KRT79 (keratin 79)

symbol:
KRT79
locus group:
protein-coding gene
location:
12q13.13
gene_family:
Keratins, type II
alias symbol:
K6L|KRT6L
alias name:
keratin 6-like
entrez id:
338785
ensembl gene id:
ENSG00000185640
ucsc gene id:
uc001sbb.4
refseq accession:
NM_175834
hgnc_id:
HGNC:28930
approved reserved:
2007-07-03
12q13.13
基因染色体位置图

KRT79属于角蛋白基因家族(Keratin gene family),该家族编码中间纤维蛋白,主要在上皮细胞中表达,构成细胞骨架的重要结构成分,提供机械强度和细胞完整性。KRT79编码的角蛋白79是一种II型角蛋白,通常与特定的I型角蛋白配对形成异二聚体,共同组装成中间纤维网络。KRT79主要在皮肤、毛发和指甲等角质化组织中表达,参与维持这些组织的结构和功能。KRT79的突变可能导致角蛋白纤维组装异常,影响上皮细胞的稳定性,进而引发皮肤脆弱性疾病,如大疱性表皮松解症或角化异常症。KRT79过表达可能与某些皮肤增生性疾病或肿瘤相关,因为异常的角蛋白表达可能干扰细胞周期和分化。相反,KRT79表达降低可能导致上皮屏障功能受损,增加皮肤对机械损伤或感染的敏感性。角蛋白基因家族的共性包括编码结构蛋白、形成中间纤维、参与细胞机械支持和信号转导,并在组织特异性中发挥关键作用。KRT79与其他角蛋白基因在序列和功能上具有高度保守性,但其表达模式和组织分布可能具有独特性。研究KRT79有助于理解上皮组织疾病的分子机制,并为相关治疗提供潜在靶点。

Keratins are intermediate filament proteins responsible for the structural integrity of epithelial cells and are subdivided into epithelial keratins and hair keratins. This gene encodes an epithelial keratin that is expressed in skeletal muscle, skin and scalp. The type II keratins are clustered in a region of chromosome 12q13.[provided by RefSeq, Jun 2009]

角蛋白是负责上皮细胞的结构完整性中间丝蛋白和被细分成上皮角蛋白和头发角蛋白。这个基因编码的骨骼肌,皮肤和头皮表示的上皮角质。 II型角蛋白在12q13染色体区域聚集。[由RefSeq的,2009年06月提供]

KRT79基因的碱基序列:[NCBI]
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KRT79基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs876407       rs2256838       rs2363622       rs2638496       rs2638497       rs2638498       rs2638499       rs2638500       rs2638501       rs2638502       rs2682287       rs2682288       rs2682289       rs2682290       rs2682291       rs4415849       rs7309587      

KRT79基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTGATGAATGTCAAGCTGGC
60
CTCCAGACATCCTGCTCTC
59
TGATGAATGTCAAGCTGGC
59
CTCCAGACATCCTGCTCTC
59
GATGAATGTCAAGCTGGCC
59
CTCCAGACATCCTGCTCTC
59
      尚未收录相关数据

KRT79基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

KRT79基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005198
H0YID6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005882
H0YID6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005198
Q5XKE5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q5XKE5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q5XKE5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q5XKE5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q5XKE5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q5XKE5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q5XKE5 (UniProtKB)
IPI
GO:0019899
Q5XKE5 (UniProtKB)
IPI
GO:0045095
Q5XKE5 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
Q5XKE5 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q5XKE5 (UniProtKB)
IDA

可能调控 KRT79基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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