ACTGATTTCCTCCTCATGGT
59
TTGAGAACTCCAGGATTGTC
57
GTTCCGTCTCAAACTTGGT
58
GAACCATGAGGAGGAAATCAG
59
TGTCACTCAGGATCTTGGC
59
CACCATTGAGAACTCCAGG
58
GTCTCAAACTTGGTTCGGA
58
AAGGTTTGAGACGGAACAG
58
ACTGATTTCCTCCTCATGGT
59
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
ESR1
KRT19
Activation
KLF4
KRT19
Activation
SP1
KRT19
Activation

KRT19基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

KRT19基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005198
C9JM50 (UniProtKB)
IEA
GO:0005882
C9JM50 (UniProtKB)
IEA
GO:0005198
K7EMS3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005882
K7EMS3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005200
P08727 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
P08727 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P08727 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P08727 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P08727 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P08727 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
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IPI
GO:0005515
P08727 (UniProtKB)
IPI
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P08727 (UniProtKB)
IPI
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P08727 (UniProtKB)
IPI
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IPI
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IPI
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IPI
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IPI
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IPI
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IPI
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IPI
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IPI
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P08727 (UniProtKB)
IPI
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P08727 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P08727 (UniProtKB)
IPI
GO:0005882
P08727 (UniProtKB)
IEA
GO:0005882
P08727 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
P08727 (UniProtKB)
IDA
GO:0007219
P08727 (UniProtKB)
IEA
GO:0008307
P08727 (UniProtKB)
IDA
GO:0016010
P08727 (UniProtKB)
IEA
GO:0016032
P08727 (UniProtKB)
IEA
GO:0030018
P08727 (UniProtKB)
IEA
GO:0032403
P08727 (UniProtKB)
IEA
GO:0042383
P08727 (UniProtKB)
IEA
GO:0043034
P08727 (UniProtKB)
IDA
GO:0043627
P08727 (UniProtKB)
IEP
GO:0045214
P08727 (UniProtKB)
IDA
GO:0060706
P08727 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
P08727 (UniProtKB)
IDA
GO:0071944
P08727 (UniProtKB)
IDA
GO:1990357
P08727 (UniProtKB)
IEA

可能调控 KRT19基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Hepatitis, Chronic 0.120542884 3 0 BeFree_CTD_human
Squamous cell carcinoma of esophagus 0.120271442 2 0 BeFree_CTD_human
Asthma 0.120271442 2 1 BeFree_CTD_human
Copper-Overload Cirrhosis 0.12 1 0 CTD_human
Neoplasm Invasiveness 0.12 1 0 CTD_human
Neoplastic Cell Transformation 0.12 1 0 CTD_human
Malignant neoplasm of breast 0.02171535 80 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.02171535 80 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.014667793 45 0 BeFree_LHGDN
Liver carcinoma 0.012516121 18 0 BeFree_LHGDN

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