KRT80 (keratin 80)

symbol:
KRT80
locus group:
protein-coding gene
location:
12q13.13
gene_family:
Keratins, type II
alias symbol:
KB20
alias name:
None
entrez id:
144501
ensembl gene id:
ENSG00000167767
ucsc gene id:
uc001rzx.3
refseq accession:
NM_182507
hgnc_id:
HGNC:27056
approved reserved:
2006-07-17
12q13.13
基因染色体位置图

KRT80(角蛋白80)属于角蛋白基因家族,是一种中间纤维蛋白,主要在上皮细胞中表达,参与细胞骨架的构建,维持细胞形态和机械强度。KRT80与其家族成员(如KRT8、KRT18等)共同形成异源二聚体,为上皮组织提供结构支持,并参与细胞迁移、信号传导和应激反应。角蛋白家族的共性在于它们具有高度保守的α-螺旋杆状结构域,两端为非螺旋的头尾结构域,通过二聚化和多聚化形成稳定的纤维网络。KRT80在多种上皮组织中表达,尤其在胃肠道、呼吸道和泌尿生殖道中较为丰富。KRT80的突变可能导致细胞骨架稳定性下降,影响上皮组织的完整性,与某些上皮源性肿瘤(如结直肠癌、胃癌)的发生发展相关。研究表明,KRT80的过表达可能促进肿瘤细胞的侵袭和转移,因其参与上皮-间质转化(EMT)过程,增强细胞迁移能力;而降低表达可能导致上皮屏障功能受损,增加组织对损伤或炎症的敏感性。此外,KRT80的表达水平变化可能影响其他角蛋白家族成员的表达或功能,破坏细胞骨架的动态平衡。在疾病方面,KRT80的异常表达与肿瘤预后不良相关,可能作为潜在的生物标志物或治疗靶点。

Keratins are intermediate filament proteins responsible for the structural integrity of epithelial cells and are subdivided into epithelial keratins and hair keratins. This gene's expression profile shows that it encodes a type II epithelial keratin, although structurally the encoded protein is more like a type II hair keratin. This protein is involved in cell differentiation, localizing near desmosomal plaques in earlier stages of differentiation but then dispersing throughout the cytoplasm in terminally differentiating cells. The type II keratins are clustered in a region of chromosome 12q13. Two transcript variants encoding two different fully functional isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, Oct 2010]

角蛋白是负责上皮细胞的结构完整性中间丝蛋白和被细分成上皮角蛋白和头发角蛋白。该基因的表达谱表明,它编码II型上皮角蛋白,尽管在结构上所编码的蛋白质是更像II型毛发角蛋白。这种蛋白质是参与细胞分化,邻近桥粒斑定位在分化的早期阶段,但然后在整个细胞质中末端分化细胞分散。 II型角蛋白聚集在12q13染色体区域。两个转录变异体的编码两个不同的功能齐全的亚型已经发现了这种基因。[由RefSeq的,2010年10月提供]

KRT80基因的碱基序列:[NCBI]
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KRT80基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs751353       rs936330       rs1574267       rs1574409       rs2076875       rs2085502       rs2277387       rs2360653       rs2360654       rs3741736       rs3741737       rs3759196       rs3803081       rs3832838       rs4762058       rs4762059       rs4762060      

KRT80基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CGAATCAGGTATGAGGATGAG
58
TGAAGACACTCTGCATCCA
59
GAGTTTCGAATCAGGTATGAGG
59
AGGCTACCTTCTTCAGCTG
59
TCGAATCAGGTATGAGGATGAG
59
AAGACACTCTGCATCCAGG
59
AGTTTCGAATCAGGTATGAGGA
59
CAGGCTACCTTCTTCAGCT
59
CGAATCAGGTATGAGGATGAG
58
GAAGACACTCTGCATCCAG
58
AGTTTCGAATCAGGTATGAGGA
59
AGGCTACCTTCTTCAGCTG
59
      尚未收录相关数据

KRT80基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

KRT80基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005198
Q6KB66 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q6KB66 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q6KB66 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q6KB66 (UniProtKB)
IPI
GO:0005737
Q6KB66 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q6KB66 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q6KB66 (UniProtKB)
IDA
GO:0005882
Q6KB66 (UniProtKB)
IDA
GO:0045095
Q6KB66 (UniProtKB)
IEA
GO:0030057
Q6KB66 (UniProtKB)
IDA

可能调控 KRT80基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Hyperkeratosis, Epidermolytic 0.001357209 5 0 BeFree
Epidermolytic palmoplantar keratoderma of Vorner 0.001357209 5 0 BeFree
Monilethrix 0.001085767 4 0 BeFree
Pachyonychia Congenita 0.000814326 3 0 BeFree
Ichthyosis Bullosa of Siemens 0.000542884 2 0 BeFree
Irritable Bowel Syndrome 0.000271442 1 0 BeFree
Hair Diseases 0.000271442 1 0 BeFree
Epidermolysis Bullosa Simplex 0.000271442 1 0 BeFree
Palmoplantar Keratosis 0.000271442 1 0 BeFree

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