LBX1 (ladybird homeobox 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
LBX1
locus group:
protein-coding gene
location:
10q24.32
gene_family:
NKL subclass homeoboxes and pseudogenes
alias symbol:
LBX1H|HPX6
alias name:
None
entrez id:
10660
ensembl gene id:
ENSG00000138136
ucsc gene id:
uc001ksx.4
refseq accession:
NM_006562
hgnc_id:
HGNC:16960
approved reserved:
2005-04-28

基因染色体位置

基因染色体位置

10q24.32
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

LBX1（Ladybird homeobox 1）是一个编码转录因子的基因，属于LBX基因家族，该家族的特征是含有高度保守的同源异型盒（homeobox）结构域，能够结合DNA并调控其他基因的表达。LBX1主要在胚胎发育过程中发挥作用，特别是在神经系统的形成和肌肉组织的模式化中起关键作用。它参与调控神经嵴细胞的迁移和分化，影响脊髓和周围神经系统的发育。LBX1的表达产物是一种蛋白质，能够通过结合特定DNA序列激活或抑制下游基因的转录，从而影响细胞命运决定和组织发育。 LBX1的突变可能导致其功能异常，进而引发发育缺陷。例如，某些研究发现LBX1的突变与先天性脊柱侧凸（congenital scoliosis）有关，这可能是因为其影响了脊柱和神经系统的正常发育。此外，LBX1的表达异常还可能与其他肌肉或神经系统疾病相关，但具体机制仍在研究中。 如果LBX1过表达，可能会干扰正常的细胞分化过程，导致发育异常或组织畸形。例如，在动物模型中，LBX1的过度表达可能引起肌肉或神经系统的发育紊乱。相反，如果LBX1表达降低或缺失，可能会导致神经嵴细胞迁移障碍或肌肉发育缺陷，进而影响胚胎的正常生长。 LBX1属于LBX基因家族，该家族的成员通常参与胚胎发育和细胞命运调控，特别是在肌肉和神经系统的模式化中发挥重要作用。家族成员的共性包括含有同源异型盒结构域，能够结合DNA并调控基因表达，同时在进化上高度保守。 目前，关于LBX1的研究仍在深入，其在疾病中的作用机制尚未完全阐明，但它在发育生物学和医学领域具有重要的研究价值。

This gene and the orthologous mouse gene were found by their homology to the Drosophila lady bird early and late homeobox genes. In the mouse, this gene is a key regulator of muscle precursor cell migration and is required for the acquisition of dorsal identities of forelimb muscles. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因与同??源小鼠基因被其同源的果蝇夫人伯德早期和晚期的同源基因中。在小鼠中，该基因是肌前体细胞迁移的关键调节，并且需要用于购置前肢肌肉背侧身份。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对LBX1基因的介绍     Wikipedia数据库中对LBX1基因的介绍

基因序列

基因序列

LBX1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

LBX1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs941909       rs1322330       rs3758578       rs7922938       rs34835363       rs35448615       rs74861158       rs77206049       rs78030099       rs78320492       rs111563614       rs113189218       rs113363054       rs114546820       rs114861709       rs115201730       rs115460166      

基因表达

基因表达

LBX1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GCCAGCAAGACGTTTAAGG
59
CAAAGATGGTCATACCGTCG
58
CCAGCAAGACGTTTAAGGG
58
CAAAGATGGTCATACCGTCG
58
CCAGCAAGACGTTTAAGGG
58
AAAGATGGTCATACCGTCG
57

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

LBX1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LBX1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0001947
P52954 (UniProtKB)
IEA
GO:0003700
P52954 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
P52954 (UniProtKB)
IEA
GO:0005667
P52954 (UniProtKB)
IEA
GO:0006351
P52954 (UniProtKB)
IEA
GO:0007517
P52954 (UniProtKB)
IEA
GO:0008285
P52954 (UniProtKB)
IEA
GO:0009653
P52954 (UniProtKB)
TAS
GO:0021522
P52954 (UniProtKB)
IEA
GO:0021920
P52954 (UniProtKB)
IEA
GO:0043565
P52954 (UniProtKB)
IEA
GO:0045665
P52954 (UniProtKB)
IEA
GO:0048664
P52954 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 LBX1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Mammary Neoplasms 0.120271442 2 0 BeFree_CTD_human
Carcinogenesis 0.009229024 34 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.00434307 16 0 BeFree
Leukemia, Myelocytic, Acute 0.004071628 15 0 BeFree
Precursor T-Cell Lymphoblastic Leukemia-Lymphoma 0.004071628 15 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.003800186 14 0 BeFree
leukemia 0.003257302 12 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.002985861 11 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.002985861 11 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.002714419 10 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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