LCN10 (lipocalin 10)

symbol:
LCN10
locus group:
protein-coding gene
location:
9q34.3
gene_family:
Lipocalins
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
414332
ensembl gene id:
ENSG00000187922
ucsc gene id:
uc004civ.4
refseq accession:
NM_001001712
hgnc_id:
HGNC:20892
approved reserved:
2005-01-11
9q34.3
基因染色体位置图

LCN10(Lipocalin 10)属于脂质运载蛋白(Lipocalin)基因家族,该家族是一类广泛存在于生物体中的小分子分泌蛋白,主要功能是结合和运输疏水性分子(如类固醇、脂类、维生素等),并参与免疫调节、细胞信号传导和代谢调控。LCN10与其他脂质运载蛋白家族成员(如LCN2、RBP4)具有相似的结构特征,包括典型的β-桶状结构域,能够特异性结合小分子配体。LCN10在多种组织中表达,尤其在生殖系统(如睾丸和附睾)中表达较高,可能参与精子成熟和生育功能的调控。研究表明,LCN10可能通过与特定脂质或激素结合,影响生殖细胞的微环境或信号通路。若LCN10发生突变,可能导致其结合能力下降或功能异常,进而影响生殖健康,例如与男性不育症相关。此外,LCN10的异常表达(如过表达)可能干扰其他脂质运载蛋白的功能平衡,影响代谢或炎症反应;而表达降低则可能导致配体运输障碍,影响相关组织的正常生理功能。目前关于LCN10的研究相对较少,但其在生殖生物学和疾病中的潜在作用正逐渐受到关注。脂质运载蛋白家族的共性包括分子量较小(通常20-30 kDa)、高度保守的结构域以及多功能的配体结合特性,使其在代谢、免疫和细胞保护中发挥重要作用。未来研究需进一步揭示LCN10的具体作用机制及其与疾病的关联。

Members of the lipocalin family, such as LCN10, have a common structure consisting of an 8-stranded antiparallel beta-barrel that forms a cup-shaped ligand-binding pocket or calyx. Lipocalins generally bind small hydrophobic ligands and transport them to specific cells (Suzuki et al., 2004 [PubMed 15363845]).[supplied by OMIM, Aug 2009]

的脂笼蛋白家族,如LCN10成员,具有由形成一个杯形配体结合口袋或花萼8链反平行β桶的共同的结构。脂质运载蛋白通常结合小的疏水性配体和其运送到特定细胞(Suzuki等人,2004 [搜索PubMed 15363845])。[由OMIM,2009年08月供给]

LCN10基因的碱基序列:[NCBI]
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LCN10基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2811724       rs7848644       rs45546340       rs59473913       rs59623285       rs62582223       rs73554083       rs73554086       rs73668367       rs74950015       rs76435027       rs77542837       rs117357362       rs139267443       rs140340180       rs145403178       rs145855725      

LCN10基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGGTACATTCTGGCCACTG
60
ATTCTGCCTATCGTCTGAAGG
60
TAAAGGTGAACAAAGTGGGC
59
TGTAGTCAGTGGACAGCAC
59
CCACTGACTACAGCTACGG
60
TCTGCCTATGGAAGAGCAG
59
CCACTGACTACAGCTACGG
59
TCTGCCTATGGAAGAGCAG
58
GACAGGAGGGAGTGAAAGG
59
TGGAAGCTCGAAACATTCTG
59
CCACTGACTACAGCTACGG
60
TCTGCCTATGGAAGAGCAG
59
TGGAACAAGGGACAAGAGG
59
AGCTCGAAACATTCTGCCT
60
GACAGGAGGGAGTGAAAGG
59
TGGAAGCTCGAAACATTCTG
59
AGGAAAGACGGGAAGAAGC
60
ATTCTGCCTATCTCCCTCCT
60
AGGAAAGACGGGAAGAAGC
60
TTCTGCCTATCTCCCTCCT
59
      尚未收录相关数据

LCN10基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LCN10基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005576
Q6JVE6 (UniProtKB)
IEA
GO:0006810
Q6JVE6 (UniProtKB)
IEA

可能调控 LCN10基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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